De eiwit Protocollen van de Serie	De eiwit Bio-informatica van de Serie	Leer over EiwitSeries	De de eiwit Uitrustingen en Producten van de Serie	Het eiwit Forum van de Serie	Het Nieuws van Proteomic

Eiwit Microarray vangt Molecules en Hun Beperkingen

De Spaanders van Microarray van de proteïne en van het Antilichaam

Vang Molecules en Hun Beperkingen - EiwitSpaanders

Vang Molecules en hun Beperkingen
            De gemeenschappelijkste vorm van analytische eiwitseries is antilichaam microarrays waarin antilichamen (of antilichamennabootsers) die specifieke antigenen worden opgesteld op een glasplaatje bij hoogte - dichtheid binden. Een lysate wordt overgegaan over de serie en het verbindende antigeen wordt ontdekt na was. De grootste uitdaging met deze methodes produceert reagentia die de proteïne van belang en met hoge genoeg specificiteit in een hoog-productiemanier identificeren.  Hoewel de antilichamen de traditionele reagens van keus voor het ontdekken van proteïnen in complexe mengsels zijn, zijn polyclonal serums vaak niet specifiek en zijn duur te produceren. Ook, is de conventionele hybridoma methode om hoogst specifieke monoclonal antilichamen te produceren tijdrovende, afmattende en dure (8).
           
Verscheidene studies die antilichamen gebruiken zijn onlangs uitgevoerd ondanks de hindernissen in het verkrijgen van specifieke antilichamen.  In één van de grootste studies tot op heden, Sreekumar et al. bevlekt 146 verschillende antilichamen op glas om de afwisselingen van eiwithoeveelheid in LoVo de cellen van het dubbelpuntcarcinoom te controleren. Hun resultaten openbaarden radiation-induced omhoog-verordening van vele interessante proteïnen, met inbegrip van p53, de fragmentatiefactor 40 en 45 van DNA, op factorbetrekking hebbende tumornecrose ligand, evenals beneden-geregelde proteïnen (58).

Tot op heden, werd het meeste antilichaam microarrays geproduceerd met verscheidene dozijn of een paar honderd in de handel verkrijgbare poly of mono-clonal antilichamen.  Hoewel de tientallen duizenden antilichamen in de handel verkrijgbaar zijn, is dit aantal ontoereikend omdat voor de meeste proteïnen er geen beschikbare antilichamen zijn.  Het feit dat vele antilichamen glycosylated zijn en grote ondersteunende structuren bevatten op basis van eiwitten betekent dat zij vaak met meer dan één doelproteïne dwars-reageren.  Dit kan tot een groot aantal valse positieven (9) bijdragen.  Aldus heeft een ander probleem hoog-specificiteitantilichamen verkregen.    

            Één van het grootste probleem met antilichamenseries is specificiteit. De proteïnen zijn vaak aanwezig in een zeer grote dynamische waaier (106); aldus, zullen de reagentia die hoge affiniteit voor één proteïne zouden kunnen hebben, maar lage affiniteit voor een andere zijn nog opsporing van de lagere affiniteitproteïne tentoonstellen als het meer overwegende (9) is. Één groep onderzocht de capaciteit van 115 goed-gekenmerkte antilichaam-antigeen paren om in high-density microarrays op gewijzigde glasplaatjes te reageren. 30% van de paren toonde de verwachte lineaire verhoudingen erop wijzen, die dat een fractie antilichamen voor kwantitatieve analyse (33) geschikt was. Vele groepen hebben sandwichanalyses gebruikt om dit probleem te vermijden.  Een sandwichanalyse wordt uitgevoerd door het eerste antilichaam op de serie te bevlekken en dan het gebruiken te ontdekken een tweede antilichaam dat een verschillend deel van de proteïnen erkent. Deze benadering verhoogt dramatisch de specificiteit van de antigeenopsporing, maar vereiste dat er meest minst twee antilichamen van uitstekende kwaliteit voor elk antigeen bestaan (8) te ontdekken.

Daarna: Antilichaam Microarrays: Problemen en Oplossingen

Verwijzingen voor Proteïne en Antilichaam Microarrays

Terug naar:

Inleiding en Achtergrond van EiwitSpaanders en de Spaanders van het Antilichaam.

Types van Antilichaam en EiwitSpaanders

Het Nieuws van de wetenschap

Bevindingen in de Vroege Besmetting van het t. b.

Nieuw Genetisch Bewijsmateriaal voor Eerste Amerikanen

Het verminderde Risico van Kanker Colorectral met de Therapie van het Hormoon

De Aansluting en het Risico van het Trauma van kinderjaren voor het Chronische Syndroom van de Moeheid

Het dubbele Gen van de Rol speelt Rol in Kanker van de Borst met Slechte Prognose

Inzicht in Agressieve Kanker van Kinderjaren

Nieuwe Genetische Tellers voor Ulcerative Dikkedarmontstekingen

Het nieuwe Model van de Muis Glioblastoma

Nieuwe Manier om Cellen te smelten

Het Verdergaan van de Groei van de aquicultuur

Voor meer klik hier: Het Nieuws van de wetenschap