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Eu penso que a ciência apreciou um sucesso extraordinário porque tem um reino tão limitado e estreito em que para focalizar seus esforços. A saber, o universo físico. ~Ken Jenkins
A expressão do gene pode ser determinada por diversos métodos que incluem na expressão larga da proteína dos termos, e por expressão do mRNA.
a análise da expressão do mRNA ou a expressão de níveis do mRNA podem assayed por técnicas múltiplas em um nível que em grande escala estas incluem:
Em uma escala menor ou para confirmar resultados do grande-escale um pode usar as seguintes técnicas da expressão do mRNA:
Entretanto, a análise bioinformatic pode ser usada. A análise de Bioinformatic permite contornear da polarização biológica da medida e o ruído das técnicas específicas e usa ferramentas estatísticas separar a mudança significativa na expressão do gene do ruído em estudos em grande escala ou do elevado-high-throughput do gene da expressão.
Tais estudos podem ser empregados para determinar os genes implicados em um disorder: um pôde comparar dados microarray das pilhas epithelial cancerous aos dados das pilhas non-non-cancerous para determinar os transcripts que acima-são regulados e para baixo-regulados em uma população particular de pilhas de cancer.
A tecnologia de Affymetrix GeneChip é usada freqüentemente analisar testes padrões da expressão do mRNA usando uma aproximação microarray.
Os dados crus gerados das disposições da ponta de prova de GeneChip podem ser analisados usando o Affymetrix ((suite da análise de Microarray) software MAS)4.0 e MAS5.0.
O software do suite da análise de Microarray pode calcular uma variedade que muitas medidas usar as intensidades do hybridization mediu pelo varredor das disposições da ponta de prova.
A intensidade da disposição inteira da ponta de prova é usada para cálculos do fundo e do ruído na análise de dados crus.
Outros metrics comparam as intensidades das pilhas perfeitas seqüência-específicas da ponta de prova do fósforo (PM) com suas pilhas da ponta de prova da mau combinação do controle (milímetro) para que cada jogo da ponta de prova determine se um transcript for o presente (p), (m) marginal, ou (a) ausente. Em seguida, os números do positivo e os pares negativos da ponta de prova são determinados para cada jogo da ponta de prova. Os números do positivo e de jogos negativos da ponta de prova são usados então derivar os metrics que descrevem o desempenho de cada jogo da ponta de prova, da fração positiva e da relação de Pos/Neg. A análise de dados crus resulta também em atendimentos da ausência e da presença, na diferença média, e nos níveis da expressão.
A análise da comparação dá o normalization e o scaling, o cálculo da mudança da dobra e os coeficientes de correlação.
Os relacionamentos funcionais podem assayed usando diversos métodos including:
Veja a análise da expressão da proteína para mais informação neste tópico.
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