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情況是大家相信的一個簡單語句。它是無辜的, 除非查找有罪。假說是沒人想要相信的一個新穎的建議。它是有罪的, 直到查找有效。~Edward 出納員
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在分子崗位Bioinformatics, 您將查找幾乎您將需要的每個bioinformatic 工具。我們有為DNA bioinformatics 、核糖核酸bioinformatics, 蛋白質Bioinformatics, 和Proteomic bioinformatic 工具的800 個bioinformatic 工具。我們為每個這些類別並且提供databses 為了容易地查找您的順序利益從幾個順序資料庫。
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基因Ontology 是
TGF beta 感受器官互動的蛋白質1 的認識和描述特性(... 關係了條款
TGF beta 感受器官互動的蛋白質1 的認識和描述特性(TRIP-1) 包含WD40 重複從Clonorchis sinensis 由bioinformatics 、克隆, 和表達式在大腸埃希氏菌。
Parasitol 皇家經濟學�&。15 7月2008 日;
作者: 胡X, 周H, 胡F, 徐J, 趙Y, 于X
DNA 克隆輸入同源染色體變換的增長系數beta (TGF beta) 感受器官互動的蛋白質1 (TRIP-1) 與Clonorchis sinensis 成人全長DNA 質粒圖書館被認可了和被隔絕了。TRIP-1 是一個bifunctional 分子在所有真核, 調整信號路TGF beta 作為TGF beta 型II 感受器官kinase phosphorylation 基體和控制核糖體裝配件和mRNA 轉換因為p36 eukaryotic 轉換起動系數3 的亞單位。TRIP-1 的結構和免疫學特性從C. sinensis (CsTRIP-1) 被bioinformatics 分析了。完全編碼序列用大腸埃希氏菌被表達了, 並且被淨化的再組合產品被獲得了。西部弄髒與混雜的清液從clonorchiasis 患者是正, 但是正常是負的, 建議這是診斷抗原的候選人為clonorchiasis 。CsTRIP-1 將援助探索交往在主機和寄生生物之間並且TGF beta 控制C. sinensis 發展和參加發病原理的結構。
PMID: 18626661 [ PubMed - 依照按發布人供應]
蛋白質交往資料集顯示了以人的Ras-MAPK/PI3K 信號路。
J Proteome 皇家經濟學�&。15 7月2008 日;
作者: Wang J, 元Y, 周Y, 郭L, 張L, Kuai X, 鄧B, 平底鍋Z, 李D, 他F
Ras-MAPK 和PI3K-AKT 路被保存在metazoan 有機體, 介入一系列的信號級聯和形成為許多生理和病理性進程的基本類型。在這兒我們報告關於酵母蛋白質交往網路的二個雜種審查結果在人的Ras-MAPK/PI3K 路附近知道的要素。一個總額42 個獨立DNA 圖書館審查導致200 蛋白質蛋白質交往(PPI) 成對在180 個分子之中。大多蛋白質形成了包含193 PPIs 在169 蛋白質之間的一個大字符串。七十�&交往表明高電話�&議根據bioinformatics 分析。犧牲者列表包含高充實基因以特定基因Ontology (去) 術語譬如對重音的對外部刺激的回應和回應。多數交往與各種各樣的蜂窩電話進程鏈接Ras 信號路。五交往由coimmunoprecipitation 和colocalization 檢驗驗證在哺乳細胞裡證實他們的活體內交往。這個蛋白質交往網路提供進一步洞察入Ras-MAPK/PI3K 信號路分子結構。
PMID: 18624398 [ PubMed - 依照按發布人供應]
有差別地表達的基因的確定和描述特性在抵抗回應在芋頭裡被感染Phytophthora colocasiae 。
Mol Biol Rep 。13 7月2008 日;
作者: Sharma K, Mishra AK, Misra RS
葉子凋枯病疾病由Phytophthora colocasiae 造成代表主要約束對增長和產量芋頭(Colocasia esculenta L.) 。對式樣工廠系統的持續的研究顯露, 防禦回應被激活通過信號路由內在信號分子斡旋譬如水楊基酸、jasmonic 酸, 和乙烯。工廠防禦的起動同變化聯繫在一起在基因的大編號上表達式。獲取對防禦回應的更好的瞭解, P. colocasiae 劇毒種族被使用接種芋頭培�&品種UL-56 (兼容) 並且其幾乎isogenic 線路Muktakeshi (不相容) 。我們使用了抑壓減少性的雜交(SSH), DNA 圖書館、北汙點分析、高生產量DNA 程式化, 和bioinformatics 辨認與防禦相關的基因在芋頭裡被P. colocasiae 傳染導致。二個想像抵抗基因和副本系數被辨認了在之中upregulated 順序。幾個候選人基因表達式包括油脂調用蛋白質(LTPs), 和其它與發病原理相關的基因被評估了跟隨8-48 h 症狀外觀在兼容和不相容的交往。結果證實了這些基因更高的整體表達式在Muktakeshi (抗性) 與UL-56 比較(易受影響) 。這項研究構成第一嘗試描繪芋頭有差別的transcriptome 與相關主機病原生物交往從不同的基因型。所有被生成的ESTs 被提交了給GenBank 為進一步功能研究。
PMID: 18622758 [ PubMed - 依照按發布人供應]
分類以reject 選項在基因表達資料。
Bioinformatics 。10 7月2008 日;
作者: Hanczar B, Dougherty ER
刺激: 分類方法典型地被使用在bioinformatics 分類所有實例, 既使分類是模棱兩可的, 例如, 當實例是緊挨分離的超平面在線性分類。為醫療申請, 它也許是更好分類實例只當有充足地高準確度, 而不是分類所有實例以正派準確性。而且, 當所有實例被分類, 分類規則不掌握分類符的準確性; 算法打算導致分類符以最小的誤差率可能。在我們的途�&, 我們修理分類符的準確性和因此選擇錯誤一種渴望的風險。結果: 我們的方法包括定義一個rejection 區域在功能空間。這個地區包含分類是模棱兩可的實例。這些由分類符rejected 。分類符的準確性成為分類規則的一個用戶定義的參數。分類規則的任務是使rejection 區域減到最小以分類符的誤差率由被選擇的目標錯誤一定的約束。這個途�&並且被使用在功能選擇步驟。結果被計算在綜合和真正的資料表示, 分類符準確性顯著被改進。聯絡: edward@ece.tamu.edu, hanczar_blaise@yahoo.fr 補充資訊: 伴侶網站(1) 。
PMID: 18621758 [ PubMed - 依照按發布人供應]
經驗使用萬維網服務為生物順序分析。
簡要Bioinform 。11 7月2008 日;
作者: Stockinger H, Attwood T, Chohan 錫, Côté R, Cudré-Mauroux P, Falquet L, Fernandes P, 芬蘭人RD, Hupponen T, Korpelainen E, Labarga A, Laugraud A, 利瑪T, Pafilis E, Pagni M, Pettifer S, Phan I, 拉曼N
對資料和工具的綱領性存取通過萬維網使用所謂的萬維網服務有一個重要角色扮演在bioinformatics 。在這個條款裡, 我們討論最普遍的途�&根據SOAP/WS-I 和休息和描述我們, 社區的一個橫剖面, 經驗與提供和使用萬維網服務就生物順序分析狀況。我們以及是有用的為用戶和開發員的最佳的實踐暗示簡要覆核主要技術途�&。終於, 語法和語義資料綜合化問題以多萬維網服務討論。
PMID: 18621748 [ PubMed - 依照按發布人供應]
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