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Bioinformatics, Protocolos, Proteína Proteomics do RNA do Dna
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Menos desvio da verdade é multiplicado mais tarde. 384-322 BCE) filósofo grego do ~Aristotle (.
Resultados da busca para: amostras
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(LCM): Preparação e secionar de blocos frozen
do tecido e purification do RNA do Cel isolado -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4107 As pilhas ou os tecidos específicos dos isolates de LCM das amostras montaram em corrediças do microscópio. As amostras são vistas através de uma película thermoplastic que seja unida a uma tampa do tubo do microcentrifuge. O calor localizado, causado pela aplicação de um pulso do laser, funde a membrana às pilhas do interesse, que podem então ser colhidas para uma análise mais adicional. O RNA e as proteínas podem purified das pilhas isoladas, permitindo análise detalhada da expressão do gene. Este protocolo é dividido em três estágios. - [Lido (LCM): Preparação e secionar de blocos frozen do tecido e purification do RNA do Cel isolado] |
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Um método para a isolação do DNA do chloroplast e do
DNA mitochondrial do sunflower -
http://pubs.nrc-cnrc.gc.ca/ispmb/ispmb16/16183-2.pdf Categoria: Protocolos Da Biologia Da Planta: Protocolos Da Isolação do RNA do Dna Da Planta O protocolo inclui: isolação do organelle, tratamento do deoxyribonuclease, lysis, deproteinisation e um purification final do DNA com sulphate dodecyl de sodium e acetato do potassium. O rendimento do DNA do organelle é 5-10 microgramas por o grama do tecido e o DNA é inteiramente restrictable. A técnica é barata e apropriada para a isolação de amostras múltiplas do DNA do organelle de um pouco de tecido. - [lido um método para a isolação do DNA do chloroplast e do DNA mitochondrial do sunflower] |
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Um método para a isolação do micro-Scale e o
purification dos gangliosides -
http://www.glycotech.com/protocols/Proto1.html Categoria: Protocolos Molecular Da Biologia: Protocolos Do Hidrato de carbono O protocolo solvente da divisória permite a isolação dos gangliosides das amostras pequenas e das amostras onde as concentrações do ganglioside são baixas, especial relativo à concentração potencial de contaminar proteínas e a outra espécie grande do peso molecular. Diretor de Stephan Ladisch, centro para o cancer e biologia do transplant, centro médico nacional das crianças, Washington, C.C.. - [lido um método para a isolação do micro-Scale e o purification dos gangliosides] |
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Um método multiplex de PCR para definir uma região
chromosomal suprimida narrow de um genome do tumor -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4117 Categoria: Genetics e Genomics: Protocolos Do Genetics Do Cancer: Perda de protocolos de Heterozygosity O DNA para a análise purified usando a precipitação de sal. O método é delicado, limita a ruptura das costas chromosomal longas, e evita o uso do phenol e do clorofórmio. É apropriado para o uso com pilhas cultivadas, o tecido do tumor do peito que foi sujeitado à análise do receptor do hormone, e o sangue prova. A perda do assay do heterozygosity é executada usando um PCR multiplex, em que um de cada par mais mais bem vestido é etiquetado com um fluorophor diferente. - [lido um método multiplex de PCR para definir uma região chromosomal suprimida narrow de um genome do tumor] |
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Pdf do electrophoresis do gel do agarose -
http://www.uni-tuebingen.de/evoeco/files/methods/Electrophoresis.pdf Categoria: Protocolos Molecular Da Biologia: Preparação Do Gel Do Agarose Electrophoresis Do Gel Do Agarose. Derramar do gel do agarose, preparação das amostras, electrophoresis do gel, manchar do brometo de ethidium. - [Pdf Lido Do Electrophoresis Do Gel Do Agarose] |
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Um Isoform alternativamente emendado t(8;21) do
transcript promove Leukemogenesis -
http://www.natureprotocols.com/2006/08/03/an_alternatively_spliced_isofo.php Categoria: Genetics e Genomics: Protocolos Do Genetics Do Cancer Descreva os métodos para identificar e quantitate o transcript específico de A/E9a t(8;21) em amostras dos pacientes relativo ao transcript de AML1-ETO que codifica 752 a proteína full-length sabida poço do amino-ácido AML1-ETO (AE). Inclui: Preparação do RNA e RT-PCR; Quantitation relativo do AE9a e dos transcripts de AE. - [lido um Isoform alternativamente emendado t(8;21) do transcript promove Leukemogenesis] |
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Análise Da Fragmentação do Dna Usando O Assay do
ATOLAMENTO (Subscrição Requerida) -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4432 Categoria: Biologia da pilha e cultura de pilha: Protocolos De Apoptosis: Análise De Apoptosis Análise da fragmentação do DNA usando o assay do ATOLAMENTO. Por Shailaja Kasibhatla et al., o assay do ATOLAMENTO é baseado em etiquetar o DNA nuclear de pilhas dando um ciclo com [ amostras de 3H]thymidine e colher em filtros da fibra de vidro. Apoptosis gerará os fragmentos do DNA pequenos bastante para passar através do filtro da fibra de vidro, tendo por resultado o radioactivity diminuído da amostra particular. A matança cell-mediated do cytotoxicity ou da pilha mediada pelos lymphocytes cytotoxic de T (CTL) pode também ser medida por esta técnica. - [Análise Lida Da Fragmentação do Dna Usando O Assay do ATOLAMENTO (Subscrição Requerida)] |
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Análise do methylation do DNA usando o bissulfito que
arranja em seqüência o protocolo -
http://www.methods.info/Methods/DNA_methylation/Bisulphite_sequencing.html Categoria: Protocolos de PCR: A Conversão Do Bissulfito Baseou Protocolos de PCR
Protocole para a análise do
methylation do DNA usando arranjar em seqüência do bissulfito.
O método permite a análise precisa do methylation em uma
determinada região convertendo todo nonmethylated cytosines em
tymines, quando os cytosines methylated remanescerem unchanged. Este método requer um pouco de DNA genomic e parece
conseqüentemente ser muito útil para a análise das amostras
clínicas, onde a quantidade material é limitada. |
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Protocolo da deteção de Apoptosis pelo fluxo
Cytometry de Único Laser -
http://cyto.mednet.ucla.edu/Protocols/detection.htm Categoria: Biologia da pilha e cultura de pilha: Protocolos De Cytometry Do Fluxo Um método sensível para a deteção do apoptosis pelo único fluxo do laser cytometry. A metodologia inclui: Manchando para a deteção do apoptosis, procedimento manchando direto, procedimento manchando indireto, protocolo para o uso da actinomicina D (ANÚNCIO) nas amostras que foram manchadas com o 7-AAD para o apoptosis e reparadas no formaldehyde. - [Protocolo Lido Da Deteção De Apoptosis Pelo Fluxo Cytometry De Único Laser] |
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Protocolos do autoradiography -
http://pingu.salk.edu/~sefton/Hyper_protocols/ARG.html Categoria: Radioactivity: Autoradiography Protocolos Do Autoradiography. Expondo os gels e as placas que contêm amostras radioativas à película de raio X. Deteção de 3H. Deteção de 35S e de 14C. Deteção de 32P e de 125I. Cookbook De Bart. - [Protocolos Lidos Do Autoradiography] |
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Assays Do Hidrato de carbono -
http://www.cmdr.ubc.ca/bobh/showmethod.php?methodid=13 Categoria: Protocolos Molecular Da Biologia: Protocolos Do Hidrato de carbono o determina as quantidades relativas de hidratos de carbono dos LPS atuais em uma tensão dada. O assay pode ser feito em um jogo das amostras e então ser feito a varredura nos vários wavelengths para dados razoáveis nos 3 tipos de açúcares. ASSAY DO HEXOSE, 6-DEOXYHEXOSE ASSAY, ASSAY DE HEPTOSE. Laboratório De Hancock. - [Assays Lidos Do Hidrato de carbono] |
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CGH do DNA etiquetado direto do teste contra o
protocolo normal do DNA -
http://waldman.ucsf.edu/Protocols/directcgh.html Categoria: Protocolos Do Cytogenetics Este protocolo de CGH é usado para o DNA da qualidade boa quando disponível em quantidades suficientes. Nós geralmente replicate hybridizations usando as amostras etiquetadas "inversa" (invertendo a etiqueta para o teste e DNA's normais). Se o artifact apreciável ocorrer, a seguir as etiquetas alternativas estão tentadas. - [CGH lido do DNA etiquetado direto do teste contra o protocolo normal do DNA] |
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Clonality - protocolo do assay do inactivation do
chromosome de X -
http://cgap-mf.nih.gov/Protocols/DNARNAProteomicAnalysis/DNA/DNAProtocols/Clonality.html Categoria: Genetics e Genomics: Protocolos Do Genetics Do Cancer Os investigators podem utilizar o inactivation do chromosome de X (methylation) para determinar o status do clonality de um tumor ou de um lesion premalignant nas fêmeas. A técnica é baseada em um enzyme da limitação e em uma análise methylation-sensíveis de um locus polymorphic no chromosome de X. As populações clonal da pilha mostrarão a "perda" do allele non-non-methylated depois que sumário da limitação. O assay pode ser executado no DNA recuperado de microdissected amostras. o tecido congelado e o tecido fixo-encaixado podem ser usados. - [Clonality Lido - Protocolo Do Assay Do Inactivation Do Chromosome De X] |
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Cryopreservation de pilhas de cultura mammalian:
Preparação e recuperação do protocolo das amostras -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4350 Categoria: Protocolos Da Cultura De Pilha: Armazenar da pilha e protocolos congelando-se da pilha O protocolo fornece métodos para thawing cryofreezing e subseqüente de pilhas mammalian. as pilhas Pre-pre-confluent trypsinized, pelleted, resuspended no media congelando-se, e são congeladas gradualmente. Quando necessitadas, as pilhas congeladas thawed rapidamente sob a água funcionando da torneira e são transferidas ao media do crescimento. - [Cryopreservation lido de pilhas de cultura mammalian: Preparação e recuperação do protocolo das amostras] |
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Potency de CYP1A1-Inducing e teste na linha da pilha
do hepatoma do rato HEPA-1 - http://embryo.ib.amwaw.edu.pl/invittox/prot/112.htm
do cytotoxicity Este bioassay utiliza (Hepa-1) pilhas cultivadas do hepatoma do rato Hepa-lclc7 para avaliar o potency de CYPlA1-inducing ou o cytotoxicity de produtos químicos puros do teste ou de amostras ambientais. No teste da indução de Hepa-l, o potency de CYPlA1-inducing da amostra do teste é detectado como o hydroxylase aryl aumentado do hidrocarboneto (AHH) e as atividades de 7-ethoxyresorufin O-deethylase (EROD). - [potency de CYP1A1-Inducing e teste lidos do cytotoxicity na linha da pilha do hepatoma do rato HEPA-1] |
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Protocolo de Cytokine ELISA -
http://www.bdbiosciences.com/pharmingen/protocols/Cytokine_ELISA.shtml Categoria: Sinalizando Protocolos De Transduction Do Sinal: Protocolos De Cytokine Antibody da captação, obstrução, padrões e amostras, antibody da deteção, sugestões úteis de Cytokine ELISA. Biosciences de BD. - [Protocolo Lido De Cytokine ELISA] |
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Tratar da contaminação do extravasamento em PCR:
Um Protocolo Enzymatic Da Estratégia -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4092 Categoria: Protocolos de PCR Protocolo para tratar da contaminação do extravasamento na estratégia enzymatic de PCR-. Uso repetido de PCR e manipulação de seus aerossóis da causa dos produtos que podem contaminar amostras neighboring e áreas de trabalho. Tal do "contaminação extravasamento" pode ser impedida incluindo o dUTP no lugar do dTTP para todas as reações do amplification. - [tratar lido da contaminação do extravasamento em PCR: Um Protocolo Enzymatic Da Estratégia] |
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Detecte e quantitate MicroRNA em amostras de
Microdissection da captação do laser -
http://www.ambion.com/techlib/tn/131/6.html Três jogos de Ambion foram usados quantitate miRNAs específicos e detectar a expressão diferencial do miRNA em várias regiões do cérebro do rato e nos tipos da pilha isolados pelo microdissection da captação do laser (LCM). Estas técnicas podem ser aplicadas a estudar o miRNA em outros espécie, tecidos, e tipos da pilha. Inclui: Obtenha Amostras De Microdissected Da Captação Do Laser; Isole o miRNA das amostras de LCM; Quantitate o miRNA por qRT-PCR. - [lido detecte e quantitate MicroRNA em amostras de Microdissection da captação do laser] |
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Detecte e quantitate MicroRNA em amostras de
Microdissection da captação do laser -
http://www.ambion.com/techlib/tn/131/6.html Categoria: Protocolos Da Tecnologia De RNAi Informação em como detecte e quantitate MicroRNA em amostras do microdissection da captação do laser. Inclui: Obtenha Amostras De Microdissected Da Captação Do Laser; Isole o miRNA das amostras de LCM; Quantitate o miRNA por qRT-PCR; Deteção do miRNA no tecido de Microdissected do cérebro do rato por qRT-PCR; A expressão diferencial de MicroRNA no tecido inteiro do cérebro comparou a uma população mais homogênea das pilhas. - [lido detecte e quantitate MicroRNA em amostras de Microdissection da captação do laser] |
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A deteção dos autoantibodies com os tetramers
radiolabeled deMontagem do antígeno protocola -
http://www.natureprotocols.com/2007/01/29/detection_of_autoantibodies_wi.php Categoria: Immunology Protocolo para a deteção dos autoantibodies com os tetramers radiolabeled demontagem do antígeno. Detalhes como produzir tetramers radiolabeled do antígeno-streptavidin para a deteção dos antibodies pelo immunoprecipitation. Opcionalmente, os tetramers do antígeno podem ser desnaturados para comparar respostas ao antígeno dobrado e unfolded no mesmo sistema. Esta técnica pode ser aplicada a um número grande ou pequeno das amostras, e uma amostra dada pode simultaneamente assayed com antígenos múltiplos. - [deteção lida dos autoantibodies com protocolo radiolabeled deMontagem dos tetramers do antígeno] |
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Deteção dos fungos por Fluorescence Microscopy
usando os brighteners fluorescentes -
http://www.aspergillus.org.uk/indexhome.htm?secure/laboratory_protocols/./flbr.html~main Categoria: Protocolos Do Microscopy: Protocolos Do Microscopy Do Fluorescence Determinadas tinturas fluorescentes tais como Blankophor têm uma afinidade elevada para o b - os polysaccharides glycosidically ligados tais como o glucan e o chitin, que são principais os constituents da parede de pilha fungal. Conseqüentemente, estas tinturas fluorescentes podem ser usadas para amostras clínicas da seleção para a presença de elementos fungal. Este procedimento pode ser executado usando os seguintes espécimes: Prego, pele, líquido de lavage alveolar bronchial, sputum e biopsies. - [deteção lida dos fungos por Fluorescence Microscopy usando brighteners fluorescentes] |
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Isolação do DNA IQ do DNA de Genomic das manchas e
do protocolo oral dos cotonetes -
http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4098 Neste protocolo, a capacidade DNA-ligando de partículas de MagneSil do wizard é usada capturar e liberar uma quantidade consistente de DNA (100 ng) através de uma escala larga das amostras. No fim do procedimento, o DNA eluted no amortecedor do elution de 100 µl para dar uma concentração final de 1 ng/µl, aliviando a necessidade para o quantitation do DNA do postpurification. - [isolação lida do DNA IQ do DNA de Genomic das manchas e do protocolo oral dos cotonetes] |
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Assay laddering do DNA para as pilhas tratadas - http://www.celldeath.de/apometh/dnaladd.html Categoria: Biologia da pilha e cultura de pilha: Protocolos De Apoptosis O DNA que laddering pode ser detectado das amostras com pilhas apoptotic de somente 8%. Alternativamente, as pilhas podem ser manchadas com DAPI e ser analisadas pelo fluxo cytometry. CellDeath.de - [assay laddering lido do DNA para pilhas tratadas] |
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Protocolo Do Assay
DNA-Methyltransferase-Methyltransferase -
http://www.mdanderson.org/departments/methylation/display.cfm?id=9B5B6082-C53A-4A86-BEE3EE149A52251E&method=displayFull&pn=A3F15D82-C9B4-41CD-BA4BE767E50A73D2 Categoria: Protocolos Da Modificação Do Ácido Nucleic: Protocolos Do Methylation do Dna Protocolo para o assay DNA-methyltransferase-methyltransferase. Inclui: Homogenize Cells/Tissues; Quantitate A Concentração Da Proteína; Dilua Amostras; O Assay Apropriado; Pesquisa de defeitos. - [Protocolo Lido Do Assay DNA-Methyltransferase-Methyltransferase] |
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Assay Enzyme-Ligado do immunoSorbent (ELISA) para o
protocolo de NGF -
http://crutcherlab.med.uc.edu/ELI.htm Categoria: Immunology: Immunoassays Protocolo para o assay de ELISA para NGF. Inclui: ABSORPTION DO SERUM DE POLYCLONAL E DE PREIMMUNE; OBSTRUÇÃO; PREPARAÇÃO DA AMOSTRA; PREPARAÇÃO DE PADRÕES DE NGF; RECUPERAÇÃO DE PROTEÍNA; PROJETANDO A PLACA; APLICANDO OS PADRÕES E AS AMOSTRAS; APLICANDO O MONOCLONAL; APLICANDO O ANTIBODY SECUNDÁRIO; APLICANDO STREPTAVIDIN; DESENVOLVIMENTO DE CHROMAGEN; LENDO A PLACA. - [assay Enzyme-Ligado lido do immunoSorbent (ELISA) para o protocolo de NGF] |
Extração De Clorofórmio Ácida Do Phenol Da Isolação do RNA Do Thiocyanate De GuanidiniumUm protocolo da isolação do RNA da única etapa usando a extração de clorofórmio do phenol e o thiocyanate ácido de Guanidinium. Este método da isolação do RNA usa o fato que o thiocyanate do guanidinium pode simultaneamente lyse as pilhas e RNAses celular inativo durante a etapa inicial da isolação do RNA permite uma única etapa no método. |
Em Vitro Protocolo Traduzido Do Assay Do Kinase Do MOS De XenopusEm Vitro Protocolo Traduzido Do Assay Do Kinase Do MOS De Xenopus. Em resposta ao progesterone, os oocytes immature de Xenopus amadurecem-se aos ovos que podem fertilized. O kinase de proteína do MOS é essencial para o maturation do oocyte, muito provável devido a sua abilidade de ativar a cascata do kinase do MAPA. Esta cascata do kinase do MAPA conduz eventualmente à ativação de Cdc2/cyclin B e entrada na fase de M. Neste protocolo, o kinase etiquetado do MOS é traduzido em vitro, immunopurified, e usado em um assay do kinase. |
Protocolo Rápido Do Electrophoresis Do Gel Do Agarose do Dna.Um protocolo rápido e simples para o electrophoresis de fragmentos do DNA usando gels do agarose. |
Spectroscopy de absorption e quantificação do protocolo phage filamentousAo contrário do phage esférico, tal como T4 e?, quais têm relações aproximadamente iguais do peso da proteína ao DNA, o phage filamentous tem aproximadamente seis vezes mais proteína do que o DNA; a proteína contribui conseqüentemente substancialmente ao spectrum de absorption. |
o amplification 3' rápido do DNA termina a RAÇA usando o protocolo de PCRo amplification 3' rápido do DNA termina a RAÇA usando o protocolo de PCR. Este protocolo contem as etapas para o amplification rápido do fim 3' do mRNA por PCR. O DNA da primeiro-costa synthesized do total ou poly(A+) do RNA aprontando da cauda poly-A-Um do mRNA usando um primer do adaptador do oligo (descolamento). O DNA é amplificado então através de PCR usando um primer gene-específico e um primer do adaptador. |
Assay Da Atividade Do Kinase Do Histone H1Protocolo Do Assay Da Atividade Do Kinase Do Histone H1. Este protocolo descreve assaying a atividade do kinase de um kinase putative usando o histone H1 como a carcaça. O histone H1 é a carcaça canônica do kinase neste tipo de assay. O phosphorylation do histone H1 é avaliado pelo electrophoresis do gel de SDS-SDS-Polyacrylamide seguido pelo autoradiography. |
Electrotransformation de BMH 81-17mut S para isolar mutants Local-Dirigidos do dsDNAEste protocolo descreve o electroporation da tensão do mut S de BMH 81-17 que é recomendada para o tranformation do local dirigiu o mutagenesis do dsDNA (veja o protocolo no mutagenesis Local-Dirigido no DNA encalhado dobro). O mut S de BMH 81-17 é um reparo da mau combinação defeituoso (tensão de coli de escherichia do mut S). A probabilidade que os dois mutations querem o cosegregate durante o primeiro círculo do replication do DNA é aumentada nesta tensão. |
Protocolo Electrophoretic Da Reação De SHIFT Do Gel Da Mobilidade de EMSAProtocolo Electrophoretic Da Reação De SHIFT Do Gel Da Mobilidade de EMSA. |
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