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Predição Da Estrutura Da Proteína

As ferramentas de Bioinformatic podem predizer a estrutura de uma proteína em 2-dimensions (2-D) ou em três-dimensões (3-D). Esta não pode ser uma respresentação real da estrutura real de uma proteína, porém é um ponto começar bom para predizer bolsos enzymatic, e de domínios da interação da proteína-proteína. Após a predição, a confirmação da estrutura da proteína pode ser feita usando técnicas do crystallography do raio X.

Os programas de Bioinformatic usaram-se predizer a estrutura secundária:

(veja por favor nossa proteína estruturar a base de dados das ferramentas de Bioinformatic da predição para a 2-D predição;

e a predição Bioinformatic da estrutura da proteína dirige a base de dados para a predição 3-D.; e nossa base de dados para recuperar dados da estrutura da proteína das bases de dados 3-Dimensional.

Os dados experimentais podem ser usados ajudar na estrutura da proteína da predição. Os seguintes são as experiências que podem ajudar na análise da estrutura da proteína:

- localization de ligações de bissulfeto (forneça restraints apertados na posição dos cysteines no espaço)

- dados do spectroscopy que podem dar indícios à composição secundária da estrutura de sua proteína do interesse

- as experiências dirigidas local do mutagenesis, (substituindo a alanina um ala para vários aminos-ácido e verificando então a função da proteína) que pode dão a introspecção importante aos resíduos que são importantes no local ativo de um enzyme ou de uns locais obrigatórios de interação ou de uns domínios da proteína-proteína.

- obtenha dados experimentais de modifictions borne-post-translational (os locais por exemplo do phosphorylation e do glycosylation podem sugerir os resíduos que devem ser externamente acessíveis e assim podem ser resíduos de superfície)

- locais proteolytic do cleavage.

Manter estes dados na mente quando conduzir a predição da estrutura da proteína é importante, como isto é os dados estruturais que foram experimentally.0 provados

Pergunta se as predições da estrutura concordam com os resultados experimentais. Isto pode testar a validez das estruturas preditas da proteína.