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| 剁 - http://www.rostlab.org/services/CHOP/ 砍作為蛋白質順序作為輸入, 和回歸蛋白質順序片段列表以同源到PDB 和Pfam 域和到蛋白質從SWISS-PROT 資料庫。- [讀 更多 剁] |
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COGs - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/ Orthologous 組字符串代表古老被保存的蛋白質域; 使用COGnitor 工具查找嵌齒輪在順序利益。- [讀 更多 COGs] |
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榆木: Eukaryotic 線性主題資源 - http://elm.eu.org/ 為報告域、主題, 和順序模式資訊為您的輸入序列eukaryotic 蛋白質功能站點的預言的工具。- [讀 更多 榆木: Eukaryotic 線性主題資源] |
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FunShift - http://funshift.cgb.ki.se/ FunShift 是存儲Pfam subfamily 分類為蛋白質域系列和分析他們為功能更改使用演變替換件費率和保護班次的資料庫。- [讀 更多 FunShift] |
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InterPro - http://www.ebi.ac.uk/interpro/index.html 綜合資料庫常用的簽名資料庫(即PROSITE, 列印, 聰明, Pfam, ProDom); 文本和基於順序的搜索。- [讀 更多 InterPro] |
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MyHits - http://myhits.isb-sib.ch MyHits 伺服器集成幾個工具以一個重點在蛋白質註釋和對蛋白質域的分析。客戶用戶得以進入對工具的譬如ClustalW 和T 咖啡和資料庫像瑞士Prot 、Prosite 和Interpro 。註冊允許我們- [讀 更多 MyHits] |
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NetOGlyc 預言伺服器 - http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/ 預言mucin 類型GalNAc O-glycosylation 站點在哺乳動物的蛋白質裡。- [讀 更多 NetOGlyc 預言伺服器] |
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NRPS-PKS - http://www.nii.res.in/nrps-pks.html NRPS-PKS 是一個工具包括四個綜合資料庫為對大多enzymatic 多域megasynthases 的分析。用戶能提交查詢順序給搜索為域或觀看產品的屬性。- [讀 更多 NRPS-PKS] |
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Pfam - http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/ 多順序對準線和被隱藏的Markov 設計的收集包括許多公用蛋白質域。- [讀 更多 Pfam] |
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Phospho.ELM - http://phospho.elm.eu.org/ 實驗被驗證的phosphorylation 站點資料庫在eukaryotic 蛋白質裡。註釋手工完成並且資料庫項來自和被鏈接回到科學文獻。Phospho.ELM 合併資料以前被查找在PhosphoBase 。- [讀 更多 Phospho.ELM] |
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PhosphoSite - http://www.phosphosite.org/ PhosphoSite 是a curated 活體內人和滑鼠phosphorylation 站點資料庫。資料庫包含peptide 順序和地點在域之內和主題為phosphorylation 站點, 和連結對有用的資源和文件參考。F - [讀 更多 PhosphoSite] |
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PROSITE - http://us.expasy.org/prosite/ 蛋白質系列和域資料庫被定義從SwissProt 資料庫; 考慮並且檢查特定主題資料庫譬如PhosphoBase 。- [讀 更多 PROSITE] |
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ScanProsite - http://us.expasy.org/tools/scanprosite/ 掃描您的順序反對PROSITE 資料庫為功能主題; 考慮並且檢查特定主題資料庫譬如PhosphoBase 。- [讀 更多 ScanProsite] |
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SledgeHMMER - http://sledgehmmer.sdsc.edu/ SledgeHMMER 是為搜索Pfam 資料庫的一個工具使用程式hmmpfam 的一個被並行化的版本。用戶能執行查詢以一個或更多順序一次和然後接受結果由電子郵件。- [讀 更多 SledgeHMMER] |
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聰明 - http://smart.embl-heidelberg.de/ 巧妙(簡單模件結構研究工具) 為蛋白質域的確定和註釋的一個萬維網工具, 和為複雜域結構的比較研究提供平臺在基因和蛋白質裡。- [讀的 更加聰明] |
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