Спонсируйте/Разрекламируйте & Соедините к нам & Свяжитесь мы & О нас & Помогите нам

Молекулярная Биология Blog

Недавние Столбы Форума

 

Bioinformatics

Bioinformatics Домашнее	Инструменты Bioinformatic классифицировали	Выучьте О Bioinformatics	Faq Bioinformatics	Статьи исследования на Bioinformatics	Форум Bioinformatics	Весточка Bioinformatic	Bioinformatics Blog	Книги Bioinformatic

На молекулярной станции Bioinformatics, вы найдете почти каждый bioinformatic инструмент, котор вы. Мы имеем над 800 bioinformatic инструментами для bioinformatics ДНАА, bioinformatics RNA, инструментов протеина Bioinformatics, и Proteomic bioinformatic. Мы также обеспечиваем databses по каждом из из эти категории легко для того чтобы найти вашу последовательность интереса от нескольких баз данных последовательности.

Статьи Bioinformatics

Биологические Базы данных

OMIM

Протеин Bioinformatics

Домены Motifs Протеина

Локализация Протеина Субцеллюлярная

Структура Протеина Вторичная

Анализ Мутанта Протеина

 

Анализ Выражения Гена

Анализ Выражения Протеина

Взаимодействия Протеина Протеина

Сравнительное Genomics

 

Наша база данных инструментов Bioinformatic имеет все bioinformatic инструменты, котор вы всегда будете и вклюает онлайновые программы и инструменты дальше:  ДНАО Bioinformatics, RNA Bioinformatics, протеин Bioinformatics, Proteomic Bioinformatics, и молекулярные модельные организмы.

 

Ген Ontology ИДЕТ

 

Самая последняя Весточка Bioinformatics

Анализ Multimarker и вменение множественной платформы складывать вместе-osnovali геном... отнесли статьи

Анализ Multimarker и вменение множественной платформы складывать вместе-osnovali геном-wirokie изучения ассоциации.

Bioinformatics. 2008 июль 10;

Авторы: Homer Н, Tembe WD, Szelinger С, Redman М, Stephan DA, Pearson JV, Нелсон SF, Craig Д

СВОДКА: Для много геном-wiroka4 ассоциация (GWA) изучает индивидуально genotyping миллионо или больше SNPs обеспечивает незначительня увеличение в охвате на существенной цене. Много из приобретенной информации резервные должными к структуре корреляции своиственной в людском геноме. Складывать основанные изучения вместе GWA был в состоянии помочь значительно путем использовать это дублирование для уменьшения шума, для того чтобы улучшить точность замечаний, и увеличить genomic охват. Мы вводим измерение корреляции между индивидуальный genotyping и складывать вместе, под такими же рамками что r(2) обеспечивает измерение disequilibrium рычага между парами SNPs. Мы после этого сообщаем новый метод мулти-lokusov multimarker non-haplotype что системы рычагов структура корреляции между SNPs в людском геноме для того чтобы увеличить efficacy складывая вместе основанного GWA изучают. Мы сперва даем теоретические рамки и вывод нашего метода multimarker. Затем, мы оцениваем имитации использующ этот подход к multimarker in comparison to одиночный анализ отметки. Окончательно, мы экспириментально оцениваем наш метод использующ по-разному бассеины индивидуалов HapMap на дуе Illumina 450S, Illumina 550K, и Affymetrix 5.0 платформы для совмещенного итога 1.333.631 SNPs. Наши результаты показывают что польза анализа multimarker уменьшает специфический шума к складывать основанные изучения вместе, позволяет для эффективного внедрения множественных microarray платформ, и обеспечивает более точные измерения значения чем одиночный анализ отметки. Дополнительно, этот подход можно расширить для того чтобы позволить для вменять значение ассоциации для SNPs сразу наблюдаемого использовать соседское SNPs в disequilibrium рычага. Этот метод multimarker можно теперь использовать cost-effectively для того чтобы завершить складывать вместе-osnovannye изучения GWA с множественными платформами поперек над миллионом SNPs и вменить соседское SNPs утяжеленные для потери информации должной к складывать вместе. ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ: Дополнительные данные имеющиеся на Bioinformatics online.

PMID: 18617537 [ PubMed - как поставлено издателем ]

Определять стабилность линии клетки CMT 2 габаритный гель полиакриламида, котор избирает... отнесл статьи

Определять стабилность линии клетки CMT габаритным электрофорезом геля полиакриламида 2 и массовым спектрометрированием основал анализ proteome.

Ж Proteomics. 2008 июль 21;71(2):160-167

Авторы: Zhang К, Wrzesinski К, Fey SJ, Mose Larsen П, Zhang X, Roepstorff П

Плоский электрофорез геля полиакриламида (2-D СТРАНИЦА) последовал за массовым спектрометрическим идентификацией протеинов в пятнах протеина был центральным инструментом в proteomics. CMT167(H), CMT64(M) и CMT170(L) линии клетки, выбранные от самопроизвольно аденокарциномы легкя мыши, с максимумом -, средний или nizki1-metastatic потенциал был охарактеризован в vivo. В этом изучении, всесторонние профили выражения протеина линий клетки CMT были проанализированы на проходах 5, 15 и 35 для того чтобы определить стабилность линии клетки. Во время проходов 5 до 15, профили выражения клеток CMT остали разумно стабилизированными как проявлено только 0.7%, 3.9% и 1.1% протеинами измененными в CMT167(H), CMT64(M) и CMT170(L) соответственно. Однако, число дифференциально выраженных протеинов значительно был увеличен на проходе 35 в CMT64(M) и CMT170(L) пока CMT167(H) остало стабилизированным. Я основаны на нашей критери по выбора, 22, 109 и 84 пятна в CMT167(H), CMT64(M) и CMT170(L) были выбраны для идентификации протеина ГОСПОЖЕЙ и 99 уникально протеинов были определены. Анализ Bioinformatics показал что большой часть из этих протеинов участвует в клетчатом метаболизме. В заключении, было найдены, что было proteomics полезным инструментом для определять разницы в стабилности линии клетки. Этот подход обеспечил инструмент для того чтобы выбрать самую лучшую линию клетки и оптимальный период субкультуры для изучений рака отнес явления и для испытывать влияние потенциальных anticancer снадобиь.

PMID: 18617143 [ PubMed - как поставлено издателем ]

Метка FLXtrade программного механизма генома болееDlinn44 читает, больше применений, st... отнесла статьи

Метка FLXtrade программного механизма генома болееDlinn44 читает, больше применения, straightforward bioinformatics и более вполне комплектов данных.

Ж Biotechnol. 2008 июнь 21;

Авторы: Droege М, Холм Б

Системой программного механизма FLX генома (gs FLX), приведенной в действие 454 sequencing, будет next-generation ДНАО sequencing технология отличая уникально смешиванием длиной читает, исключительнейшая точность, и ультравысокий throughput. Было доказаны, что будет самыми разносторонними всех currently available next-generation sequencing технологий, поддерживающ много изучения высок-profil4 внутри над 7 категориями применений. Потребители gs FLX следовали новаторское исследование в de ново sequencing, ре-re-sequencing всех геномов и зон ДНАА цели, metagenomics, и анализ RNA. 454 sequencing будет мощным инструментом для людского исследования генетики, недавн ре-re-sequenced геном индивидуального человека, в настоящее время ре-re-sequencing вполне людское exome и пристреливающ genomic зоны использующ процесс захвата последовательности NimbleGen, и обнаруживающ низкочастотные соматические перегласовки соединенные к раку.

PMID: 18616967 [ PubMed - как поставлено издателем ]

[ прогноз наружных протеинов мембраны используя машину вектора поддержки с гребнем... отнес статьи

[ прогноз наружных протеинов мембраны использующ машину вектора поддержки с совмещенными характеристиками ]

Гонг Cheng Xue Bao Sheng Wu. 2008 Apr;24(4):651-8

Авторы: Zou Л, Wang З, Wang Ы

Наружные протеины мембраны (OMPs) врезаны в наружной мембране грамотрицательных бактерий, mitochondria, и хлоропластов. Клетчатое положение и функциональная разнообразность OMPs делают ими важный тип протеина. Исследует на прогнозе OMPs методами bioinformatics смогите принести полезные методологии для определять OMPs от genomic последовательностей и для успешно прогноза их вторичных и третичных структур. В этой бумаге, 3 типа характеристики были высчитаны от последовательностей протеина: составы amino acid, составы дипептида и утяжеленные коэффициента корреляции индекса amino acid. После этого, 3 типа характеристики были совмещены и inputted в машину вектора поддержки (SVM) основал упредитель для того чтобы определить OMPs от других складывая типов протеинов. Были высчитаны результаты различения используя несколько совмещенных характеристик включая 4 категории индекса amino acid, и было обсужено влияние на точности различения использующ по-разному коэффициента корреляции с по-разному заказами и весами. В крест-utverjennyx испытаниях и независимо испытаниях для определять OMPs от dataset 1087 протеинов принадлежа к всем по-разному типам протеинов шаровидных и мембраны, метод используя совмещенные характеристики получает общую точность 96.96% и 97.33% соответственно. И эти результаты outperform то из других методов в словесности. Использующ этот метод, высокие характерности показаны от результатов определять OMPs в 5 бактериальных геномах, и над 99% OMPs с знанными трехмерными структурами в базе данных PDB правильно различено. Эти результаты показывают что методом будет мощный инструмент для различения OMPs в геномах.

PMID: 18616178 [ PubMed - в процессе ]

[ быстро обнаружение aernginosa псевдомонасов флуоресцированием количественным т... отнесло статьи

[ быстро обнаружение aernginosa псевдомонасов assay TaqMan PCR флуоресцирования количественным targetting ген ETA ]

Гонг Cheng Xue Bao Sheng Wu. 2008 Apr;24(4):581-5

Авторы: Xiao X, Zhang Ж, Гонг Ж, Лоток Ы, Yu Ы, Yang X, Wu Ю

Aernginosa псевдомонасов (PA) будет одним из самых всеобщих патогенов в клиническом диагнозе, и обычным assay обнаружения имеет много недостатков. В этом исследовании, пара специфически праймеров и TaqMan дневной, котор зонд был конструирован в консервативной зоне гена ETA методом анализа bioinformatics, методом обнаружения для PA успешно были развиты. По-разному концентрация градиента ДНАА PA и различного ДНАА патогена была усилена флуоресцированием количественным PCR (FQ-PCR) для того чтобы подтвердить характерность и чувствительность начатого метода. Результаты показали что начатым assay обнаружения будет более здрав и специфические сравнением к обычному методу FQ-PCR, и он ценн для перспективностей исследования и применения.

PMID: 18616166 [ PubMed - в процессе ]