電腦搜索生物化學的橫向查找記憶體切換
切換是日常生活的部份, 從打瞌睡您的預警, 打開咖啡壺, 射擊您的汽車引擎, 等等直到我們關閉光在晚上。研究員比我們使用在我們的day.Naren Ramakrishnan, 關聯電腦科學教授在弗吉尼亞技術, 美國, 和Upinder S. Bhalla 過程中, 在全國中心為生物科學(現在編目了可能的切換更加模板在一個活細胞之內NCBS), 一部分的根本研究Tata 學院在印度, 被發現電池可能利用千位切換支持重要生物功能。
電池用途切換為確定什麼樣的電池成為- 皮膚或血液, 例如, 在回應重音, 和在與其它電池的通信。“A 切換是像記憶體部件, ” 前述Bhalla 。切換的“The 狀態— 是否它或關閉, 是像可能存儲一點0 或1 的電腦存儲器。雖然真正的生物切換是相當複雜和調控用許多方式, 我們顯示了切換能work” 的最簡單的可能的方式用;, Bhalla 認為。
研究員報告他們的工作在科學(PLoS) 計算生物 公立圖書館的6月20 日問題, 在條款“Memory 切換在化學反應Space.” 他們的協作開始了在一次sabbatical 訪問期間由Ramakrishnan 對NCBS 在班格洛, 印度。Ramakrishnan 是專門技術是在數字模擬和資料採集的電腦學家。Bhalla 是一位計算神經科學家以寬廣的利息在生物化學的網路塑造和模擬。他們決定使用弗吉尼亞Tech’s 系統x 巨型電腦尋找電池可能實施切換的許多方式用。
“Our 探險使用系統x 是寧可像怎樣熔補或孩子彙集事看如果他們做有用事。我們採取了很多’spare parts’, 各個備件是一個化學反應, 一起被連接他們每方式, 和我們發現這些人為地被修建的網路的一個驚奇編號實際上是切換, ” 前述Ramakrishnan 。
“Popular 觀點□去□常是, 有切換可能由生物體會, 但我們查找千位切換在我們的搜索, ” 的很小數量的方式用; Ramakrishnan 認為。
研究員報告在 PLoS 計算生物、 “We 查找幾乎4,500 回應拓撲結構, 或大約我們的被測試的配置的百分之10, 展示開關behavior.”
他們的研究並且導致了全面“map” 生物化學的切換。映射更加進一步顯露, 大多切換形成“family” - 即, 切換全部與互相有關。“This 有重要涵義因為它建議怎麼演變也許絆倒在切換寧可easily.” Ramakrishnan 認為。
“Of 路線, 那裡是更多對電池比切換, ” Bhalla 認為。“But 開關和記憶體是最基本的工作情況可能。用切換我們的目錄武裝, 我們能現在進行調查更加有趣的工作情況像複雜資訊processing.”