Bio-informatica, Protocollen, RNA EiwitProteomics van DNA

huis > eiwit-microarrays-eiwit > toepassing-eiwit-spaanders > index.php

De eiwit Protocollen van de Serie	De eiwit Bio-informatica van de Serie	Leer over EiwitSeries	De de eiwit Uitrustingen en Producten van de Serie	Het eiwit Forum van de Serie	Het Nieuws van Proteomic

Toepassingen van EiwitMicroarrays

Proteïne en Antilichaam Microarrays

De eiwit Toepassingen van de Spaander

 

Toepassingen van EiwitSpaanders
1) Proteomics
            De eiwit spaandertechnologieën zullen krachtig, een hoog-productie en een veelzijdig hulpmiddel voor de genoom-schaal analyse van genfunctie (zie Figuur 4) verstrekken.  De activiteit van het enzym, de eiwit-eiwit en eiwit-nucleic-zure interactie, en de interactie kunnen allen van de klein-moleculedrug direct op het eiwitniveau (77.78) worden geanalyseerd.  De series kunnen worden gebouwd om eiwitidentificatie, kwantificatie, en affiniteitstudies te richten.  Een profilerende serie kan niveaus van specifieke proteïnen op globale schaal kwantificeren die voor een vergelijking van normale en ziektestaten toestaan.  Een affiniteitserie kan de interactie van peptides, proteïnen, oligonucleotides, suikers, lipiden, of kleine molecules en chemische producten met geïmmobiliseerdes proteïnen zoals receptoren, enzymen, of antilichamen (8) analyseren. 
            Momenteel, is de tarief-beperkende stap de productie van grote aantallen proteïnen. De capaciteit zal om eiwitproductie en proteïnen te automatiseren die aan hoog-affiniteitmarkeringen wordt gesmolten zeer eiwit-spaanderontwikkeling bevorderen.  High-density de spaanders die grote reeksen proteïnen of zelfs volledige proteomes bevatten zullen de hoog-productieanalyse van biochemische activiteiten, eiwit-eiwitinteractie en post-vertalende wijzigingen, zoals phosphorylation, dephosphorylation, eiwitmethylation, en ubiquitination toestaan.

            Het uiteindelijke doel van proteomics is aan de studie biochemische activiteiten van elke proteïne die door een organisme wordt gecodeerd of proteome.  Een uitgevoerde oriëntatiepuntstudie bereidde de eerste proteome spaander door ~94% (>5800 van 6200) van de frames van de gist open lezing in een vector van de gistuitdrukking te klonen die voor de proteïnen als n-Terminal gST-Zijn x6 dubbele geëtiketteerdeu fusies uitdrukte.  Een eiwit de reinigingsmethode werd van de hoog-productiegist ontwikkeld om proteïnen individueel te zuiveren. 80% van gistproteïnen waren volledige lengte en van voldoende hoeveelheid om door de meeste analysetypes opspoorbaar te zijn. De proteïnen werden toen gezuiverd gebruikend de markeringen GST en werden toen vastgemaakt aan Ni-NTA-Met een laag bedekte glasplaatjes gebruikend de markeringen HisX6.  Naast het identificeren van bekende interactie, werden 33 nieuwe bindende proteïnen ontdekt.  150 nieuwe lipide-bindende proteïnen werden ook geïdentificeerd.  Deze studie toonde aan dat een volledige proteome op een glasoppervlakte aan direct het scherm voor interactie met proteïnen en kleine molecules (26) kan worden geïmmobiliseerd.
            De koppeling van massa-spectrometrie en eiwitspaanders zal brede toepassingen in het identificeren van spelers in eiwit-eiwitinteractie, en ook in drugontdekking (80) hebben.  Proteïnen en klein-molecule ligands de de verbindend aan proteïnen die op spaander worden geïmmobiliseerd kunnen worden geïdentificeerdo gebruikend de matrijs-bijgewoonde van de laserdesorptie/spectroscopie ionisatie van de tijd van vlucht (madli-TOF) massa.  De formaten van Microwell zijn met deze bedoeling bijzonder geschikt. Aldus, kunnen de molecules en de proteïnen die specifiek aan vele verschillende proteïnen binden worden geïdentificeerdm en deze informatie kan worden gebruikt om moleculaire netwerken en wegen af te leiden.
            Één gebied dat technologische verbeteringen zal vereisen is de analyse van membraanproteïnen.  Een grote hoeveelheid proteïnen zullen waarschijnlijk worden gebonden, aangezien zo velen zoals het één derde alle gistproteïnen membraanproteïnen of afgescheiden proteïnen (81) is. wegens het feit dat veel van deze proteïnen actief zijn wanneer in membranen, het daarom noodzakelijk kan zijn om hen te zuiveren of opnieuw samen te stellen met bijbehorende lipiden. Nochtans, kan dit niet zo moeilijk zijn. Één groep kon immobiliseren biotinylated membranen die g-eiwit-Gekoppelde receptorrhodopsin op een gouden-met een laag bedekte glasoppervlakte, bevatten en een functionele analyse voor die proteïne (82) vestigen.  De gelijkaardige procedures kunnen het mogelijk maken om membraanproteïnen in een spaanderformaat te analyseren.
2) Diagnostiek
Een ander gebied dat van eiwitgebieden zal profiteren is diagnostiek. De hoogst parallelle analyse van series zal bepaling van ziektetellers (b.v. tumortellers) in uittreksels die met slechts een minimum van biopsie (steekproef) materiaal toestaan, tot nieuwe mogelijkheden om ziekte (kanker) leiden behandeling en therapie (83) te controleren.

.

 

 

Daarna: Eiwit Microarrays: Toekomstige Richtingen en Conclusies

Verwijzingen voor Proteïne en Antilichaam Microarrays

Terug naar:

Inleiding en Achtergrond van EiwitSpaanders en de Spaanders van het Antilichaam.

Types van Antilichaam en EiwitSpaanders