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Por pares ferramentas de alinhamento
| Dotlet - http://www.isrec.isb-sib.ch/java/dotlet/Dotlet.html A ferramenta do lote do ponto com muito útil aprende por interpretações do exemplo de saídas de amostra. - [Lido mais Dotlet] |
| Dotter - http://www.cgb.ki.se/cgb/groups/sonnhammer/Dotter.html Dotter é um programa da matriz de pontos com rendição greyscale interativa para a análise genomic da seqüência do ADN e da proteína. - [Lido mais Dotter] |
| eBioinformatics - http://www.ebioinformatics.org/ Este local fornece diversas ferramentas de software da bioinformática empacotadas junto para a instalação fácil em computadores de MacOSX. O software inclui ferramentas de NCBI, GRAVA-AS, ClustalW, Staden, T-Café e Primer3. - [Lido mais eBioinformatics] |
| GRAVE - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/ Série diversa das ferramentas para a análise da seqüência; muitos programas análogos a GCG; ajuda context-sensitive para cada ferramenta. - [Lido mais GRAVE] |
| GeneMatcher - http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/services/genematcher_e.php O GeneMatcher é um computador especializado executando métodos intensivos do cálculo na bioinformática. Tem 6912 processadores de dados especializados que permitem que de outra maneira computacionalmente as buscas proibitivas sejam funcionadas rapidamente paralelamente. - [Lido mais GeneMatcher] |
| LAGAN - http://lagan.stanford.edu/lagan_web/index.shtml O conjunto de ferramentas do alinhamento de LAGAN consiste em componentes: CAOS (um alinhador por pares local aperfeiçoado para a não-codificação, e outras regiões deficientemente conservadas do genoma.), LAGAN (um programa por pares global altamente parametrizable do alinhamento), Multi-LAGAN, e baralhamento - [lido mais LAGAN] |
| MPSRCH - http://www.ebi.ac.uk/MPsrch Usa o algoritmo do Smith-Waterman; funcionamentos Explosão-como em velocidades sem sensibilidade perdedora. - [Lido mais MPSRCH] |
| PromoterWise - http://www.ebi.ac.uk/Wise2/promoterwise.html Compara duas seqüências do ADN permitindo inversão e translocations, ideal para promotores. - [Lido mais PromoterWise] |
| zPicture e multi-zPicture - http://zpicture.dcode.org/ o zPicture (por pares alinhamento) e multi-zPicture (alinhamento múltiplo) são ferramentas de alinhamento com suporte na internet da seqüência baseadas no programa do alinhamento do blastz. Os alinhamentos do zPicture podem automaticamente ser submetidos ao rVista. - [Lido mais zPicture e multi-zPicture] |
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