Onthaal aan Moleculaire Post!

U moet registreren alvorens u op onze forums kunt posten of onze geavanceerde eigenschappen gebruiken. Register nu! Zijn Vrij en Snel!

Reeds geregistreerd? Login nu hieronder.

De Naam van de gebruiker:

Wachtwoord:

Herinner me?

Vergat reeds geregistreerd en uw wachtwoord? Klik hieronder om het terug te krijgen.

Krijg Verloren Wachtwoord terug

Treed nu toe - het is snel en vrij!

De moleculaire Post is overal het grootste netwerk van onderzoekers, wetenschappers en wetenschapsminnaars!

De recente Posten van het Forum

De Analyse van de Uitdrukking van het gen - Bio-informatica

De uitdrukking van het gen kan door verscheidene methodes met inbegrip van in grote trekken eiwituitdrukking, en mRNA uitdrukking worden bepaald.

mRNA de Analyse van de Uitdrukking

mRNA de uitdrukkingsanalyse of de uitdrukking van mRNA niveaus kan door veelvoudige technieken op niveau op grote schaal worden geanalyseerd deze omvatten:

• cDNA microarray analyse
• EST of uitgedrukte cDNA opeenvolgingsmarkeringen
• SALIE (Periodieke Analyse van de Uitdrukking van het Gen)
• Massaal het Parallelle Rangschikken van de Handtekening (MPSS)
• gemultiplexte kruising in situ

Bij kleinschaliger of resultaten van larger-scale bevestigen kan de volgende mRNA uitdrukkingstechnieken gebruiken:

• Rechts-PCR
• PCR in real time
• De beschermingsanalyse van de ribonuclease (RPA)

Nochtans, kan de bioinformatic analyse worden gebruikt. De analyse van Bioinformatic staat het mijden van biologische metingsbias en lawaai van de specifieke technieken toe en gebruikt statistische hulpmiddelen aan afzonderlijke significante verandering in genuitdrukking van lawaai in gen op grote schaal of de uitdrukkingsstudies van het hoog-productie.

Dergelijke studies kunnen worden aangewend om de genen te bepalen die bij een wanorde worden betrokken: men zou microarray gegevens van kanker epitheliaale cellen bij gegevens van nietkankercellen kunnen vergelijken om de afschriften te bepalen die in een bepaalde bevolking van kankercellen omhoog-geregeld en beneden-geregeld zijn.

De Analyse van de Technologie van GeneChip van Affymetrix

De Technologie van GeneChip van Affymetrix wordt gebruikt vaak om mRNA uitdrukkingspatronen te analyseren gebruikend een microarray benadering.

De ruwe gegevens die van GeneChip sondeseries kunnen worden geproduceerd worden geanalyseerd gebruikend software 4.0 en MAS5.0 van Affymetrix (MAS) (de Reeks van de Analyse Microarray).

De software van de Reeks van de Analyse van Microarray kan een verscheidenheid berekenen vele metingen gebruikend de kruisingsintensiteit die door de scanner van de sondeseries wordt gemeten.

Sommige Affymetrix analysealgoritmen

De ruwe Analyse van Gegevens

De intensiteit van de volledige sondeserie wordt gebruikt voor Achtergrond en van het Lawaai berekeningen in ruwe gegevensanalyse.

Andere metriek vergelijken de intensiteit van de opeenvolging-specifieke Perfecte de sondecellen van de Gelijke (PM) met de sondecellen hun van de controleWanverhouding (MM.) voor elke sonde die wordt geplaatst om te bepalen als een afschrift Huidig (p), Marginaal (m), of Afwezig (a) is. Daarna, worden de aantallen Positieve en Negatieve sondeparen bepaald voor elke sondereeks. De aantallen Positieve en Negatieve sondereeksen worden dan gebruikt om metriek af te leiden die de prestaties van elke sondereeks, Positieve Fractie en de Verhouding Pos/Neg beschrijven. De ruwe gegevensanalyse resulteert ook in de Vraag van de Afwezigheid en van de Aanwezigheid, Gemiddeld verschil, en de Niveaus van de Uitdrukking.

De Analyse van de vergelijking

De analyse van de vergelijking geeft Normalisatie en het Schrapen, de Berekening van de Verandering van Vouwen en de Coëfficiënten van de Correlatie.

Functionele Verhoudingen

De functionele Verhoudingen kunnen worden geanalyseerd door verscheidene methodes met inbegrip van te gebruiken:

• De genen van de lijst door veranderingen in hun uitdrukking met inbegrip van vouw-verhoging of Daling
• Phylogenetic Bomen
• Self-Organizing Kaarten
• De Netwerken van de relevantie

De eiwit Analyse van de Uitdrukking

Zie eiwituitdrukkingsanalyse voor meer informatie over dit onderwerp.

Het Forum van de Bio-informatica van de Uitdrukking van het gen

Bespreek en post vragen over genuitdrukking in het Forum van de Bio-informatica.