基因預言工具、預言的基因軟體和聯機bioinformatics 。
| 日程表 - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/agenda/ 日程表是比較genomic 順序從evolutionarily 相關有機體為了做基因預言的萬維網工具。它採取成對genomic 順序作為輸入, 排列順序, 和做預言根據接合信號, 起始時間和- [讀 更多 日程表] |
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AUGUSTUS - http://augustus.gobics.de/submission AUGUSTUS 是一個eukaryotic 基因預言工具使用一個更加準確的方法為塑造intron 長度配電器。它是特別有效以更大的順序。它可能運行通過萬維網界面, 或被下載和局部運行。- [讀 更多 AUGUSTUS] |
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疾風 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ 基本的局部對準線搜索工具; 檢索順序相似與您的查詢。- [讀 更多 疾風] |
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GeneComber - http://bioinformatics.ubc.ca/genecomber/index.php GeneComber 是一個從開始起基因預言工具被發展在UBC Bioinformatics 中心。它集成結果從二個外部被開發的基因定位程式和運行的前提如果這兩個基因定位程式同意預言, 我們可能是更多c - [讀 更多 GeneComber] |
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GeneMark - http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/ 程式GeneMark 系列使用Markov 設計和特定被定調為基因預言為順序從prokaryotes 、病毒染色體和真核。- [讀 更多 GeneMark] |
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GenomeScan - http://genes.mit.edu/genomescan.html 合併蛋白質相似性資訊當預言基因; 根據一部分GENSCAN 。- [讀 更多 GenomeScan] |
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GENSCAN - http://genes.mit.edu/GENSCAN.html 完全基因結構的確定在genomic DNA 裡。- [讀 更多 GENSCAN] |
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微光 - http://www.tigr.org/softlab/glimmer/glimmer.html 基因貨位和被內插的Markov Modeler; 這個prokaryote 基因查找工具是主要微生物基因定位程式被使用在TIGR; 釋放(包括來源代碼) 以註冊至於非商業使用。- [讀 更多 微光] |
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Grail - http://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/ Grail 是認可順序功能像促進者、exon 候選人、簡單重複和複雜重複性要素工具的套件。它並且塑造基因根據exon 候選人。- [讀 更多 Grail] |
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HMMgene - http://genome.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ 脊椎動物和C. elegans 基因的預言。- [讀 更多 HMMgene] |
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IBM Bioinformatics 和模式發現組 - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html 廣泛的伺服器擁有大範圍為模式發現的工具在DNA 和蛋白質順序並且在文本裡。為多順序對準線、基因發現、蛋白質註釋, 和其它申請的工具並且存在在這臺伺服器。詳細資料- [讀 更多 IBM Bioinformatics 和模式發現組] |
| ORF 定位程式 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 查找所有未結讀取框架在順序。- [讀 更多 ORF 定位程式] |
| TIGR 軟體工具 - http://www.tigr.org/software/ 打開來源軟體包列表可利用為從學院解脫為Genomic 研究(TIGR) 。- [讀 更多 TIGR 軟體工具] |
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Twinscan - http://genes.cs.wustl.edu/ Twinscan 是一個系統為預言的基因結構在eukaryotic genomic 順序。為了由被預言的編碼的地區和接合做其預言, Twinscan 組合資訊選址以conserservation 評定在目標se 之間- [讀 更多 Twinscan] |
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吳疾風 - http://blast.wustl.edu/ 華盛頓大學基本的局部對準線搜索工具- [讀 更多 吳疾風] |