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A expressão de gene pode ser determinada por diversos métodos que incluem em geral a expressão da proteína, e por expressão do mRNA.
a análise da expressão do mRNA ou a expressão de níveis do mRNA podem ser analisadas por técnicas múltiplas a nível que em grande escala estas incluem:
Em uma escala menor ou confirmar resultados de um em maior escala pode usar as seguintes técnicas da expressão do mRNA:
Entretanto, a análise bioinformatic pode ser usada. A análise de Bioinformatic permite contornear da polarização biológica da medida e o ruído das técnicas específicas e usa ferramentas estatísticas para separar a mudança significativa na expressão de gene do ruído em estudos em grande escala ou da elevado-produção de gene da expressão.
Tais estudos podem ser empregados para determinar os genes implicados em uma desordem: um pôde comparar dados do microarray das pilhas epithelial cancerígenos aos dados das pilhas non-cancerous para determinar os transcritos que acima-são regulados e para baixo-regulados em uma população particular das células cancerosas.
A tecnologia de Affymetrix GeneChip é usada freqüentemente para analisar testes padrões da expressão do mRNA usando uma aproximação do microarray.
Os dados crus gerados das disposições da ponta de prova de GeneChip podem ser analisados usando o Affymetrix o software 4.0 e MAS5.0 (do MAS) (série da análise do Microarray).
O software da série da análise do Microarray pode calcular uma variedade que muitas medidas usar as intensidades da hibridação mediu pelo varredor das disposições da ponta de prova.
A intensidade da disposição inteira da ponta de prova é usada para cálculos do fundo e do ruído na análise de dados crus.
O outro medidor compara as intensidades das pilhas perfeitas seqüência-específicas da ponta de prova do fósforo (PM) com suas pilhas da ponta de prova da má combinação do controle (milímetro) para que cada jogo da ponta de prova determine se um transcrito está o presente (P), marginal (M), ou (a) ausente. Em seguida, os números de positivo e os pares negativos da ponta de prova são determinados para cada jogo da ponta de prova. Os números de positivo e de jogos negativos da ponta de prova são usados então para derivar o medidor que descreve o desempenho de cada jogo da ponta de prova, da fração positiva e da relação da posição/Neg. A análise de dados crus igualmente conduz aos atendimentos da ausência e da presença, à diferença média, e aos níveis da expressão.
A análise da comparação dá a normalização e a escamação, o cálculo da mudança da dobra e os coeficientes de correlação.
Os relacionamentos funcionais podem ser analisados usando incluir de diversos métodos:
Veja a análise da expressão da proteína para mais informação neste tópico.
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