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人的染色體的註釋
| 阿波羅染色體註釋和Curation 工具 - http://www.fruitfly.org/annot/apollo/ 阿波羅是染色體註釋瀏覽器和編輯。阿波羅允許研究員探索genomic 註釋在許多詳細程度, 和執行專家的註釋curation, 所有在一個圖解環境裡。- [讀 更多 阿波羅染色體註釋和Curation 工具] |
| Bioinformatics 工具套件 - http://protevo.eb.tuebingen.mpg.de/toolkit/index.php?view=search 這個工具套件是大範圍的一件收藏品工具和連結為順序分析、功能, 和結構預言。這種資源提供convienent 萬維網界面為許多自由地可利用的工具。- [讀 更多 Bioinformatics 工具套件] |
| Ensembl 染色體瀏覽器 - http://www.ensembl.org/ 網站, MySQL 伺服器和對引起和維護自動註釋在eukaryotic 染色體的軟體系統的perl API 存取。- [讀 更多 Ensembl 染色體瀏覽器] |
| 風扇 - http://bioinf.man.ac.uk/cgi-bin/neil/ntfront.pl 扇動(對核□酸序列的指印分析) 搜索核□酸序列反對列印資料庫, 蛋白質指印的一件收藏品被使用分配uncharacterised 順序到知道的系列和因此推斷試探性功能。- [讀 更多 風扇] |
| H 應邀資料庫 - http://www.h-invitational.jp/ H 應邀資料庫(H-InvDB) 是一個人的基因資料庫包含20,000 個DNA 字符串從多高生產量DNA 程式化項目。網站提供一個染色體瀏覽器, 疾風搜索, 和搜索根據資訊譬如- [讀的 更加H 應邀的資料庫] |
| 收割機 - http://harvester.embl.de/ 收割機為人的蛋白質提供對公共bioinformatic 資料庫和伺服器的快速訪問。結果返回作為包含被緩存的和被交互相聯的輸出從以下databases/servers 的唯一超文字標記語言頁: Uniprot/SWISSprot, ensEMBL, - [讀 更多 收割機] |
| IBM Bioinformatics 和模式發現組 - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html 廣泛的伺服器擁有大範圍為模式發現的工具在DNA 和蛋白質順序並且在文本裡。為多順序對準線、基因發現、蛋白質註釋, 和其它申請的工具並且存在在這臺伺服器。詳細資料- [讀 更多 IBM Bioinformatics 和模式發現組] |
| IBM 染色體註釋頁 - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Annotations/home.html 完整染色體頁的IBM 的基於生物詞典的註釋列出註釋為75 條完全染色體(archae 、細菌、eurkaryotes, 和病毒) 。您能查詢這些註釋在順序級別並且search/compare 橫跨染色體。- [讀 更多 IBM 染色體註釋頁] |
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MartView - http://www.ensembl.org/Multi/martview Ensembl EnsMart 染色體瀏覽器(MartView) 是為集成資料從Ensembl 的資料檢索和資料採集的一個工具。通過萬維網界面MartView 允許您應用一系列的補白創建可能被轉換成s - 的自定義資料集 [讀 更多 MartView] |
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NCBI 人的DNA 參考順序 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/seq/ 可下載人的DNA 參考順序。基因和其它genomic 功能的註釋將是可利用的為瀏覽何時完全。- [讀 更多 NCBI 人的DNA 參考順序] |
| NCBI 映射瀏覽器 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi? NCBI 映射瀏覽器提供功能圖形顯示在人的genomic 順序資料NCBI's 裝配件並且細胞遺傳, 基因, 實際, 和輻射雜種映射。- [讀 更多 NCBI 映射瀏覽器] |
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Pegasys: 工作流管理為bioinformatics - http://www.bioinformatics.ubc.ca/pegasys/ Pegasys 是靈活, 模件並且協調多個生物順序分析的執行的customizable 軟體系統用工具加工和促進他們的輸出的綜合化。軟體允許用戶創建分析工作流使用- [讀 更多 Pegasys: 工作流管理為bioinformatics] |
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Sequin - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html 桌面工具顯現了出由NCBI 為編輯, 附註和提交DNA 順序給任何三個DNA 順序提交站點(DDBJ 、EMBL 或GenBank) 。- [讀 更多 Sequin] |
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Taverna - http://taverna.sourceforge.net/ Taverna 是為創建和運行bioinformatics 工作流的一個工具。- [讀 更多 Taverna] |
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染色體7 註解項目 - http://www.chr7.org/ 染色體7 資料庫是包含順序、基因, 和其它註釋最新核對從所有資料庫的社區curated 項目(即Celera 被發布, NCBI, Ensembl, RIKEN, UCSC) 並且未出版的資料。- [讀的 更多 染色體7 註解項目] |
| UCSC 人的染色體瀏覽器網關 - http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway?org=Human&db=0&hgsid=27735471 提供任一個人的染色體的被請求的部份一個迅速和可靠的顯示在任一個縮放比例, 與許多被排列的註釋跟蹤一起。- [讀 更多 UCSC 人的染色體瀏覽器網關] |
| 對人的染色體的用戶指南 - http://www.nature.com/cgi-taf/DynaPage.taf?file=/ng/journal/v35/n1s/index.html 實踐講解至於使用染色體瀏覽器當為瀏覽和分析資料的萬維網工具從人的染色體項目和其它程式化的工作成績; 功能UCSC 染色體瀏覽器、NCBIs 映射瀏覽器, 和Ensembl 染色體瀏覽器。- [讀 對 人的染色體的更多用戶指南] |
| Vega 註釋瀏覽器 - http://vega.sanger.ac.uk 與染色體合作程式化中心, Vega 嘗試存在被完成的順序的一致的優質curation 。- [讀 更多 Vega 註釋瀏覽器] |
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