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蛋白质和抗体Microarrays
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竟管最近推进在对分子生物学的我们的了解, 我们在许多情况下无法牵连特定蛋白质以疾病。 Genomics 和microarray 技术允许我们一次分析千位mRNAs 和确定是否mRNA 表达式被更改在疾病状态。 但是, 研究员长期知道, 一mRNA 的浓度在电池之内穷地被关联以实际丰盈那蛋白质(1,2,3) 。 这归结于情况各自的mRNAs 的退化的费率和蛋白质不同, 过帐transcriptional 控制蛋白质转换(4), 蛋白质(5) 的一定数量的过帐transcriptional 修改, 和蛋白质退化由解朊作用(6) 。
由直接地评定相当数量特定蛋白质, 我们评定基因功能的一个真实的级别。 但是, 当你考虑到很大数量的过帐平移修改, 人类细胞也许包含百万或更加不同的蛋白质变形, 任何能被修改在疾病做任务分析所有一个巨大的任务。 蛋白质microarrays
或蛋白质芯片也许考虑到解决方法对这个问题。 幻灯片或"芯片" 能被察觉以千位知道的抗体或肽象DNA microarray, 一个生物范例延长了芯片, 和任一捆绑被确定。 束缚能并且被分析使用标准proteomic 技术譬如时间飞行质量光谱(女士) 并且肽质量fingerprinting 。 蛋白质芯片可能因而成为描出蛋白质变化一个快速和高生产量方法在疾病上。(7)
蛋白质芯片有潜力起作用在许多其它申请包括蛋白质蛋白质, 蛋白质–药物交往、–DNA 蛋白质交往、蛋白质本地化、抗原抗体交往、enzyme-substrate, 和也许是amendable 排列类型高生产量审查的感受器官ligand 交往的研究(7,8) 。
二个途径使用为了描绘多蛋白质在一个生物范例。 第一途径是2-dimensional 胶凝体电泳法, 由切除和确定广泛应用分离和形象化2000-10,000 蛋白质在一个唯一实验由质量光谱((9) 女士) 。 这个方法是费时和与女士, 只有最丰富的蛋白质可能被检测。 并且, 增殖率疑难, 即使预铸的胶凝体和常用的试剂、协议, 和硬件元件导致了改善的性能(17) 。 由于3D 胶凝体分离技术的限制, 增长的注意集中于第二个途径的发展, 蛋白质microarrays 的发展作为替代和补全途径(10-12) 。
理论背景为蛋白质基于microarray 的ligand 约束检验由Ekins 等首字母开发了在80 年代(13-16 晚期) 。 根据设计, 抗体microarrays 比常规审查方法不仅会允许analyte 盘区的同时审查, 但并且敏感和迅速。 兴趣在审查大蛋白质集上只出现了由于成绩在genomics 由DNA microarrays 和人的染色体项目(17) 。
第一列阵途径尝试小型化生物化学和immunobiological 检验通常执行在96-well microtiter 板材(18-19 里) 。 96-well 抗体列阵第一次被创建了以144 个要素每个为标准酵素被链接的免疫吸附剂检验(ELISAs) (20) 。 相似的列阵使用评定摄护腺特定抗原(PSA) 并且cytokines (21) 。
补白膜首字母也被使用了由于他们的优越蛋白质约束能力。 他们主要被探查了与抗体使用ELISA 技术。 低密度一些48 被净化的蛋白质被介入在副本被开发了为蛋白质的特定交往的调查以radiolabeled DNA 、核糖核酸、ligands, 和其它小化学制品(22) 。 一个基于膜的高密度列阵被开发了为筛选一个人的胎儿脑子DNA 表达式图书馆包括37830 克隆的目的。 被净化的蛋白质被察觉了PVDF 膜在密度300 samples/cm2 (23) 。 其它补白根据了列阵被修建了但限制是低分辨率和可观的背景使它难使用他们在申请以限制范例数量譬如蛋白质表达式描出肿瘤切片检查法。
蛋白质列阵减弱蛋白质或抗体图书馆被固定在第2 可寻址的网格在芯片(参见图1) 。 蛋白质microarray biochips 提取和保留目标从液体媒体和是分明从microfluidic biochips, 分开和处理蛋白质在运输媒体 在原处 使用microfluidic 设备(24,25) 。 一个典型的列阵也许空间地包含103-104 个分明要素在一个总面积1 cm2 之内(26) 。
其次: 类型抗体和蛋白质芯片