Ferramentas do Dna Microarray Bioinformatic.
Software do Dna Microarray (6) |
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DNMAD -
http://dnmad.bioinfo.cnio.es/ DNMAD: Diagnóstico e normalization para dados de MicroArray. - [lido mais DNMAD] |
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DragonFamilies -
http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragon.htm DragonFamilies é programado analisar dois dados da relação da amostra que variam em torno das diferenças aproximadamente 2-fold (isto é os dados coletaram dos microarrays de Incyte ou os microarrays de vidro hybridized simultaneamente com Cy3 e Cy5 etiquetaram pontas de prova). - [lido mais DragonFamilies] |
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DragonOrder -
http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragonorder.htm A ferramenta de DragonOrder aceita dados microarray classificados e indica a posição de famílias dos genes naquele lista classificada. A idéia atrás da ferramenta de DragonOrder é similar àquela da ferramenta de DragonFamilies. Esse ser esse ele é benéfico para que o usuário seja - [lido mais DragonOrder] |
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DragonPaths -
http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragonpaths.htm A base de dados do dragon pode ser usada anotar dados diferenciais da expressão do gene com números de KEGG e números de Locuslink. Cada número de KEGG define um pathway celular em que muitos genes podem participar. Baseado em dados diferenciais da expressão do gene forneceu perto - [lido mais DragonPaths] |
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MeSHer -
http://pga.tigr.org/pubminer/mesher.html MeSHer é uma ferramenta de Java para a mineração biológica da literatura. O programa executa analyis estatísticos dos termos do engranzamento (títulos sujeitos médicos) para encontrar temas biológicos sobre-representados em uma amostra dada dos genes em comparação a uma população maior do gene - [lido mais MeSHer] |
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Ferramenta do pomelo (conjunto) -
http://pomelo.bioinfo.cnio.es/ Ferramenta Do Pomelo: Um suite para testar da disposição do DNA e da disposição do tecido da expressão diferencial (com ajuste para o múltiplo que testa). Inclui comparações de dois ou mais grupos (t-teste e ANOVA), análise da sobrevivência (modelo de Cox) e tabelas da contingência (fisher ex - [lido mais ferramenta do pomelo (conjunto)] |
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TIGR Spotfinder -
http://www.tm4.org/spotfinder.html O software da análise de imagem projetou para a análise rápida, reproducible e computer-aided de imagens microarray e a quantificação da expressão do gene. TIGR Spotfinder lê as limas 16-bit emparelhadas da imagem do tiff geradas por a maioria de varredores microarray. - [lido mais TIGR Spotfinder] |
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