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Similaridade da seqüência que procurara ferramentas
| EXPLOSÃO - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ Ferramenta local básica da busca do alinhamento; recupere as seqüências similares a sua pergunta. - [Lido mais EXPLOSÃO] |
| Filtro da EXPLOSÃO - http://darwin.nmsu.edu/cgi-bin/blast_filter.cgi Uma ferramenta que use análises da EXPLOSÃO para montar um jogo das seqüências de uma única seqüência da pergunta. Os usuários podem personalizar as réguas que actuam para filtrar para fora determinadas seqüências do jogo cheio de resultados da EXPLOSÃO. - [Lido mais filtro da EXPLOSÃO] |
| COSTELETA - http://www.rostlab.org/services/CHOP/ DESBASTE toma uma seqüência da proteína como a entrada, e retorna uma lista de fragmentos da seqüência da proteína com homology aos domínios do PDB e do Pfam e às proteínas da base de dados de SWISS-PROT. - [Lido mais COSTELETA] |
| eBioinformatics - http://www.ebioinformatics.org/ Este local fornece diversas ferramentas de software da bioinformática empacotadas junto para a instalação fácil em computadores de MacOSX. O software inclui ferramentas de NCBI, GRAVA-AS, ClustalW, Staden, T-Café e Primer3. - [Lido mais eBioinformatics] |
| GRAVE - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Série diversa das ferramentas para a análise da seqüência; muitos programas análogos a GCG; ajuda context-sensitive para cada ferramenta. - [Lido mais GRAVE] |
| Programas de FASTA - http://fasta.bioch.virginia.edu/ Ferramentas da recuperação e da comparação da seqüência. - [Lido mais programas de FASTA] |
| GeneMatcher - http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/services/genematcher_e.php O GeneMatcher é um computador especializado executando métodos intensivos do cálculo na bioinformática. Tem 6912 processadores de dados especializados que permitem que de outra maneira computacionalmente as buscas proibitivas sejam funcionadas rapidamente paralelamente. - [Lido mais GeneMatcher] |
| HMMER - http://bioweb.pasteur.fr/seqanal/motif/hmmer-uk.html HMMER é uma execução de métodos do perfil HMM para buscas de base de dados sensíveis usando alinhamentos múltiplos da seqüência como perguntas. - [Lido mais HMMER] |
| EXPLOSÃO de WU - http://blast.wustl.edu/ Ferramenta local básica da busca do alinhamento da universidade de Washington - [lido mais EXPLOSÃO de WU] |
| YASS - http://bioinfo.lifl.fr/yass/index.php a ferramenta genomic da busca da similaridade baseada na transição confinou sementes espaçadas - [lido mais YASS] |
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