Welcome to Molecular Station! Zapraszamy do Molekularnej Station!

You have to register before you can post on our forums or use our advanced features. Musisz się zarejestrować zanim będziesz mógł umieścić na naszym forum lub skorzystać z zaawansowanych funkcji. Register Now! Zarejestruj się teraz! Its Free and Fast! Jego Darmowy i Fast!

Already registered? Już zarejestrowany? Login now below. Zaloguj się poniżej.

User Name: Nazwa użytkownika:

Password: Hasło:

Remember Me? Remember Me?

Already registered and Forgot your password? Już zarejestrowany i Zapomniałeś hasła? Click below to recover it. Kliknij poniżej, aby ją odzyskać.

Recover Lost Password Odzyskaj Nie pamiętam hasła

Join now - it's fast and free! Dołącz teraz - szybko i za darmo!

Molecular Station is THE largest network of researchers, scientists and science lovers anywhere! Molekularnej Station to największa sieć badaczy, naukowców i miłośników nauki w dowolnym miejscu!

Recent Forum Posts Recent Forum Posts

Proteomics Proteomika

Information on how the proteome or the set of proteins in a cell is studied. Informacje na temat sposobu Proteome lub zestaw białek w komórce jest badany.

Proteomoics Methods Metody Proteomoics

Protein content of a cell is estimated to consist of thousands of different types of proteins with a dynamic range of expression. Zawartość białka w komórce Szacuje się, składają się z tysięcy różnych rodzajów białek z zakresu dynamicznego wyrazu. The technology that is currently being used involves the retrieval of the protein components, fractionation of this very complex mixture, enzymatic proteolysis of each separated and isolated species, extensive mass spectrometric analysis and finally matching the structural data generated against a database of known proteins or anticipated genome expression products. Technologia, która jest aktualnie używane obejmuje pobieranie składników białka, frakcjonowanie tego bardzo skomplikowane mieszanki enzymatycznej proteoliza każdego oddzielnie i izolowanych gatunków, obszerne analizy spektrometrii masowej i wreszcie strukturalnego dopasowania danych generowanych w bazie białek znane lub przewidywane genomu wypowiedzi produktów.

This procedure involves an initial step using 1- or 2-dimensional electrophoresis (DE). Procedura ta polega na początkowym etapie za pomocą 1 - lub 2-wymiarowego elektroforezy (DE). Using 1-DE, proteins are separated on the basis of molecular mass; the technique is reproducible and can be used for proteins in the mass range of 10–300 kDa, but does have limited resolution. Korzystanie z 1-DE, białka są rozdzielane w oparciu o masie cząsteczkowej; technika jest powtarzalne i mogą być wykorzystane do białka w masie zakres 10-300 kDa, ale ma ograniczoną rozdzielczość. For separation of more complex protein mixtures, 2-DE is the preferred method. Do rozdzielenia bardziej skomplikowane mieszanki białka, 2-DE jest preferowaną metodą. This involves separating the proteins first according to their net charge by an isoelectric focusing step and then, in the second dimension, according to their molecular mass employing sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) which gives a high separation eciency. Wiąże się to oddzielenie białka pierwsze, zgodnie z ich netto opłaty przez isoelectric koncentrując się krok, a następnie w drugim wymiarze, w zależności od ich masy cząsteczkowej zatrudniających dodecylo siarczanu sodu, elektroforeza poliakrylamidowym (SDS-PAGE), co daje wysoki eciency separacji.

Mass spectrometry (MS) is the method of choice for the identification of the separated proteins, and 2-DE and mass spectrometry now represent a technology by which several thousand proteins can be separated, detected and identified in an automated fashion. Spektrometria masowa (MS) jest metodą z wyboru w celu identyfikacji białek w separacji, a 2-DE i spektrometria masowa stanowią obecnie technologii przez kilka tysięcy białek, które mogą być oddzielone, wykrywane i identyfikowane w sposób automatyczny.

Proteomics methodology is initially done by protein separation and location by 2-DE followed by excision of the proteins of interest which then undergo proteolytic digestion to yield a mixture of peptide fragments. Proteomika metodologia jest początkowo sporządzony przez białka separacji i lokalizacji przez 2-DE po wycięciu białek interesów, które następnie poddawane proteolytic do trawienia plon mieszanki fragmenty peptydów. The peptides are analysed by mass spectrometry, initially using MALDI-MS for molecular mass determination and generation of a peptide mass fingerprint. W peptydy są analizowane przez mass spectrometry, początkowo za pomocą MALDI-MS do oznaczania masy cząsteczkowej i wytwarzania peptydu o masie odcisków palców. If database searching at this stage yields ambiguous results, a second mass spectrometric analysis, ESI-MS/MS, is used to generate sequence information which is used for more stringent database searching. Jeśli szukasz bazy danych na tym etapie rentowności niejednoznaczne wyniki, drugi spektrometrii masowej analizy, ESI-MS/MS, jest wykorzystywany do generowania sekwencji informacje, które są wykorzystywane do poszukiwania bardziej rygorystyczne bazy danych.

From the mass spectrum obtained on analysis of the protein digest mixture, the peptide mass map or peptide mass fingerprint ie the molecular masses of the peptide fragments, can be ascertained. Od widma masowe uzyskane na analizę zbiorczą mieszanki białka, masa peptydu mapę lub peptydu masa odcisków palców tj. mas molekularnych z peptydu fragmenty, można ustalić. Often, if the amino acid sequence is sufficiently unique and the mass accuracy sufficiently high, the mass map can be used to search databases 12–15 to identify the protein successfully without the need for further analyses. Często, gdy sekwencji aminokwasów jest wystarczająco unikatowy i masa dostatecznie wysokiej dokładności, masa Mapa może być używana do wyszukiwania danych 12-15 do identyfikacji białek z powodzeniem bez potrzeby dalszych analiz. If, however, database searching leads to ambiguous results, then further MS analyses, involving the use of tandem mass spectrometry (MS/MS), are undertaken sequentially on each peptide in the mixture to generate a sequence, or partial sequence, known as a sequence tag, for these peptides. Jeśli jednak baza danych prowadzi do poszukiwania niejednoznaczne wyniki, a następnie dalsze MS analiz, obejmujących wykorzystanie tandem mass spectrometry (MS / MS), podejmowane są kolejno w każdym peptydu w mieszaninie do generowania sekwencji lub częściowej sekwencji, znany jako Sekwencja znacznikiem, dla tych peptydów. This is frequently achieved by the use of ESI-MS/MS19 and usually an additional purification step must be performed to separate the peptides from the salts and detergents that may be present which cause attenuation of the peptide signal. Jest to często osiągnąć przez użycie ESI-MS/MS19 i zazwyczaj dodatkowego oczyszczania kroku musi być wykonane, aby oddzielić peptydy z soli i detergentów, które mogą być obecne, które powodują tłumienie sygnału z peptydu.

Further database searching with both the molecular mass of the peptide and the sequence tag information should lead to unambiguous protein identification. Dalsze poszukiwania w bazie danych zarówno z masy cząsteczkowej i sekwencji peptydu znacznikiem informacje powinny doprowadzić do jednoznacznej identyfikacji białek.

Related Proteomics Information: Proteomika Powiązane informacje:

Proteomics Proteomika

Proteomics Station Proteomika Station

Copyright Molecular Station 2006 Copyright Molekularnej Station 2006