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#1 (permalink)

07-12-2008, 下午12:30

rob86

吸移管補白

連接日期: 2008 年7月

過帳: 1

GSTP1 promotor - 空泛的產品

你好,

我有有PCR 產品的長度的解釋的一個問題。模板DNA 順序(人的GSTP1 promotor 的) 長度是關於1650bp 和一個主要PCR 產品的長度是在700-800bp 之間。在silico PCRs 顯示, 產品應該是特定。離子情況(鎂), PCR 階段的溫度和時間被更改了在相對地大範圍。結果總是相同。

但是, 當正確的(反向) 底漆被選擇給一個更短的產品, 大約1500 年, 比結果是正確的。

我們並且使用mfold 模擬如果模板順序能創建一些非常穩定結構。為平均數情況1.5mM 毫克和50mM Na 在高溫95.C 那裡可能存在一個強的詞根循環在這個區域1570-1590bp 的但它仍然不解釋產品長度在範圍700-800bp 。

您有一些觀點, 建議有用解決這個問題嗎?

感謝任何幫助!

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