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Predição da estrutura da proteína

As ferramentas de Bioinformatic podem prever a estrutura de uma proteína em 2 dimensões (2-D) ou em três-dimensões (3-D). Esta não pode ser uma respresentação real da estrutura real de uma proteína, porém é um bom ponto de partida para prever bolsos enzymatic, e de domínios da interação da proteína-proteína. Após a predição, a confirmação da estrutura da proteína pode ser feita usando técnicas do cristalografia do raio X.

Programas de Bioinformatic usados para prever a estrutura secundária:

(Veja por favor nossa proteína estruturar a base de dados das ferramentas de Bioinformatic da predição para a 2-D predição;

e a predição Bioinformatic da estrutura da proteína utiliza ferramentas a base de dados para a predição 3-D. ; e nossa base de dados para recuperar dados da estrutura da proteína das bases de dados 3-Dimensional.

Os dados experimentais podem ser usados para ajudar na estrutura da proteína da predição. Os seguintes são as experiências que podem ajudar na análise de estrutura da proteína:

- Localização de ligações de bissulfeto (forneça limitações apertadas na posição dos cysteines no espaço)

- Dados da espectroscopia que podem dar indícios à composição da estrutura secundária de sua proteína do interesse

- Experiências dirigidas local do mutagenesis, (substituindo a alanina Alá para vários ácidos aminados e verific então a função da proteína) que podem dar a introspecção importante aos resíduos que são importantes no local ativo de uma enzima ou de uns locais obrigatórios de interação ou de uns domínios da proteína-proteína.

- Obtenha dados experimentais de modifictions borne-translational (os locais por exemplo do phosphorylation e do glycosylation podem sugerir os resíduos que devem ser externamente acessíveis e assim podem ser resíduos de superfície)

- Locais Proteolytic da segmentação.

Manter estes dados na mente quando conduzir a predição da estrutura da proteína é importante, como isto é os dados estruturais que foram experimentally.0 provados

Pergunta se as predições da estrutura concordam com os resultados experimentais. Isto pode testar a validez das estruturas previstas da proteína.