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| DTFAM - http://research.i2r.a-star.edu.sg/DRAGON/TFAM_v2/index.html O mineiro da associação do TF do dragão (DTFAM) é a ferramenta da texto-mineração que toma sumários/sumários de Pubmed como associações potenciais da entrada e dos relatórios entre fatores da transcrição e ontologies de diseases/GO. O usuário pode igualmente fornecer uma pergunta de PubMed diretamente a DTFA - [lido mais DTFAM] |
| Cálice - http://goblet.molgen.mpg.de/ O cálice permite que o usuário SOPRE um ou vário seqüências da proteína ou de nucleotide de encontro às bases de dados que têm as seqüências traçadas aos termos do Ontology do gene (VÁ). Os resultados podem ser vistos para seqüências individuais, ou como estatísticas do exame para o grupo se mais de um s - [lido mais cálice] |
| LOCtarget - http://www.rostlab.org/services/LOCtarget/ LOCtarget é uma ferramenta para prever, e uma base de dados de predições pre-computadas para, da localização sub-cellular de proteínas eukaryotic e prokaryotic. Diversos métodos são empregados para fazer as predições, incluindo a análise do texto de palavras-chaves de SWISS-PROT, NU - [lido mais LOCtarget] |
| MITOPRED - http://mitopred.sdsc.edu/ MITOPRED usa domínios de Pfam, valores do pI e composição de ácido aminado para prever proteínas mitochondrial nuclear-codificadas. As predições precomputed para um número de proteomes, e também para todas as seqüências Eukaryotic no Suíço-Prot e no TrEMBL. Os usuários podem - [lido mais MITOPRED] |
| PhenomicDB - http://www.phenomicdb.de/ PhenomicDB integra a informação do genótipo e do phenotype de diversos organismos das origens de dados públicas. O traço de campos de dados fenotípicos permite a comparação cross-species do phenotype. - [Lido mais PhenomicDB] |
| Phydbac2 - http://igs-server.cnrs-mrs.fr/phydbac/ Phydbac2 (indicador phylogenomic de genes bacterianos) é uma ferramenta para visualizar e explorar os perfis phylogenomic de seqüências bacterianas da proteína. O usuário seleciona umas ou várias proteínas/genes e Phydbac2 permite que o usuário ver a similaridade da seqüência através de 50 - [lido mais Phydbac2] |
| PRED-GPCR - http://bioinformatics.biol.uoa.gr/PRED-GPCR/ PRED-GPCR é uma ferramenta que as seqüências user-supplied das perguntas de encontro a uma base de dados de HMMs que corresponde à G-proteína acoplem famílias do receptor (GPCR) a fim determinar que família de GPCR a seqüência da pergunta se assemelha mais. - [Lido mais PRED-GPCR] |
| SDPpred - http://math.genebee.msu.ru/~psn/ SDPpred é uma ferramenta para prever que resíduos de uma proteína determinam diferenças funcionais relativo a seus homólogos. Toma como a entrada um alinhamento múltiplo da seqüência de uma família da proteína dividida nos grupos baseados no differenc funcional percebido - [lido mais SDPpred] |
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