Alinhamento múltiplo da seqüência

Este conjunto de ferramentas é uma coleção de uma escala larga das ferramentas e das ligações para a análise da seqüência, a função, e a predição da estrutura. Este recurso oferece relações convienent do Web para muitas ferramentas livremente disponíveis. - [Lido mais conjunto de ferramentas da bioinformática]

Um server múltiplo do alinhamento da estrutura da proteína que crie todo-à-todo por pares alinhamento usando um programa combinatório da extensão e então usando Monte - métodos da optimização de Carlo conduz uma optimização global iterativa. Os resultados são formatados usando JO - [lido mais CE-MC]

O server de CHAOS/DIALIGN WWW é um local múltiplo do alinhamento da seqüência que passe seqüências de entrada com o CAOS para criar uma lista de similarites locais. Estas similaridades serem como pontos de escora, permitindo que DIALIGN conduza alinhamentos globais mais rapidamente. O ABC pode - [lido mais server de CHAOS/DIALIGN WWW]

Alinhamento múltiplo padrão da seqüência. - [Lido mais ClustalW]

Clustal X é uma versão do programa múltiplo do alinhamento da seqüência de Clustal W com uma relação gráfica. As cores do indicador permitem que as características conservadas sejam destacadas para a visão fácil no alinhamento. Está disponível para diversas plataformas, incluindo Wi - [lido mais ClustalX]

Programa múltiplo do alinhamento que monta um alinhamento global da seqüência dos alinhamentos abertura-livres do local por pares. Este método poderia ser especial útil ao comparar as grandes seqüências que têm somente similaridades locais. - [Lido mais DIALIGN]

Este local fornece diversas ferramentas de software da bioinformática empacotadas junto para a instalação fácil em computadores de MacOSX. O software inclui ferramentas de NCBI, GRAVA-AS, ClustalW, Staden, T-Café e Primer3. - [Lido mais eBioinformatics]

Série diversa das ferramentas para a análise da seqüência; muitos programas análogos a GCG; ajuda context-sensitive para cada ferramenta. - [Lido mais GRAVE]

Uma ferramenta para o sombreamento phylogenetic de seqüências múltiplas das espécies estreitamente relacionadas. Isto análises de alinhamentos múltiplos da seqüência pode ser usado para prever elementos funcionais putativos. - [Lido mais eShadow]

Server extensivo que possui uma escala larga das ferramentas para a descoberta do teste padrão em seqüências do ADN e da proteína e também no texto. As ferramentas para o alinhamento múltiplo da seqüência, a descoberta do gene, a anotação da proteína, e as outras aplicações igualmente existem neste server. Um detalhe - [lido mais grupo da bioinformática de IBM e da descoberta do teste padrão]

O conjunto de ferramentas do alinhamento de LAGAN consiste em componentes: CAOS (um alinhador por pares local aperfeiçoado para a não-codificação, e outras regiões deficientemente conservadas do genoma.), LAGAN (um programa por pares global altamente parametrizable do alinhamento), Multi-LAGAN, e baralhamento - [lido mais LAGAN]

O malva é uma ferramenta de software autônoma para construir alinhamentos múltiplos do genoma. - [Mais malva lidos]

Mulan é uma ferramenta de alinhamento múltipla da seqüência. Emprega algoritmos novos tais como o TBA e o multiTF para executar respectivamente alinhamentos e descobrir locais obrigatórios do fator da transcrição. Os resultados podem ideia como ponto-traçam de alinhamentos individuais da seqüência, ou - [lido mais Mulan]

O server de MyHits integra diversas ferramentas com um foco na anotação da proteína e a análise de domínios da proteína. Os usuários do convidado têm o acesso às ferramentas tais como ClustalW e T-Café e bases de dados como o Suíço-Prot, o Prosite e o Interpro. O registo permite-nos - [lido mais MyHits]

O programa estrutural do alinhamento para proteínas (CINTA) é um programa java-baseado que possa ser funcionado sobre o Web usando um navegador permitido começo do Web de Java ou ser transferido e funcionamento como uma aplicação autônoma. Os alinhamentos podem ser feitos usando um de diversos métodos, inc - [lido mais CINTA]

Ferramenta de alinhamento múltipla da seqüência para seqüências da proteína; mais exato do que ClustalW para seqüências com identidade menos de de 30%; na saída, os blocos conservados são cor codificada para indicar a qualidade do alinhamento. - [Lido mais T-COFFEE]

o zPicture (por pares alinhamento) e multi-zPicture (alinhamento múltiplo) são ferramentas de alinhamento com suporte na internet da seqüência baseadas no programa do alinhamento do blastz. Os alinhamentos do zPicture podem automaticamente ser submetidos ao rVista. - [Lido mais zPicture e multi-zPicture]