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AACompIdent - http://www.expasy.org/tools/aacomp/ AACompIdent 。鑒別蛋白質通過其氨基酸構成。ExPASY 。- [讀 更多 AACompIdent] |
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AACompSim 工具 - http://www.expasy.org/tools/aacsim/ AACompSim 是允許氨基酸結構比較的瑞士Prot 項以所有其它瑞士Prot 項以便查找蛋白質氨基酸構成是最接近那所選的項的工具。ExPASY 。- [讀 更多 AACompSim 工具] |
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Aldente - http://www.expasy.org/tools/aldente Aldente 。辨認蛋白質以peptide 質量fingerprinting 資料。利用Hough 轉換為光譜recalibration 和外圍之物排除的一個新建, 快速和強有力的工具。ExPASy - [讀 更多 Aldente] |
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CysView - http://research.i2r.a-star.edu.sg/CysView/ CysView 作為當蛋白質順序輸入各種各樣的附註的格式化, 和圖解顯示半胱氨酸配對模式。它並且編組蛋白質以相似的二硫化物連通性模式。- [讀 更多 CysView] |
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FindMod - http://www.expasy.org/tools/findmod/ 預言潛在蛋白質過帳平移修改和潛在唯一氨基酸替換件在peptides 裡。實驗被評定的peptide 質量與理論peptides 比較被計算從被指定的瑞士Prot 項。ExPASy - [讀 更多 FindMod] |
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FindPept - http://www.expasy.org/tools/findpept.html 辨認起因於蛋白質空泛的卵裂從他們的實驗質量的peptides, 考慮到artefactual 化工修改, 過帳平移修改(PTM), protease 自溶卵裂。ExPASy - [讀 更多 FindPept] |
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GDAP - http://www.doe-mbi.ucla.edu/Services/GDAP Genomic 二硫化物分析程式(GDAP) 預言二硫化物債券為一個user-supplied 蛋白質順序。GDAP 為100 條微生物染色體並且提供存取對於二硫化物債券的前計算預言。- [讀 更多 GDAP] |
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GlycoMod - http://www.expasy.org/tools/glycomod/ 預言發生在蛋白質從他們的實驗堅定的質量的可能的低聚糖結構(能被使用為自由或被微商數化的低聚糖和為glycopeptides) 。ExPASy - [讀 更多 GlycoMod] |
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IsotopIdent - http://haven.isb-sib.ch/tools/isotopident/ IsotopIdent 。預言peptide 、蛋白質、polynucleotide 或化合物的理論同位素配電器。- [讀 更多 IsotopIdent] |
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連接器 - http://astro.temple.edu/~feng/Servers/BioinformaticServers.htm 連接器是為設計連接器peptide 順序的一個工具用於融合蛋白質的建築。用戶提供連接器的渴望的長度在或殘滓的埃或編號, 並且幾其它約束也許並且被指定, 公司- [讀 更多 連接器] |
| 吉祥人 - http://www.matrixscience.com/search_form_select.html 吉祥人。Peptide 質量指印、順序查詢和MS/MS 離子搜索從矩陣有限公司, 倫敦科學。- [讀 更多 吉祥人] |
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MultiIdent - http://www.expasy.org/tools/multiident/ MultiIdent 。辨認蛋白質以pI 、兆瓦、氨基酸構成、順序貨簽和peptide 質量fingerprinting 資料。ExPASY 。- [讀 更多 MultiIdent] |
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OMSSA - http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/omssa/ OMSSA 。MS/MS peptide 光譜確定由搜索已知的蛋白質順序圖書館。- [讀 更多 OMSSA] |
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PepMAPPER - http://wolf.bms.umist.ac.uk/mapper/ PepMAPPER 。Peptide 質量fingerprinting 工具從UMIST, 英國。- [讀 更多 PepMAPPER] |
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PepSea 。 - http://195.41.108.38/PepSeaIntro.html PepSea 。蛋白質確定由peptide 映射或peptide 程式化從Protana, 丹麥- [讀 更多 PepSea 。] |
| Peptide 質量 - http://www.expasy.org/tools/peptide-mass.html Peptide 質量。計算peptides 和他們的過帳平移修改質量為UniProtKB/Swiss-Prot 或UniProtKB/TrEMBL 項或為用戶序列。ExPASY 。- [讀 更多 Peptide 質量] |
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Peptidecutter - http://www.expasy.org/tools/peptidecutter/ Peptide 切割工。預言潛在protease 和卵裂站點和站點由化學製品劈開在一個指定的蛋白質順序。ExPASY 。- [讀 更多 Peptidecutter] |
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PeptideMass - http://us.expasy.org/tools/peptide-mass.html 劈開蛋白質順序與被選擇的酵素和計算被生成的peptides 的質量。- [讀 更多 PeptideMass] |
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PFMUTS - http://www.mcs.vuw.ac.nz/~aleksand/pfmuts/pfmuts.html PFMUTS 。顯示一個peptide 片段的可能的唯一和雙重變化從MALDI peptide 質量fingerprinting 。- [讀 更多 PFMUTS] |
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Phenyx - http://phenyx.vital-it.ch/pwi/ Phenyx 。蛋白質和peptide identification/characterization 從PMF 和MS/MS 資料從GeneBio, 瑞士- [讀 更多 Phenyx] |
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深刻。 - http://65.219.84.5/service/prowl/profound.html 讚成被查找是Proteometrics 搜索引擎為獲得蛋白質順序那最佳的符合peptide 質量列表。它使用一個很好被測試的貝葉斯算法辨認蛋白質根據許多標準, 譬如: - [讀的 更加深刻。] |
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ProteinInfo - http://65.219.84.5/service/prowl/proteininfo.html 蛋白質資訊是Proteometrics 搜索引擎獲得符合一個特殊順序主題的蛋白質順序。順序資訊的片段可能被輸入和所有順序符合, 模式在一個特殊資料庫被檢索。蛋白質- [讀 更多 ProteinInfo] |
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ProteinProspector - http://128.40.158.151/mshome3.4.htm 蛋白質探油礦者。各種各樣的工具從UCSF (女士適合, 女士貨簽, 女士消化, 等。) 為開採順序資料庫與質量光譜實驗一道。- [讀 更多 ProteinProspector] |
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ProtParam - http://us.expasy.org/tools/protparam.html 估計分子量、理論pI 、氨基酸結構、原子構成、絕種系數、估計的半衰期、不穩定索引、脂肪族索引和盛大平均數的hydropathicity 。- [讀 更多 ProtParam] |
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四處尋覓 - http://65.219.84.5/ProteinId.html 四處尋覓。蛋白質化學和質量光譜資源從洛克菲勒和NY 大學- [讀 更多 四處尋覓] |
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Qgrid - http://www.netasa.org/qgrid/index.html 提供字符串蛋白質的樹形圖的伺服器根據了每個的被充電的原子或hydrophobicity 其殘滓。繪製考慮到疏水和被充電的地區的配電器的視力檢查在蛋白質裡。- [讀 更多 Qgrid] |
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生波探側器MS/MS 搜索引擎。 - http://65.219.84.5/service/prowl/sonar.html 生波探側器MS/MS 搜索引擎是Proteometrics 搜索引擎為辨認蛋白質使用MS/MS 資訊從文摘peptides 。它特定被設計了為蛋白質確定自動化需要, 使用突破概念和設計t - [讀 更多 生波探側器MS/MS 搜索引擎。] |
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TagIdent - http://www.expasy.org/tools/tagident.html 貨簽Ident 。辨認蛋白質與pI, 兆瓦和順序貨簽, 或生成蛋白質列表緊挨一指定的pI 和兆瓦ExPASY 。- [讀 更多 TagIdent] |
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氨基酸程式庫 - http://www.imb-jena.de/IMAGE_AA.html 包括化學結構和屬性、溶劑可及性, 過帳平移修改, 和更多; 關於。- [讀的 更多 氨基酸程式庫] |
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