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Ferramentas do alinhamento e do visualização da seqüência
| BoxShade - http://www.ch.embnet.org/software/BOX_form.html Impressão e protecção de limas múltiplas do alinhamento. - [Lido mais BoxShade] |
| Server de CHAOS/DIALIGN WWW - http://dialign.gobics.de/chaos-dialign-submission O server de CHAOS/DIALIGN WWW é um local múltiplo do alinhamento da seqüência que passe seqüências de entrada com o CAOS para criar uma lista de similarites locais. Estas similaridades serem como pontos de escora, permitindo que DIALIGN conduza alinhamentos globais mais rapidamente. O ABC pode - [lido mais server de CHAOS/DIALIGN WWW] |
| GRAVE - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Série diversa das ferramentas para a análise da seqüência; muitos programas análogos a GCG; ajuda context-sensitive para cada ferramenta. - [Lido mais GRAVE] |
| GeneDoc - http://www.psc.edu/biomed/genedoc/ Editor do alinhamento da seqüência, analisador e utilidade múltiplos da protecção para Windows. - [Lido mais GeneDoc] |
| GraphAlign - http://darwin.nmsu.edu/cgi-bin/graph_align.cgi Fornece respresentações gráficas de alinhamentos globais de ClustalW por pares para a pergunta e de seqüências sujeitas do tipo buscas da EXPLOSÃO. A respresentação gráfica fornece a informação em seções da alta qualidade do alinhamento global. - [Lido mais GraphAlign] |
| ALEGRIA - http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/~joy/ Programa para indicar a informação 3D estrutural em um alinhamento múltiplo da seqüência. - [Lido mais ALEGRIA] |
| Malva - http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php O malva é uma ferramenta de software autônoma para construir alinhamentos múltiplos do genoma. - [Mais malva lidos] |
| Seaview - http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview.html SeaView é um editor múltiplo gráfico do alinhamento da seqüência que possa ler e escrever vários formatos do alinhamento (NEXO, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE). Reserva editar manualmente o alinhamento, e funcionar igualmente programas de DOT-PLOT ou de CLUSTALW ao local - [lido mais Seaview] |
| SequenceJuxtaposer - http://www.cs.ubc.ca/~tmm/papers/sj/ SequenceJuxtaposer é uma ferramenta para visualizar e comparar seqüências biomoleculares. Usa uma técnica do visualização chamada o desenho do acordeão que permite que os usuários zumbam em regiões de interesse nos alinhamentos. - [Lido mais SequenceJuxtaposer] |
| SeqVISTA - http://zlab.bu.edu/SeqVISTA/ Ferramenta para o visualização e a comparação da característica da seqüência; integra com Internet Explorer; aceita as limas lisas de GenBank, HTML de GenBank, limas de FASTA; os encaixes existem para o visualização da saída de RepeatMasker, de PsiPred, e de Cister. - [Lido mais SeqVISTA] |
| CINTA - http://www.charite.de/bioinf/strap/ O programa estrutural do alinhamento para proteínas (CINTA) é um programa java-baseado que possa ser funcionado sobre o Web usando um navegador permitido começo do Web de Java ou ser transferido e funcionamento como uma aplicação autônoma. Os alinhamentos podem ser feitos usando um de diversos métodos, inc - [lido mais CINTA] |
| WAViS - http://wavis.img.cas.cz/ O server do visualização do alinhamento do Web (WAViS) fornece várias ferramentas do Web para realçar a apresentação de alinhamentos múltiplos da seqüência do ácido aminado ou do nucleotide. - [Lido mais WAViS] |
| WebLogo - http://weblogo.berkeley.edu/ WebLogo permite que um crie respresentações gráficas (logotipos da seqüência) de alinhamentos múltiplos da seqüência. Isto pode ser feito do Web site e o código fonte para WebLogo está igualmente disponível para transferência. - [Lido mais WebLogo] |
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