Ferramentas Da Identificação Da Proteína

AACompIdent. Identifique uma proteína por sua composição de amino-ácido. ExPASY. - [lido mais AACompIdent]

AACompSim é uma ferramenta que permita que a comparação da composição de amino-ácido de uma entrada do Suíço-Prot com todas entradas restantes do Suíço-Prot para encontrar as proteínas cujas as composições de amino-ácido são as mais próximas àquela da entrada selecionada. ExPASY. - [lido mais ferramenta de AACompSim]

Aldente. Identifique proteínas com dados do fingerprinting da massa do peptide. Uma ferramenta nova, rápida e poderosa que faça exame da vantagem da transformação de Hough para a recalibração dos spectra e a exclusão do outlier. ExPASy - [lido mais Aldente]

As tomadas de CysView como vários formatos anotados da entrada de seqüências da proteína, e indicam gràfica o cysteine que emparelha testes padrões. Agrupa também proteínas com testes padrões similares do connectivity do bissulfeto. - [lido mais CysView]

Prediga modificações borne-post-translational da proteína potencial e únicas substituições potenciais do amino-ácido nos peptides. As massas experimental medidas do peptide são comparadas com os peptides teóricos calculados de uma entrada especificada do Suíço-Prot. ExPASy - [lido mais FindMod]

Identifique os peptides que resultam do cleavage unspecific das proteínas de suas massas experimentais, fazendo exame em modificações químicas artefactual do cliente, modificações borne-post-translational (PTM), cleavage autolytic do protease. ExPASy - [lido mais FindPept]

O programa da análise do bissulfeto de Genomic (GDAP) prediz ligações de bissulfeto para uma seqüência user-supplied da proteína. GDAP fornece também o acesso às predições pre-computadas de ligações de bissulfeto para sobre 100 genomes microbial. - [lido mais GDAP]

Prediga as estruturas possíveis do oligosaccharide que ocorrem em proteínas de suas massas experimental determinadas (pode ser usado para oligosaccharides livres ou derivatized e para glycopeptides). ExPASy - [lido mais GlycoMod]

IsotopIdent. Prediz a distribuição isotopic teórica de um composto do peptide, da proteína, do polynucleotide ou do produto químico. - [lido mais IsotopIdent]

O LINKER é uma ferramenta para projetar seqüências do peptide do linker para o uso na construção de proteínas da fusão. O usuário fornece o comprimento desejado do linker em angstroms ou em número dos resíduos, e diversos outros confinamentes podem também ser especificados, inc - [lido mais LINKER]

Mascot. Impressão digital maciça do peptide, pergunta da seqüência e de íon de MS/MS busca ciência Ltd. da matriz, Londres. - [lido mais mascot]

MultiIdent. Identifique proteínas com pI, Mw, composição de amino-ácido, Tag da seqüência e dados maciços do fingerprinting do peptide. ExPASY. - [lido mais MultiIdent]

OMSSA. Identificação dos spectra do peptide de MS/MS procurarando bibliotecas de seqüências sabidas da proteína. - [lido mais OMSSA]

PepMAPPER. Ferramenta maciça de UMIST, Reino Unido do fingerprinting do peptide. - [lido mais PepMAPPER]

PepSea. Identificação da proteína pelo peptide que traçam ou pelo peptide que arranja em seqüência de Protana, Dinamarca - [lido mais PepSea.]

Massa Do Peptide. Calcule massas dos peptides e de suas modificações borne-post-translational para uma entrada de UniProtKB/Swiss-Prot ou de UniProtKB/TrEMBL ou para uma seqüência de usuário. ExPASY. - [lido mais massa do peptide]

Cortador do peptide. Prediz locais potenciais do protease e do cleavage e locais cleaved por produtos químicos em uma seqüência dada da proteína. ExPASY. - [lido mais Peptidecutter]

Cleaves uma seqüência da proteína com um enzyme escolhido e computa massas dos peptides gerados. - [lido mais PeptideMass]

PFMUTS. Mostra os únicos e mutations dobro possíveis de um fragmento do peptide do fingerprinting da massa do peptide de MALDI. - [lido mais PFMUTS]

Phenyx. Proteína e peptide identification/characterization dos dados de PMF e de MS/MS de GeneBio, Switzerland - [lido mais Phenyx]

Pro encontrado é Search Engine de Proteometrics para obter seqüências da proteína esse mais melhor fósforo uma lista de massas do peptide. Usa um algoritmo bayesian bem-testado identificar as proteínas baseadas em muitos critérios, como: - [ mais profundo lido.]

A proteína Info é Search Engine de Proteometrics que obtem as seqüências da proteína que combinam um motif particular da seqüência. Os fragmentos da informação da seqüência podem ser incorporados e todas as seqüências que combinam que o teste padrão em uma base de dados particular está recuperado. Proteína - [lido mais ProteinInfo]

Prospector Da Proteína. Uma variedade das ferramentas de UCSF (MS-Caiba, MS-Tag, MS-Digerem, etc..) para bases de dados minando da seqüência conjuntamente com experiências do spectrometry maciço. - [lido mais ProteinProspector]

Peso molecular do cálculo, pI teórico, composição de amino-ácido, composição atômica, coeficiente da extinção, half-life estimado, deslocamento predeterminado da instabilidade, deslocamento predeterminado aliphatic e média grande do hydropathicity. - [lido mais ProtParam]

PROWL. Chemistry de proteína e recurso do spectrometry maciço de Rockefeller e de universidades de NY - [lido mais PROWL]

O server que fornece diagramas da árvore do conjunto de uma proteína baseou nos átomos ou no hydrophobicity carregado de cada um de seus resíduos. O diagrama permite a inspeção visual da distribuição de regiões hydrophobic e carregadas nas proteínas. - [lido mais Qgrid]

O Search Engine do sonar MS/MS é Search Engine de Proteometrics para identificar proteínas usando a informação de MS/MS dos peptides do sumário. Foi projetado especificamente para as necessidades da automatização da identificação da proteína, usando conceitos da descoberta e projeta t - [lido mais Search Engine do sonar MS/MS.]

Identificação Do Tag. Identifique proteínas com pI, Tag do Mw e da seqüência, ou gere uma lista das proteínas perto de um pI e de um Mw. dados ExPASY. - [lido mais TagIdent]

Inclui estruturas e propriedades químicas, acessibilidade solvente, modificações borne-post-translational, e mais; com referências. - [mais lido o repositório do amino-ácido]