Onthaal aan Moleculaire Post!

U moet registreren alvorens u op onze forums kunt posten of onze geavanceerde eigenschappen gebruiken. Register nu! Zijn Vrij en Snel!

Reeds geregistreerd? Login nu hieronder.

De Naam van de gebruiker:

Wachtwoord:

Herinner me?

Vergat reeds geregistreerd en uw wachtwoord? Klik hieronder om het terug te krijgen.

Krijg Verloren Wachtwoord terug

Treed nu toe - het is snel en vrij!

De moleculaire Post is overal het grootste netwerk van onderzoekers, wetenschappers en wetenschapsminnaars!

De recente Posten van het Forum

Online Mendeliaanse Overerving OMIM van de Mens

Het Huis van de bio-informatica	Gecategoriseerde de Hulpmiddelen van Bioinformatic	Leer over Bio-informatica	Bio-informatica FAQ	De Artikelen van het onderzoek op Bio-informatica	Het Forum van de bio-informatica	Het Nieuws van Bioinformatic	Bio-informatica Blog	De Boeken van Bioinformatic

Het zoeken van OMIM

Het zoeken van Online Mendeliaanse Overerving in de Mens (OMIM) over het Internet-protocol

Het omim- gegevensbestand is een catalogus van menselijke genen en de genetische wanorde authored en uitgegeven door Dr. Victor A. McKusick en zijn collega's in Johns Hopkins en elders, en ontwikkeld voor het World Wide Web door NCBI, het Nationale Centrum voor de Informatie van de Biotechnologie. Het gegevensbestand bevat tekstuele informatie en verwijzingen. Het bevat ook overvloedige links aan de verslagen van MEDLINE en van de opeenvolging in het systeem Entrez, en links aan extra verwante middelen bij NCBI en elders.

OMIM kan direct van de Ncbi- homepage worden betreden (http://www.ncbi.nlm.nih.gov) door op de link OMIM in de blauwe staaf bij de bovenkant van de pagina te klikken.

Ik zal aan u op beschrijven hoe te om tot de Website toegang te hebben en onderzoekstermijnen in te gaan om Omim- verslagen terug te winnen. Ik herzie dan kort het formaat van een Omim- verslag en begeleid de gebruiker door de talrijke hyperlinks die beschikbaar zijn.

** Merk op dat „synuclein“ de termijn die als voorbeeld door dit protocol wordt gebruikt zal zijn. **

Het uitvoeren van een onderzoek OMIM

1. Open browser en ga naar de Ncbi- homepage (http://www.ncbi.nlm.nih.gov).

2. Verander onderzoekspull-down van GenBank in OMIM. Ga de de onderzoekstermijn of termijnen in het tekstvakje in, dat door de exploitanten Van Boole zoals „kan worden gekoppeld EN,“ „OF,“ of „NIET.“ Elke onderzoekstermijn kan, beurtelings worden gekwalificeerd, zodat het wordt vergeleken slechts bij bijzondere delen van het Omim- verslag. Zodra u de onderzoekstermijnen bent ingegaan, leg het onderzoek door de Go knoop voor te drukken, of door te raken ga op het toetsenbord binnen.

3. Selecteer de ingang OMIM van belang door op het overeenkomstige OMIM toetredingsaantal te klikken. Dit bijvoorbeeld, heb toegang tot de gedetailleerde ingang OMIM want alpha- -alpha--synuclein door op te klikken toetredingsaantal (*163890) hyperlinked.

4. Selecteer hoe te om de ingang te bekijken OMIM. Het pull-down menu naast de knoop van de Vertoning zal de gebruiker om tussen meningen toestaan te veranderen; zodra de gewenste mening uit het pull-down menu wordt geselecteerd, zou de gebruiker Vertoning dan moeten klikken. De default- vertoning is Gedetailleerd. Elk van de opties, maar niet alle opties zal voor elke ingang OMIM beschikbaar zijn. De gebruiker zal opmerken onmiddellijk dat er wat overtolligheid die in de interface OMIM, is wordt gebouwd in die zin dat bepaalde stukken van informatie in meer dan unidirectioneel kunnen worden gevonden. Een volledige beschrijving van het gedetailleerde Omim- verslag kan worden gevonden.

5. Van de gedetailleerde mening van de ingang, klik op de link van de de kaartplaats van het Gen 4q21 die onder de afwisselende titels en de symbolen dichtbij de bovenkant van het Omim- verslag verschijnt (of op de hyperlink duidelijke Kaart van het Gen in de navigatiestaaf aan de linkerkant van de pagina). De kaart van het Gen OMIM stelt de cytogenetische plaatsen van de genen voor die die in OMIM worden beschreven een gepubliceerde kaartplaats hebben. De lijst begint bij p telomere van chromosoom 1 en gaat door aan q telomere van chromosoom 22 verder. Dit wordt dan door de genen gevolgd die op de chromosomen van X en van Y worden gevonden. Header bij de bovenkant van de lijst geeft de details van de genwaaier die in de grafiek wordt getoond, evenals de cytogenetische waaier die in de grafiek wordt getoond. Voor vertoningsdoeleinden, worden de genen getoond in groepen van 20. Wanneer het gen de zelfde cytogenetische plaats zoals een ander gen deelt, worden zij gesorteerd door primair symbool. Wanneer er slechts een chromosomale plaats en geen cytogenetische bandplaats zijn, is het gen vermeld aan het eind van het chromosoom. In dit geval, begint de lijst met het gen SNCA, en zijn cytogenetische plaats is vermeld als 4q21. De lijst zal altijd met het gen beginnen waarvan de OMIM genkaart werd betreden.

6. Van de pagina van de Kaart van het Gen OMIM, kan men met de Ziekelijke kaart OMIM door op de link te klikken bij de bovenkant van de pagina verbinden. De basiseigenschap die de Ziekelijke Kaart van de Kaart onderscheidt van het Gen is dat de Ziekelijke Kaart alle vermelde genen in alfabetische eerder dan chromosomale orde voorstelt. Omim- hyperlinks beschikbaar links van een Omim- verslag

7. Terugkeer naar de pagina die de mening van de Vertoning voor de synucleiningang toont door de achterknoop van de Ziekelijke pagina van de Kaart tweemaal te klikken. In het linkerframe, zijn er veelvoudige hyperlinks die de gebruiker om gemakkelijk door het gedetailleerde Omim- verslag toestaan te navigeren. Specifiek, de links gebruikers nemen aan de de Beschrijving, het Klonen, Functie van het Gen, Afbeelding, Moleculaire Genetica, Dierlijke Model, Allelic Varianten, Verwijzingen, Medewerkers, de Datum van de Verwezenlijking, en geven de secties van de Geschiedenis van het verslag uit. Een link van de Lijst van de Mening enkel onder de Allelic link van Varianten neemt gebruikers aan een lijst van allelic varianten, eerder dan een uitvoerige beschrijving van de varianten.

8. De de kaartlink van het Gen biedt gebruikers een andere route aan de OMIM genkaart aan

9. Onder de kaart van het Gen is de link een hyperlink geëtiketteerd LocusLink. Het klikken op deze link brengt de gebruiker aan de relevante pagina LocusLink op de Website NCBI. LocusLink verstrekt één enkele vraaginterface aan diverse soorten informatie betreffende een bepaalde genetische plaats, zoals fenotypes, kaartplaatsen, en homologie aan andere genen. De LocusLink onderzoeksruimte omvat momenteel informatie van mensen, muizen, ratten, fruitvliegen, en zebrafish.

10. Terugkeer naar de pagina die de mening van de Vertoning voor de synucleiningang toont.

11. Bij de bodem van het linkerframe, is er een hyperlink geëtiketteerd LinkOut. Het klikken op deze link brengt de gebruiker aan de middelen LinkOut. LinkOut is een nut NCBI dat wordt ontworpen om gebruikers directe aanslutingen aan een grote verscheidenheid van relevante externe online middelen, met inbegrip van full-text publicaties, biologische gegevensbestanden, de gezondheidsinformatie van de consument, onderzoekhulpmiddelen, en meer te verstrekken. De resulterende links worden gegroepeerd in drie categorieën: medische, moleculaire biologiegegevensbestanden, en „andere.“

a. medische gegevensbestanden:

De Genen en de Ziekten van NCBI. Van het gegevensbestand van ncbi- Genen als Ziekten is zowel een uiterst nuttig gegevensbestand voor artsen, onderzoekers en wetenschappers. Dit gegevensbestand maakt deel uit van een aan de gang zijnde inspanning om ziekten in kaart te brengen en te kenmerken die door de verandering in één gen of een resultaat van veranderingen in verscheidene genen zoals astma en diabetes worden veroorzaakt. De de genen en plaats van de Ziekte met betrekking tot van de ingang SNCA in OMIM worden samengesteld uit twee secties. De eerste sectie van nota wordt in het grote middenpaneel gevestigd dat een overzicht van de ziekte bevat. De tweede sectie, over de linkerzijde, bevat extra links aan informatie over de Ziekte van SNCA en van Parkinson. De meest relevante bron van informatie van een klinisch standpunt wordt gevonden in de onderafdeling van de Informatie, naar de bodem van linkersidebar. Deze sectie omvat links aan algemene informatie voor werkers uit de gezondheidszorg, artsen en patiënten. Het omvat ook Medline plus eigenschap die wanneer geselecteerd een verbinding met de Klinische pagina van Proeven verzekert.

b. moleculaire biologiegegevensbestanden:

Het Gegevensbestand van het genoom. Het gegevensbestand van het Genoom (GDB) is de officiële centrale bewaarplaats voor genomic afbeeldingsgegevens als gevolg van het Menselijke Initiatief van het Genoom. Het menselijke Initiatief van het Genoom is een onderzoeksinspanning wereldwijd om de structuur van menselijke DNA te analyseren en de plaats en de opeenvolging van de menselijke genen te bepalen. Tot steun van dit project, opslag GDB en curates gegevens die wereldwijd door die onderzoekers belast met de afbeeldingsinspanning worden geproduceerd van het Menselijke Project van het Genoom (HGP). De link Synuclein met GDB toont al informatie die van GDB wordt opgeslagen over getoonde niet SNCA (). De getoonde informatie bestaat uit afwisselende gensymbolen, de cytogenetische plaats van het gen en het middel dat wordt gebruikt om het in kaart te brengen, nucleic zuurlinks voor het gen SNCA, eiwitlinks voor het gen SNCA, verwante amplimers en klonen, polymorfisme, klonen, fenotype en homologielinks, en extra externe links.

Gegevensbestand van de Verandering van het Gen van Cardiff het Menselijke. De plaats van de Verandering van het Gen van Cardiff Menselijke van het Gegevensbestand (HGMD) vertegenwoordigt een poging om bekende gepubliceerde genletsels bij elkaar te brengen verantwoordelijk voor menselijke geërfte ziekten in een uitvoerige verwijzingsbron. Het gegevensbestand van de Verandering van het Gen van Cardiff Menselijke verstrekt informatie van praktisch kenmerkend belang aan onderzoekers en diagnostici in menselijke moleculaire genetica, artsen geinteresseerd in een bepaalde geërfte voorwaarde in een bepaalde patiënt of een familie, en genetische adviseurs. Voor SNCA, de gegevensbestanddocumenten twee onzinveranderingen, die tot de ziekte van Parkinson bijdragen. De Website biedt ook hyperlinks aan veranderingskaarten, de cDNA inheemse opeenvolging, en de ingangen SNCA in het genoomgegevensbestand (GDB), GenAtlas, en OMIM aan.

c. Andere gegevensbestanden:

Het Gegevensbestand van het Genoom van de Muis van het Laboratorium van Jackson. Het gegevensbestand van het Genoom van de Muis van het Laboratorium van Jackson omvat gegevens over genkarakterisering en nomenclatuur, afbeelding, genhomologie onder zoogdieren, opeenvolgingslinks, fenotypes, allelic varianten en mutanten, en spanningsgegevens. Het gegevensbestand van het Genoom van de Muis verstrekt chromosomale plaats, afwisselende namen, polymorfismeinformatie, en zoogdierhomologie van het gen in het Omim- gegevensbestand.