Ferramentas de Bioinformatic da expressão de gene e da análise do Microarray.
| BiNGO - http://www.psb.ugent.be/cbd/papers/BiNGO/ O BiNGO é uma ferramenta Java-baseada para determinar que categorias do Ontology do gene (VÁ) overrepresented estatìstica em um jogo dos genes ou em um subgraph de uma rede biológica. - [Lido mais BiNGO] |
| APERTE - http://www.personal.psu.edu/faculty/n/h/nhs109/Clench/ Um programa para calcular a análise do enriquecimento do conjunto e o visualização integrado da expressão, a anotação e a transcrição fatoram dados do local obrigatório usando o Ontology do gene. - [Lido mais APERTE] |
| DAVID - http://david.niaid.nih.gov/ A base de dados para a anotação, o visualização e a descoberta integrada (DAVID) é uma ferramenta com suporte na internet que forneça soluções integradas para a anotação e a análise de genoma-escala as séries de dados derivadas das tecnologias da elevado-produção tais como o microarray e o proteo - [lido mais DAVID] |
| FACILIDADE - http://david.niaid.nih.gov/david/ease.htm Útil para sumariar o “tema biológico predominante” de uma lista dada do gene. De uma lista de genes do microarray ou de outro genoma-escale experiências, FACILIDADE pode ràpida calcular estatísticas do over-representation para cada termo possível do Ontology do gene com re - [lido mais FACILIDADE] |
| ermineJ - http://microarray.genomecenter.columbia.edu/ermineJ/ o ermineJ é uma ferramenta para a análise de jogos do gene (definidos pelo utilizador ou aqueles definidos perto VÃO os termos) em dados da expressão. O software é projetado ser usado por biólogos com quase nenhum fundo da informática. Uma comando-linha relação está disponível para os usuários que - [lido mais ermineJ] |
| Dados do microarray da gene-expressão de Ontologizing: - http://www.charite.de/ch/medgen/ontologizer/ Uma aplicação de Java XML-baseada é descrita que forneça uma vista geral função-orientada dos resultados da análise de conjunto dos dados do microarray da gene-expressão baseados em termos e em associações do Ontology do gene. A aplicação gera um HTML page com listi - [lido mais dados do microarray da gene-expressão de Ontologizing:] |
Emita esta página a um amigo