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Genomics Comparativo
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Página da anotação do genome da IBM - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Annotations/home.html As anotações Bio-Dicionário-baseadas da IBM da página terminada dos genomes alistam anotações para sobre 75 genomes completos (archae, bactérias, eurkaryotes, e vírus). Você pode perguntar estas anotações no nível da seqüência as.well.as search/compare através dos genomes. - [lido mais página da anotação do genome da IBM] |
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Genomes microbial integrados (IMG) - http://img.jgi.doe.gov/ O sistema microbial integrado dos genomes (IMG) facilita a comparação dos genomes arranjados em seqüência pelo instituto comum do genome (JGI). Pode ser procurarado usando keywords ou BLASTp, e os registros do gene diplayed incluem propriedades biochemical, domínios da proteína, - [genomes microbial mais integrados lidos (IMG)] |
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Base de dados arranjando em seqüência em grande
escala do projeto do ISC -
http://www.intlgenome.org/viewDatabase.cfm A base de dados arranjando em seqüência em grande escala arranjando em seqüência internacional do projeto do consortium (ISC) contem a informação em projetos arranjando em seqüência atuais e terminados, including timelines do projeto, em agências financiando, arranjando em seqüência a estratégia e as ligações para fora para projetar Web pages. - [lido mais base de dados arranjando em seqüência em grande escala do projeto do ISC] |
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Malva -
http://gel.ahabs.wisc.edu/mauve/documentation.php O malva é uma ferramenta autônoma do software para construir alinhamentos múltiplos do genome. - [ mais malva lido] |
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MIPS - http://mips.gsf.de/ O centro de informação de Munich para projetos das seqüências da proteína inclui: análise fungal do genome, bioinformatics do genome da planta, anotação estrutural do genomics, do proteomics e do genome. Os projetos e as bases de dados incluem: CYGD, MNCDB, NGFN, MPPI, SIMAP, QUIPOS, MATDB, M - [lido mais MIPS] |
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NEMBASE2 -
http://zeldia.cap.ed.ac.uk/nematodeESTs/nembase.html NEMBASE2 é um recurso da base de dados para séries de dados do EST para 37 espécies do nematode. As seqüências são aglomeradas ao redundacy do redunce. As comparações podem estar pela biblioteca e em um nível da seqüência; uma ferramenta do visualisation é incluída. Predições da região do coding para cada conjunto, - [lido mais NEMBASE2] |
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PartiGeneDB -
http://www.partigenedb.org/ PartiGeneDB é uma base de dados de aproximadamente 300 genomes parciais dos organismos eukaryotic que foram montados dos dados do EST. - [lido mais PartiGeneDB] |
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PhenomicDB -
http://www.phenomicdb.de/ PhenomicDB integra a informação do genotype e do phenotype de diversos organismos das origens dos dados de públicas. Traçar de campos de dados phenotypic permite a comparação cross-species do phenotype. - [lido mais PhenomicDB] |
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Sockeye -
http://www.bcgsc.ca/gc/bomge/sockeye/ Sockeye é uma ferramenta do visualization permitindo que uma monte e analise a informação genomic em um espaço de trabalho tridimensional. Pode ser usado ver características nos vários níveis, variando de SNPs aos karyotypes. Sockeye indica características genomic ao longo das trilhas - [lido mais Sockeye] |
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Ferramentas do software de TIGR -
http://www.tigr.org/software/ Uma lista dos pacotes de software da abr-fonte disponíveis para livre do instituto para a pesquisa de Genomic (TIGR). - [lido mais ferramentas do software de TIGR] |
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TraFaC -
http://trafac.cchmc.org/trafac/index.jsp TraFaC (comparação do local obrigatório do fator da transcrição) é uma ferramenta que as regiões regulatory dos identifes que usam uma análise comparativa da seqüência aproximem. - [lido mais TraFaC] |
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