Bio-informatica, Protocollen, RNA EiwitProteomics van DNA

huis > eiwit-microarrays-eiwit > antilichaam-microarray-beperkingen > index.php

De eiwit Protocollen van de Serie	De eiwit Bio-informatica van de Serie	Leer over EiwitSeries	De de eiwit Uitrustingen en Producten van de Serie	Het eiwit Forum van de Serie	Het Nieuws van Proteomic

De Beperkingen van Microarray van het antilichaam

Proteïne en Antilichaam Microarrays

Problemen en Mogelijke Oplossingen voor Antilichaam Microarrays

 

Beschikbaarheid van Antilichamen
            Een andere uitdaging aan antilichamenseries is antilichamen tegen de proteïnen ≥ 100.000 te verkrijgen die uit menselijke proteome bestaan.  Er is momenteel een zeer kleine fractie antilichamen beschikbaar van proteome.  Bovendien is de specificiteit van veel van deze antilichamen slecht gedocumenteerd en de extra antilichamen kunnen worden vereist aan
laat de opsporing van post-vertalende wijzigingen toe.  De opsporing van proteïnen door antilichaam-antigeen interactie wordt ook gekenmerkt door een brede waaier van specificiteit en affiniteit.  Ook, is het moeilijk om een grote reeks van hoogst specifiek antilichaam te verkrijgen
molecules. Daarom zijn de meeste antilichamenseries beperkt in hun gebruik en bevatten een paar duidelijk omlijnde vangstagenten die bij een bepaalde klasse van eiwittellers (9.17) worden geleid 
- om gelijkaardige te handelen niet glycosylation

Andere Problemen die Antilichaam Microarrays en Mogelijke Oplossingen onder ogen zien
De klassieke strategieën van antilichamengeneratie door dierlijke immunisering schijnen onpraktisch te zijn. De recombinante bibliotheken van de antilichamenvertoning zijn belovend (59-61). Onlangs, zijn vele recombinante methodes om antilichamen te produceren onderzocht.
Deze omvatten phage antilichaam-vertoning, ribosoomvertoning, SELEX (systematische evolutie van ligands door exponentiële verrijking), mRNA vertoning, en affibody vertoning, die zijn ontwikkeld om de productie van antilichamen en/of antilichamennabootsers (16.54.56.62) vooruit te gaan.  Deze methodes allen houden de bouw van grote repertoires van haalbare gebieden met potentiële bindende activiteit in, die dan door veelvoudige rondes van affiniteitreinigingen worden geselecteerd. De kandidaat klonen kunnen verder worden geselecteerd gebruikend rijpingsselectie die bindende affiniteiten verbetert.  Nochtans, moet een ideaal selectiesysteem, dat snel is, robuuste, gevoelige, lage geautomatiseerd, en geminimaliseerde kosten, nog volledig worden ontwikkeld (16.54).  Deze kleinere antilichamenfragmenten zijn gewoonlijk cross-reactivity en gelijkaardige eigenschappen op gehechtheid (7.8.9.27) verminderd.
Ook omdat de recombinante antilichamen een potentieel hoge affiniteit, hoge specificiteit hebben, en de hun kleiner moleculegewicht, dat gewoonlijk kDa ongeveer 30 terwijl nietrecombinante antilichamen is kDa ongeveer 150 is, dichte en georiënteerde gehechtheid aan steunoppervlakten wordt vergemakkelijkt (63.64).
            De antilichamen zijn niet de enige molecules die proteïnen kunnen binden.  Aptamers is korte oligonucleotids die covalente doelproteïnen binden en kunnen crosslink.  Dit vergemakkelijkt
de hogere voorwaarden van de starheidswas wat opsporing van specifieke band bevordert.  Voorts worden deze molecules geselecteerd, gemakkelijk opgesteld en samengesteld.  Het gezuiverde eiwitdoel is een eis ten aanzien van hun gebruik nochtans, en aptamers kunnen beïnvloede band tentoonstellen aangezien RNAs neigt om hoogst negatief (9) worden aangerekend. Groeps (Somalogic) onlangs gebruikte geïmmobiliseerden anti-menselijke immunodeficiency virus-gp120 aptamer om subnanomolar concentraties van doelproteïne in 5% menselijk serum (65) te ontdekken. 

 

Daarna: De eiwit Methodes van de Opsporing Microarray en Analyse

Verwijzingen voor Proteïne en Antilichaam Microarrays

Terug naar:

Inleiding en Achtergrond van EiwitSpaanders en de Spaanders van het Antilichaam.

Types van Antilichaam en EiwitSpaanders