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Tipos de proteína Microarray e de microplaquetas do antibody

Proteína e antibody Microarrays

Microplaquetas da proteína e antibody Microarrays - corrediças de vidro, Microwell/Nanowell

            Dois formatos principais da microplaqueta da proteína são usados agora, including as corrediças de vidro e os nanowells (8.27).  devido às quantidades grandes de métodos do adherence da corrediça somente os tipos os mais comuns e os mais principais serão mencionados aqui.
            É importante que as microplaquetas da proteína retêm proteínas em um estado ativo em densidades elevadas, é compatível com a maioria arrayers e de varredores comerciais, e pode ser imprimido em tal forma que as proteínas remanescem em um ambiente moisturized (8.27). (Veja Figura 2).

Microplaquetas Da Corrediça De vidro
As corrediças de vidro têm a vantagem que são compatíveis com equipamento microarray padrão e equipamento da deteção usados para microplaquetas do DNA.  São também barata.  A maioria dos estudos está usando agora as corrediças de vidro.  Entretanto, têm uma taxa elevada da evaporação e são suscetível ao cross-contamination possível (8.27). 
            As primeiras estratégias para a criação de disposições da proteína no vidro foram desenvolvidas por Mirzabekov et por al..  As disposições foram produzidas por proteínas immobilizing nos bolsos minúsculos do gel que foram unidos à superfície de vidro.  Uma variedade dos immunoassays, a deteção do antígeno, e os assays enzymatic foram realizados.  devido à estrutura da matriz 3D, immobilization da proteína era muito eficiente (28-30). 
Em um outro estudo, as proteínas foram unidas a uma superfície de vidro ativada com um agente crosslinking que reagisse com os amines preliminares (31).  As proteínas foram manchadas em uma solução do glycerol de 40% que mantivesse proteínas em um ambiente molhado e impedisse a desidratação.  Para determinar que seus microarrays da proteína eram praticáveis para assays biochemical, testaram três interações sabidas da proteína-proteína, três reações sabidas da kinase-carcaça, e três interações sabidas da proteína-ligand usando proteínas fluorophore-etiquetadas, ATP radiolabeled, e os ligands sintéticos acoplados à albumina fluorescently etiquetada do serum de Bovídeos (BSA), respectivamente.  Em a maioria das experiências, um pequeno número de proteínas foram manchadas entretanto em uma experiência que identificaram um único ponto dentro de uma disposição de 10.000 pontos que contêm outra uma proteína.  Este trabalho demonstrou o potencial de microarrays da proteína em assays biochemical em grande escala entretanto que seu estudo analisou um número muito pequeno das proteínas e as atividades da novela não foram identificadas.
Um outro estudo usou as corrediças de vidro para a deteção de diversos antígenos da proteína.  Os analytes foram manchados em uma superfície de vidro tratada na densidade elevada usando um dispositivo mão-manchando-se ou um robô microarray.  Os analytes manchados foram detectados usar os antibodies unidos a um primer do oligonucleotide e a uma reação do amplification do círculo do rolling.  A técnica teve uma sensibilidade elevada, uma escala dinâmica larga, e o reproducibility excelente do ponto-à-ponto
(32).
A maioria de grupos agora põem diretamente proteínas e os antibodies nas corrediças de vidro lisas (31.33-35) e em manchar-se são realizados em um ambiente umidade-controlado (8).

Microplaquetas De Microwell/Nanowell
            Compatível com alinhamento padrão microarray e da deteção do equipamento entretanto é requerido.  Este método é versatible para assays e reações solução-baseados do múltiplo-componente.  A evaporação é reduzida e não há nenhum cross-contamination.  Também estas microplaquetas são relativamente baratas (8.27).
Zhu et al., fabricados uma estrutura aberta, a saber nanowells em uma superfície do polydimethylsiloxane (PDMS) suportada pelas corrediças de vidro padrão (36). 
Estas microplaquetas consistem em uma disposição dos microwells em um elastomer descartável do silicone, poly(dimethylsiloxane) (PDMS) (37). As disposições de Microwell permitem que os volumes pequenos de analytes diferentes sejam embalados densa em uma única microplaqueta, contudo remanescem segregadas fisicamente durante processar de grupo subseqüente. As proteínas foram unidas covalently aos poços usando um crosslinker 3-glycidoxypropyltrimethoxysilane (GPTS) (38).
As moléculas capturadas podem fàcilmente ser recuperadas dos nanowells.  Quando coberto com o ouro nos nanowells, espera-se que as análises do resonance do plasmon do spectrometry maciço e da superfície do elevado-high-throughput podem ser executadas.  A desvantagem a mais grande desta técnica é que specialzed o equipamento é requerida para carregar os nanowells na densidade elevada (8.27). 

Em seguida: Métodos do acessório da proteína e do antibody - criação de uma microplaqueta de Microarray

 

Vá para trás:

Introdução e fundo às microplaquetas da proteína e às microplaquetas do antibody.

Referências para a proteína e o antibody Microarrays

 




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