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Ferramentas da predição do gene, genes de predição software e bioinformática em linha.
| Agenda - http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/agenda/ A agenda é uma ferramenta do Web que compare as seqüências genomic dos organismos evolutionarily relacionados a fim fazer predições do gene. Toma pares de seqüências genomic como a entrada, alinha as seqüências, e faz as predições baseadas em sinais da tala, começo e - [lido mais agenda] |
| AUGUSTUS - http://augustus.gobics.de/submission AUGUSTUS é uma ferramenta eukaryotic da predição do gene que emprega um método mais exato para modelar a distribuição do comprimento do intron. É particular eficaz com seqüências maiores. Pode ser funcionado através de uma relação do Web, ou ser transferido e funcionar localmente. - [Lido mais AUGUSTUS] |
| EXPLOSÃO - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ Ferramenta local básica da busca do alinhamento; recupere as seqüências similares a sua pergunta. - [Lido mais EXPLOSÃO] |
| GeneComber - http://bioinformatics.ubc.ca/genecomber/index.php GeneComber é ab initio uma ferramenta da predição do gene desenvolvida no centro da bioinformática de UBC. Integra resultados de dois inventores externamente desenvolvidos do gene e opera sobre a premissa que se estes inventores de dois genes concordam com uma predição, nós pode ser mais c - [lido mais GeneComber] |
| GeneMark - http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/ A família de GeneMark dos programas emprega modelos Markov e é ajustada especificamente para a predição do gene para seqüências dos prokaryotes, dos genomas virais e dos eukaryotes. - [Lido mais GeneMark] |
| GenomeScan - http://genes.mit.edu/genomescan.html Incorpora a informação da similaridade da proteína ao prever genes; baseado na parte em GENSCAN. - [Lido mais GenomeScan] |
| GENSCAN - http://genes.mit.edu/GENSCAN.html Identificação de estruturas completas do gene no ADN genomic. - [Lido mais GENSCAN] |
| Reflexo - http://www.tigr.org/softlab/glimmer/glimmer.html Localizador do gene e Modeler Markov interpolado; este prokaryote-gene que encontra a ferramenta é o inventor microbiano preliminar do gene usado em TIGR; livre (incluindo o código fonte) com registo para o uso não comercial. - [Lido mais reflexo] |
| Grail - http://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/ O Grail é uma série das ferramentas que reconheça características da seqüência como promotores, candidatos do exon, repetições simples e elementos repetitivos complexos. Igualmente modela os genes baseados nos candidatos do exon. - [Lido mais Grail] |
| HMMgene - http://genome.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ Predição de genes do animal vertebrado e dos elegans do C. - [Lido mais HMMgene] |
| Grupo da bioinformática de IBM e da descoberta do teste padrão - http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html Server extensivo que possui uma escala larga das ferramentas para a descoberta do teste padrão em seqüências do ADN e da proteína e também no texto. As ferramentas para o alinhamento múltiplo da seqüência, a descoberta do gene, a anotação da proteína, e as outras aplicações igualmente existem neste server. Um detalhe - [lido mais grupo da bioinformática de IBM e da descoberta do teste padrão] |
| Inventor do ORF - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html Encontra frames de leitura toda abertos em uma seqüência. - [Lido mais inventor do ORF] |
| Ferramentas de software de TIGR - http://www.tigr.org/software/ Uma lista de pacotes de software da abrir-fonte disponíveis para livre do instituto para a pesquisa de Genomic (TIGR). - [Lido mais ferramentas de software de TIGR] |
| Twinscan - http://genes.cs.wustl.edu/ Twinscan é um sistema para a gene-estrutura de predição em seqüências genomic eukaryotic. A fim fazer suas predições, as ligas de Twinscan a informação das regiões de codificação previstas e da tala situam com medidas do conserservation entre o SE do alvo - [lido mais Twinscan] |
| EXPLOSÃO de WU - http://blast.wustl.edu/ Ferramenta local básica da busca do alinhamento da universidade de Washington - [lido mais EXPLOSÃO de WU] |
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