Proteomic Bioinformatics

Várias ferramentas para a identificação e a caracterização da proteína, as buscas da similaridade, as buscas do teste padrão e do perfil, predição borne-post-translational da modificação, e mais. - [lido mais ferramentas de ExPASy Proteomics]

GELBANK é uma base de dados de 2D imagens do gel dos proteomes para espécies com genomes terminados. O usuário pode procurarar pela descrição ou pelo fragmento da seqüência, ou por características do gel. As ligações são feitas entre a seqüência e o gel quando disponíveis. - [lido mais GELBANK]

GoMiner organiza e permite o visualization de jogos grandes dos genes baseados em classificações de Ontology do gene. - [lido mais GoMiner]

A base de dados humana da referência da proteína (HPRD) é um recurso centralizado para a informação sobre proteínas humanas, as suas interações com outras proteínas humanas, e os relacionamentos da proteína-doença. A informação contida em HPRD é curated pelos peritos, que manu - [base de dados  mais humana lida da referência da proteína]

A iniciativa dos padrões de HUPO Proteomics (libra por polegada quadrada) fornece padrões da respresentação de dados para facilitar a troca, a comparação e o validation de dados do proteomics. - [lido mais iniciativa dos padrões de HUPO Proteomics]

As ferramentas desenvolvidas ao dae (dispositivo automático de entrada) na identificação do spectrum maciço que permitem o cálculo de valores maciços com distribuições isotopic basearam em fórmulas molecular, em peptides/proteins, em DNA/RNA, em seqüências do hidrato de carbono ou em combinações disso. Um visor para o visu - [lido mais ISOTOPICA]

As estruturas glycan das tomadas do matcher do hidrato de carbono de KEGG (KCaM) como a entrada e os retornos uma lista de estruturas glycan similares usando um algoritmo do alinhamento da árvore-estrutura. - [lido mais KCaM]

Identificação da proteína pela massa do peptide; documentação excelente; incorpora o código de MOWSE mas reserva mais métodos da busca em mais bases de dados da seqüência. - [lido mais MASCOT (ciência da matriz)]

Software e schemata para modelar, capturar e disseminating dados experimentais do proteomics - [lido mais PEDRo]

PeptIdent é uma ferramenta que permita a identificação das proteínas usando o pI, o Mw e dados maciços do fingerprinting do peptide. - [lido mais PeptIdent]

ProMoST (ferramenta da seleção da modificação da proteína) é um programa para calcular valores exatos do MW e do pI das proteínas que consideram os efeitos de modificações borne-post-translational. Os resultados são indicados como valores calculados do pI e do MW para cada proteína e são - [lido mais ProMoST]

ProSight PTM permite a identificação das proteínas e de suas modificações borne-post-translational (PTM) que usam os dados maciços dos spectra da fragmentação top-down do ` ' de íons intatos da proteína (isto é sem alguma digestão tryptic). - [lido mais ProSight PTM]

Várias ferramentas usadas para a base de dados da seqüência que mina em relação às experiências do spectrometry maciço. - [lido mais ProteinProspector]

Proteios é uma iniciativa para criar um armazenamento da abr-fonte, uma análise e um sistema da organização para experiências do proteomics. - [lido mais Proteios - a iniciativa aberta de Proteomics da fonte]

A base de dados da análise de Proteome em EBI fornece análises estatísticas e comparativas dos proteomes preditos dos organismos para que há uns genomes cheio-arranjados em seqüência. - [lido mais análise de Proteome em EBI]

O analista de Proteome é uma ferramenta do elevado-high-throughput para predizer propriedades para cada proteína em um proteome. O usuário fornece um proteome no formato do fasta, e o sistema emprega a Libra por polegada quadrada-explosão, o Psipred e o modelador para predizer a função da proteína e o localiza subcellular - [lido mais analista de Proteome]

ProteomicsSURF é dedicado para fornecer a informação do Web em tecnologias do proteomics e em seu proteomics aplicado. - [lido mais proteomicsSURF]

Ferramentas do software e bases de dados integradas para facilitar analisar a saída das experiências do spectrometry maciço da proteína. - [lido mais PROWL]

O projeto global da máquina de Proteome (GPM) facilita a análise dos proteomes para investigadores usando o spectrometry maciço em tandem. Os alvos do projeto incluem fornecer uma plataforma comum do validation e testar para resultados, fazendo aos resultados mais portab - [mais lido a máquina global de Proteome]