Domínios da proteína e predição do motif

CHOP tomadas uma seqüência da proteína como a entrada, e os retornos uma lista de fragmentos da seqüência da proteína com homology aos domínios de PDB e de Pfam e às proteínas da base de dados de SWISS-PROT. - [lido mais CHOP]

Os conjuntos de grupos de Orthologous representam domínios conservados antigos da proteína; use a ferramenta de COGnitor encontrar COGS em ordem do interesse. - [lido mais COGs]

Ferramenta para a predição de locais funcionais da proteína eukaryotic que relata o domínio, o motif, e a informação do teste padrão da seqüência para sua seqüência de entrada. - [lido mais ELM: Recurso linear do motif de Eukaryotic]

FunShift é uma base de dados que armazene a classificação da subfamília de Pfam para famílias do domínio da proteína e as analise para mudanças funcionais usando taxas da substituição e SHIFT evolucionárias do conservation. - [lido mais FunShift]

Base de dados integrada das bases de dados geralmente usadas da assinatura (por exemplo PROSITE, das CÓPIAS, de ESPERTO, Pfam, ProDom); buscas do texto e seqüência-baseado. - [lido mais InterPro]

O server de MyHits integra diversas ferramentas com um foco na anotação da proteína e a análise de domínios da proteína. Os usuários do convidado têm o acesso às ferramentas tais como ClustalW e T-Café e bases de dados como o Suíço-Prot, o Prosite e o Interpro. O registo permite-nos - [lido mais MyHits]

Prediz o tipo locais do mucin de GalNAc O-glycosylation em proteínas mammalian. - [lido mais server da predição de NetOGlyc]

NRPS-PKS é uma ferramenta que compreende quatro bases de dados integradas para a análise de megasynthases multi-multi-enzymatic grandes do multi-domínio. O usuário pode submeter uma seqüência da pergunta à busca para domínios ou ver as propriedades dos produtos. - [lido mais NRPS-PKS]

Coleção de alinhamentos múltiplos da seqüência e dos modelos escondidos de Markov que cobrem muitos domínios comuns da proteína. - [lido mais Pfam]

Base de dados de locais experimental verificados do phosphorylation em proteínas eukaryotic. As anotações são feitas manualmente e as entradas da base de dados vêm de e são ligadas para trás à literatura científica. Phospho.ELM incorpora os dados encontrados anteriormente em PhosphoBase. - [lido mais Phospho.ELM]

PhosphoSite é a curated a base de dados em locais do phosphorylation do ser humano e do rato de vivo. A base de dados contem seqüências e posições dentro dos domínios e motifs para os locais do phosphorylation, e ligações do peptide aos recursos e às referências úteis da literatura. F - [lido mais PhosphoSite]

Base de dados das famílias e dos domínios da proteína definidos da base de dados de SwissProt; considere também verificar bases de dados específicas do motif tais como PhosphoBase. - [lido mais PROSITE]

Faça a varredura de sua seqüência de encontro à base de dados de PROSITE para motifs funcionais; considere também verificar bases de dados específicas do motif tais como PhosphoBase. - [lido mais ScanProsite]

SledgeHMMER é uma ferramenta para procurarar a base de dados de Pfam usando uma versão parallelized do hmmpfam do programa. O usuário pode executar perguntas com um ou mais seqüência de cada vez e então receber os resultados pelo E-mail. - [lido mais SledgeHMMER]

ESPERTA (ferramenta modular simples da pesquisa da arquitetura) é uma ferramenta do Web para a identificação e a anotação de domínios da proteína, e fornece uma plataforma para o estudo comparativo de arquiteturas complexas do domínio nos genes e nas proteínas. - [ MAIS ESPERTO lido]