Ferramentas de Bioinformatic do Microarray do ADN.
Software do Microarray do ADN (6) |
| DNMAD - http://dnmad.bioinfo.cnio.es/ DNMAD: Diagnóstico e normalização para dados do MicroArray. - [Lido mais DNMAD] |
| DragonFamilies - http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragon.htm DragonFamilies é programado analisar dois dados da relação da amostra que variam ao redor aproximadamente 2 diferenças da dobra (isto é os dados coletaram dos microarrays de Incyte ou os microarrays de vidro cruzados simultaneamente com Cy3 e Cy5 etiquetaram pontas de prova). - [Lido mais DragonFamilies] |
| DragonOrder - http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragonorder.htm A ferramenta de DragonOrder aceita dados classificados do microarray e indica a posição de famílias dos genes naquele lista classificada. A idéia atrás da ferramenta de DragonOrder é similar àquela da ferramenta de DragonFamilies. Esse ser esse ele é benéfico para que o usuário seja - [lido mais DragonOrder] |
| DragonPaths - http://pevsnerlab.kennedykrieger.org/dragonpaths.htm A base de dados do dragão pode ser usada para anotar dados diferenciais da expressão de gene com números de KEGG e números de Locuslink. Cada número de KEGG define um caminho celular em que muitos genes podem participar. Baseado em dados diferenciais da expressão de gene forneceu perto - [lido mais DragonPaths] |
| MeSHer - http://pga.tigr.org/pubminer/mesher.html MeSHer é uma ferramenta de Java para a mineração biológica da literatura. O programa executa analyis estatísticos dos termos do engranzamento (rúbricas sujeitas médicas) para encontrar temas biológicos over-represented em uma amostra dada de genes em comparação a uma população maior do gene - [lido mais MeSHer] |
| Ferramenta do Pomelo (conjunto) - http://pomelo.bioinfo.cnio.es/ Ferramenta do Pomelo: Uma série para o teste da disposição do ADN e da disposição do tecido da expressão diferencial (com ajuste para o teste múltiplo). Inclui comparações de dois ou mais grupos (t-teste e ANOVA), análise da sobrevivência (modelo de Cox) e tabelas de contingência (Fisher ex - [lido mais ferramenta do Pomelo (o conjunto)] |
| TIGR Spotfinder - http://www.tm4.org/spotfinder.html O software de análise da imagem projetou para a análise rápida, reprodutível e assistida por computador de imagens do microarray e a quantificação da expressão de gene. TIGR Spotfinder lê as limas de imagem de 16 bits emparelhadas do tiff geradas por a maioria de varredores do microarray. - [Lido mais TIGR Spotfinder] |
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