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Proteína e antibody Microarrays
Disponibilidade dos antibodies
Um outro desafio às disposições do antibody
deve obter antibodies de encontro ≥ às 100.000 proteínas
que compreendem o proteome humano. Há atualmente uma
fração muito pequena dos antibodies disponíveis do proteome. Além, o specificity de muitos destes antibodies é
documentado deficientemente e os antibodies adicionais podem ser
requeridos a
permita a deteção de modificações
borne-post-translational. A deteção das proteínas por
interações–do antígeno do antibody é caracterizada
também por uma escala larga do specificity e da afinidade. Também, é difícil obter um jogo grande do antibody
altamente específico
moléculas. Conseqüentemente, a maioria de
disposições do antibody são limitadas em seu uso e contêm alguns
agentes well-defined da captação dirigidos em uma classe particular
dos marcadores da proteína (9.17)
- para não agir glycosylation similar
Outros problemas que enfrentam o antibody
Microarrays e soluções possíveis
As estratégias classical da geração do antibody
pelo immunization animal parecem ser pouco práticas. As
bibliotecas recombinant do indicador do antibody são mais
prometedoras (59-61). Recentemente, muitos métodos recombinant
de gerar antibodies foram investigados.
Estes incluem phage antibody-indicam, indicador do ribosome,
SELEX (evolução sistemática dos ligands pelo enriquecimento
exponencial), indicador do mRNA, e indicador affibody, que foram
desenvolvidos para avançar a produção dos antibodies e/ou dos
imitadores do antibody (16.54.56.62). Estes métodos
todos envolvem a construção de repertoires grandes das regiões
viable com a atividade obrigatória potencial, que são selecionadas
então por círculos múltiplos de purifications da afinidade. O
candidato clones pode mais mais ser selecionado usando a seleção do
maturation que melhora afinidaoes obrigatórias. Entretanto, um sistema ideal da seleção, que seja custo
rápido, robust, sensível, baixo, automatizado, e minimizado, deve
ser tornado ainda inteiramente (16.54). Estes fragmentos
menores do antibody geralmente diminuíram o cross-reactivity e
propriedades similares em cima do acessório (7.8.9.27).
O também porque os antibodies recombinant têm uma afinidade
potencial elevada, specificity elevado, e seu peso molecular menor,
que é geralmente o kDa aproximadamente 30 quando os antibodies
non-non-recombinant forem o kDa aproximadamente 150, acessório denso
e orientado às superfícies da sustentação é facilitado (63.64).
Os antibodies não são as únicas moléculas que podem ligar
proteínas. Aptamers é os oligonucleotids curtos que
podem ligar e crosslink proteínas covalent do alvo. Isto
facilita
condições mais elevadas da lavagem do stringency que
promove a deteção do emperramento específico. Além
disso, estas moléculas fàcilmente são selecionadas, postas, e
synthesized. O alvo purified da proteína é uma
exigência para seu uso entretanto, e os aptamers podem exibir
emperramento inclinado enquanto RNAs tende a ser carregado altamente
negativamente (9). Um grupo (Somalogic) usou recentemente o
aptamer anti-humano immobilized do immunodeficiency virus-gp120
detectar concentrações subnanomolar da proteína do alvo no serum
humano de 5% (65).
Em seguida: Métodos e análise de deteção de Microarray da proteína
Referências para a proteína e o antibody Microarrays
Para trás a:
Introdução e fundo às microplaquetas da proteína e às microplaquetas do antibody.
Tipos de microplaquetas do antibody e da proteína
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