Bioinformatics, ¨óij, DNA ®Ö¿}®Ö»Ä³J¥Õ½èProteomics

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¦b ¨BÆJ4, µv¤ÆÅÖºû¯À½¤¥Ñ¹ï°ª·Å«×ªº¼ÉÅS¯M¯N(±q60 ¨ì100 .C) ¡C¥§Às½¤¼ÉÅS©óµµ¥~¿ç®g¡C³o¨Ç¨BÆJ¨Ï¥Î«OÃÒDNA ªº¥Ã¤[©Ê©M¦@»ù¥æÁä·í«e¦b½d³ò¹ï½¤¡C

¦b ¨BÆJ5, ½¤¼ÉÅS©ó¤@®Úradiolabeled ±´°w¡C³o®Ú±´°w¬O¦³±zªº¶¶§Ç§Q¯q±z·Q­nÀË´úªº¤@­Ó°ß¤@ÀÁ²LªºDNA ¤ù¬q¡C³o®Ú±´°w³Q¹å¤Æ»P½¤©M³Q¤¹³\Âø¥æ»PDNA ¦b½¤¡C±´°w³q±`radiolabeled ¥H«K¥L­Ì¯à³QÀË´ú¦b¼v¤ù, µM¦Ó¬O«D©ñ®g©ÊªºÄ´¦p¿Ã¥ú©Î²£¦â¯À¬V®Æªº§ó¥[·s«Øªº±´°w¨Ã¥B³Q¨Ï¥Î¡C¦bÂø¥æ¥H«á, ¶WÃB¥¼®¹¸jªº±´°w¨R¨«±q½¤, Â÷¶}¯S©w¤@©w±´°w¡C

¦b ¨BÆJ6, Âø¥æªº¼Ò¦¡¥Ñ§Î¶H¤ÆÀË´ú¦bX¥ú¤ù¥Ñ¦Û°Ê®g½u·Ó¹³³N¦b¤@®Ú©ñ®g©Ê©Î¿Ã¥ú±´°w±¡ªp¤U, ©Î¥ÑÃC¦âªºµo®i¦b½¤¦pªG¤@­Ó²£¦â¯À±´ª¾¤èªk³Q¹B¥Î¡C

 

(ªþµù¬°¨BÆJ3: ¦pªG¤jDNA ¤ù¬q¬O¦s¦b¤j©ó15 kb ¦b½d³ò¤]³\¬Odepurinated ¨º®Éµ}ÄÀHCl »Ä¦b§Ëż«e±N¤¤Â_DNA §ó¤pªº¤ùÂ_, ¦p¦¹¤¹³\±q½¦¾®Å骺§ó¥[°ª®Ä²vªº½Õ¥Î¨ì½¤¡C¦pªGÆP©Ê½Õ¥Î¤èªk³Q¨Ï¥Î, DNA ½¦¾®Åé³Q¦w¸m¤J¤@­ÓÆP©Ê¸Ñ¨M¤èªk(¨å«¬¦a¥]§t+®ñ¤Æ¶u) «Ù½èdouble-stranded DNA ¡CÅܩʦb¤@­ÓÆP©ÊÀô¹Ò¸Ì´£¨Ñnegatively-charged DNA ªº§ïµ½ªº®¹¸j¹ï¤@­Ópositively-charged ½¤, ¤ÀÂ÷¥¦¤J°ß¤@DNA ¤l½u¬°³Ì·sÂø¥æ¹ï±´°w(°Ñ¨£¤U­±), ©M·´Ãa¤]³\¤´µM¬O¦s¦b¦bDNA ªº¥ô¤@´Ý¾lªº®Ö¿}®Ö»Ä¡C

 

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¤ÀÂ÷¦bgenomic ©Î¸É¥þDNA ªº¶¶§Ç©Î¤ù¬q¤@­Ó¹qªa½¦¾®Åé, ¥Ñendonucleases ³¡¤À®ø¤Æ, ¤ù¬q' ³Q§Ëż' ½¤©MµM«á³Q¤¹³\Âø¥æ¥H¯S©w, ³Q¼Ð°O±´°w¬°¤FÀË´ú­þ­Ó½d³ò¥]§t¤ù¬q©Î°ò¦]§Q¯q¡C«n³¡ªº¦¾ÂI¬O¯S§O¦³¥Îªº¦bÀË´ú¤j°ò¦]rearrangements/deletions ©M¤jtrinucleotide ­«½ÆÂX®i¡C

¤@­Ó«n³¡ªº¦¾ÂI¬O¤èªk©w´Á¦a¨Ï¥Î¦b¤À¤l¥Íª«¾ÇÀˬd¤@­ÓDNA ¶¶§Çªº¥X²{¦bDNA ½d¨Ò¡C«n³¡§Ëż»P¤èªkµ²¦Xagarose ½¦¾®Åé¹qªaªk¬°DNA ªº½d³ò¤ÀÂ÷½Õ¥Î½d³ò³Q¤ÀÂ÷ªºDNA ¨ì¸É¥Õ½¤¬°±´°wÂø¥æ¡C¨ä¥¦§Ëżªº¤èªk(§Y, ¦è³¡¦¾ÂI¡B¥_¦¾ÂI, ¦è«n¦¾ÂI) ¨Ï¥Î¬Û¦üªº­ì«h, ¶È¨Ï¥Î®Ö¿}®Ö»Ä©Î³J¥Õ½è, ¥H«á³Q©R¦W¤F±oÃö©ó«n³¡ªº¦W¦r¡C¦]¬°§Þ³N¥Ñ¦¹±o¦W³Q©R¦W¤F, «n³¡ªº¦¾ÂIÀ³¸Ó¤j¼g, ¦ý¬O¥_©M¦è³¡¦¾ÂI¤£À³¸Ó¡C

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¦¾ÂI¬O½Õ¥ÎDNA ©M®Ö¿}®Ö»Ä³J¥Õ½èªº§Þ³N©Ó¹B¤H¦]¦¹¥L­Ì¥i¯à³Q¤ÀÂ÷, ©M¸g±`¸òÀH¹ï½¦¾®Åé¹qªaªkªº¥Î³~¡C«n³¡ªº¦¾ÂI³Q¨Ï¥Î¬°½Õ¥ÎDNA ¡C

 

±´°wªºÂø¥æ¹ï¤@­Ó¯S©wDNA ¤ù¬q¦b¸É¥Õ½¤ªí©ú, ³o­Ó¤ù¬q¥]§t¬O¸É¥þ¹ï±´°wªºDNA ¶¶§Ç¡C

«n³¡ªº¦¾ÂI¤èªkªº¥Ó½Ð

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°µ1 ¤½¤É20X SSC ½w½Ä, ²K¥[¥H¤U:

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  2. «Ù½è½¦¾®Åé30 ¤ÀÄÁ¦bRT («ÇÁ{®É), ¾_°Ê, »P0.5 M NaOH, 1.5 M NaCl
  3. ¨R¬~¥HH2.O 2x-3x ®É¶¡
  4. ¤¤¥ß¤Æ: 30 mins., RT, ¾_°Ê
  5. ·í¤¤¥ß¤Æ, ³Q°Å¤Áªº½¤¾A¦X½¦¾®Åé, °Å¤Á¤F3mm ¯È(3-4 ªO®Æ) ¹ï½¦¾®Å骺½d³ò, ¾A·íªº½d³ò¤ò¤y¯È¬°§Ëż°µ·Ç³Æ¡C
  6. ³]¸m§Ëż: 3mm ¯È2 ¶ô¼h§@¬°¿Oªä¤J20X SSC ¡C½¦¾®Åé¦b¿Oªä³»³¡, ¥h°£¥ô¤@­ÓbubblesPre ³Q§ËÀ㪺½¤(¦b2xSSC) ¦b½¦¾®Åé³»³¡
  7. 3mm ¯È¦b½¤, ¤ò¤y¯È³»³¡¦b3mm ¯È³»³¡¡C500g ­«¶q¦b¤ò¤y¯È³»³¡¡C
  8. 6-18 ®É¼Æ§Ëż
  9. «Å´­°®Àê¸É¥Õ, µµ¥~·ÓÄ£3.5 ¤ÀÄÁ
  10. ¬~º°¸É¥Õ¦b¼öªº2x SSC 0.1 % SDS ¨â¦¸

±Æ¿ù©M°ÝÃD? ¬Ý¨£DNAse Footprinting ½×¾Â!

¬°°ÝÃD©M±Æ¿ù«n³¡§Ëż, ±i¶K·s«Ø½uµ{¼Æ°Q½×¥¦¦b «n³¡ªº§Ëżªº½×¾Â!

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DNA §J¶©«ü«n

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­­¨î»Ã¯À®ø¤Æ - ©Ò¦³±z»Ý­nª¾¹D!

Genomic DNA ¹jÂ÷¨óij

Baceteria DNA ¹jÂ÷

§ë¼Ð¡B±ÄÁÊ©M½æ¥X¦beBay §K³dÁn©ú/ªA°È±ø´Ú & Áô¨pÅv¬Fµ¦& ©2005-2007 ¤À¤lStation.com, ª©Åv©Ò¦³¡C

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