Дом Bioinformatics
|
Инструменты Bioinformatic классифицировали
|
Выучьте о Bioinformatics |
Ч.З.В. Bioinformatics |
Статьи исследования на Bioinformatics |
Форум Bioinformatics |
Новости Bioinformatic |
Блог Bioinformatics |
Книги Bioinformatic |
На молекулярном Bioinformatics станции, вы найдете почти каждый bioinformatic инструмент вам. Мы имеем над 800 bioinformatic инструментами для инструментов bioinformatics дна, bioinformatics RNA, Bioinformatics протеина, и Proteomic bioinformatic. Мы также обеспечиваем databses для каждой из этих категорий легко для того чтобы найти ваша последовательность интереса от нескольких баз данных последовательности.
Локализация протеина субцеллюлярная
Взаимодействия протеина протеина
Наша база данных инструментов Bioinformatic имеет все bioinformatic инструменты вам всегда будете и включает он-лайн программы и инструменты дальше: Bioinformatics дна, Bioinformatics RNA, Bioinformatics протеина, Bioinformatics Proteomic, и молекулярные модельные организмы.
Ontology Джин ИДЕТ
Грамматическ-Задержанные спрятанные условно случайные поля для Bioinformatics Ap… Родственные статьи
Грамматическ-Задержанные спрятанные условно случайные поля для применений Bioinformatics.
Mol Biol алгоритмов. 22-ое октября 2009; 4 (1): 13
Авторы: Fariselli p, Savojardo c, Martelli PL, Casadio r
КОНСПЕКТ: ПРЕДПОСЫЛКА: Дискриминативные модели конструированы естественно для того чтобы адресовать задачи классифицирования. Однако, некоторые применения требуют включения правил грамматики, и в этих моделях случаев генеративных, как спрятанные Markov модели (HMMs) и стохастические грамматики, по заведенному порядку прикладной. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы вводим Грамматическ-Задержанные спрятанные условно случайные поля (GRHCRFs) как выдвижение спрятанных условно случайных полей (HCRFs). GRHCRFs пока сохраняющ дискриминативный характер HCRFs, может задать ярлыки в соответствии с правил продукции определенной грамматики. Главная новизна GRHCRF возможность включать в знании HCRFs прежнем проблемы посредством определенной грамматики. Наша настоящая вставка позволяет регулярн правилам грамматики. Мы испытываем наше GRHCRF на проблеме типичного biosequence обозначая: прогноз топологии Prokaryotic протеинов наружн-мембраны. ЗАКЛЮЧЕНИЯ: Мы показываем что в проблеме типичного biosequence обозначая GRHCRF выполняет более лучше чем модели CRF такой же сложности, показывая что GRHCRFs может быть полезными инструментами для применений анализа biosequence. НАЛИЧИЕ: ПО GRHCRF имеющееся под лицензией GPLv3 на вебсайте http://www.biocomp.unibo.it/ savojard/biocrf-0.9.tar.gz.
PMID: 19849839 [PubMed - как поставлено издателем]
Идентификация и функциональная характеризация effectors в выраженной последовательности маркируют от различных этапов жизненного цикла pallida Globodera струнца циста картошки.
Mol завода Pathol. 2009 ноябрь; 10 (6): 815-28
Авторы: Jones JT, Kumar a, LA Pylypenko, Thirugnanasambandam a, Castelli l, Чэпмен s, кран PJ, Grenier e, Lilley CJ, MS Phillips, Blok VC
В настоящей статье, мы описываем анализ над 9000 выраженных бирок последовательности (ESTs) от архивов cDNA полученных от различных этапов жизненного цикла pallida Globodera. Мы определяли над 50 effectors pallida G. от этого dataset используя анализ bioinformatics, путем экранировать клоны для того чтобы определить сделанные секретным протеины вверх-отрегулированные после натиска паразитства и использование в гибридизации situ для того чтобы подтвердить выражение в pharyngeal клетках железы. Были определены протеины pallida SPRYSEC G. зашифрования семьи гена реальности. Выражение этих генов ограничено к надфюзеляжной pharyngeal клетке железы. Различные члены семьи SPRYSEC протеинов от pallida G. показывают различные субцеллюлярные картины локализацией в заводах, при некоторое локализованное к цитоплазме и другим к ядру и nucleolus. Разницы в субцеллюлярной локализации могут отразить разнообразные функциональные роли для каждого индивидуального протеина или, более правоподобные, разнообразие в компартментализации протеинов завода пристрелнных струнцом. Наши данные поэтому последовательны с предложением что протеины SPRYSEC подавляют обороны хозяина, как предложено ранее, и что они достигают этого через взаимодействие с рядом целей хозяина.
PMID: 19849787 [PubMed - в процессе]
От бактериальных генов avirulence к эффекторным функциям через средство доставки hrp: обзор 25 лет прогресса в нашем вникании невосприимчивости завода врождённой.
Mol завода Pathol. 2009 ноябрь; 10 (6): 721-34
Авторы: Mansfield JW
Клонировать первый ген avirulence (avr) водил не только к более глубокому вниканию взаимодействий ген-для-гена в болезни растения, но также к основным проницательностям в подавление базальных оборон против микробного нападения. Эта статья (фокусируя на syringae псевдомонасов) составляет схему развитию идей и прогрессу исследования над 25 летами следуя за прорывом достиганным Staskawicz и сотрудниками. Выдвижения в технологию клонирования гена underpinned идентификация и генов avr и hrp, последнее необходимы для активации защитительной гиперчувствительной реакции (HR) и патогенность. Была продемонстрирована поставка протеинов Avr до тип машинное оборудование секретирования III зашифрованная группами гена hrp, и работа протеинов внутри клеток завода по мере того как elicitors HR были подтвержены. Ключевые роли для генов avr в патогенической пригодности теперь были установлены. Rebranding протеинов Avr как effectors, протеины которые подавляют HR и клетка стен-основала обороны, вел к продолжающийся поиску для их целей, и производит новые проницательности в координацию сопротивления завода против разнообразных микробов. анализ Bioinformatics-водить эффекторного распределения гена в геномах обеспечивал замечательный взгляд взаимообмена effectors и также их функциональных доменов, по мере того как гонка вооружений нападения и обороны управляет развитием микробной патогенности. Рассмотрено применение нашего увеличиванного знания для развития стратегий контроля распространения болезней.
PMID: 19849780 [PubMed - в процессе]
Функциональные genomic подходы для изучения фетального/плацентарного развития в swine с особым акцентом на отпечатанных генах.
Soc Reprod Fertil Suppl. 2009; 66: 245-64
Авторы: СТАРШИЙ Bischoff, Tsai s, Hardison n, Motsinger-Reif AA, BA Freking, Piedrahita JA
Эта глава описывает применение функциональных genomic подходов к изучению отпечатанных генов в swine. Пока поменянные определения «функционального genomics», вообще они фокусируют на применении microarrays дна, одиночных блоков полиморфизма нуклеотида (SNP), и других анализов высокого охвата genomic, и их комбинации с идущими дальше по потоку методами изменения гена как заставлять замолчать RNA (siRNA) и вирусный и non-вирусный transfection. Между приемом начальных данных и фактической генетической манипуляцией bioinformatics лож системы, где анализируют для того чтобы извлечь огромные количества данных содержательную информацию. Эта область в постоянн потоке с увеличенным вниманием на обнаружении affected троп и процессов довольно чем поколение просто affected списков гена. Мы расширим на каждом из этих пунктов и опишем как мы использовали эти технологии для изучения отпечатанных генов в swine. Во первых мы введем биологический вопрос для того чтобы обеспечить смысл для обсуждения функциональных genomic подходов и типов информации они производят.
PMID: 19848292 [PubMed - в процессе]
Для больше щелкните здесь: Новости науки