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과학은 항상 틀린다. 그것은 결코 10개을 좀더 만들기없이 문제를 해결하지 않는다. ~GeorgeBernardShaw
수색은을 위해 유래한다: 뇌관
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고전적인 인종 프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/14/pdb.prot4131을
사용하여5'최후 DNA확대 종류: PCR은 의정서를 작성한다: DNA종합은 의정서를 작성한다 "5'최후" 고전적인 인종을 사용하여 부분적인DNA복제품을 생성하기 위하여는, 첫번째 물가 제품은 알고있은 유전자 명확한 뇌관 (GSP-RT)에서 반전 녹음방송 (뇌관 연장)에의해 생성된다. 그때,poly(A)꼬리는 끝deoxynucleotidyltransferase(Tdt) 및dATP을 사용하여 추가된다. 확대는 3개의 뇌관을 사용하여 실행된다. - [고전적인 인종 프로토콜을 사용하여 읽은5'최후DNA확대] |
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96-Well견진 효모PCR프로토콜 -http://sequence-www.stanford.edu/group/yeast_deletion_project/96_well_confirmation.html 종류: 효모는 의정서를 작성한다: 효모 핵산은 의정서를 작성한다: 효모PCR은 의정서를 작성한다 96-well견진 효모PCR을 위해 프로토콜. 포함한다: 클론 정화; 마스터판을 (96-well체재) 생성하십시요; 얼는 보완 주식을 만들; 1개의 줄을 위해 견진PCR; ORF명확한 견진PCR-->"AB" 뇌관 (상류 접속점); 믈디월lPCR격판덮개에 이동 템플렛DNA; ABPCR을 위해 주된 혼합을 준비하고 분배하십시요. - [읽은 96-Well견진 효모PCR프로토콜] |
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해결책 프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4100에서PCR제품을
순화하기를 위해 자석 입자 기초를
둔 방법 종류: PCR은 의정서를 작성한다 MagneSil시스템은 선택으로 뇌관과 뇌관 - 이합체에서150150-bp보다는 더 오랫동안 이는PCR제품을 고립시킬 수 있는다. 기술은Beckman풀베는 날 sBiomek2000년과FX실험실 자동화 워크스테이션을 포함하여’다수 로봇식 워크스테이션에, 사용될 수 있는다. 절차는 또한 손으로 하 실행될 수 있는다. 전형적인 회복은 뇌관 뉴클레오티드의 사소한 이월에 1 킬로 비트 제품을 위해 더 보다는80%이다. - [해결책 프로토콜에서PCR제품을 순화하기를 위해 자석 입자 기초를 둔 방법이라고 읽는] |
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증폭된 파편 길이 동질다상
및Microsatellites -http://webdoc.gwdg.de/ebook/y/1999/whichmarker/m12/Chap12.htm 증폭된 파편 길이 동질다상 및Microsatellites: 계통 발생 원근법. 율리우스P.Robinson,StephenA.해리스. AFLPs은 무엇과 라고 그들 생성하는가 이는가? AFLPs은 어떻게 사용되었는가? 문제? 금지 효소와 뇌관. AFLPReproducib- [읽은 증폭된 파편 길이 동질다상 및Microsatellites] |
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증폭된DNA프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3835의Termini에
금지 사이트의Addition에의한 클로닝 PCR제품 종류: PCR은 의정서를 작성한다: PCR클로닝은 의정서를 작성한다 PCR안에 사용되는 그들의5'지구안에 금지 사이트에 올이g온읒러XX이d어 뇌관의 쌍은 수시로 디자인된다. 많은 경우에, 사이트는 2개의 뇌관안에 다르다. 의 경우에는, 확대는 그의 더r민이이 지금 플라스미드 선그림으로 방향 클로닝을 위해 이용할 수 있는 새로운 금지 사이트를 나르는 표적 파편을 생성한다. 순화된 파편 및 선그림은 적당한 금지 효소에 소화되고, 함께 잡아매고,e콜라이로 변형시킨다. - [증폭된 DNA프로토콜의Termini에 금지 사이트의Addition에의한 읽은 복제하는PCR제품] |
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식민지PCR프로토콜ii -http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4141 프로토콜은 재조합형 플라스미드를 나르는 박테리아를 위해 가리는PCR의 사용을 기술한다. PCR은 복제한 삽입의 확대를 위해와같은 동일한 뇌관을 사용하여 실행될 수 있는다. 삽입의 오리엔테이션을, 제 3 의 결정하기 위하여는, 클론 삽입 사이트에서 불균형으로 멀어지는 삽입하 명확한 뇌관 이용될 수 있는다. - [읽은 식민지PCR프로토콜ii] |
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DNA도서관의 건축은 - http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3560의정서를
작성한다 종류: DNA은 의정서를 작성한다: DNA도서관은 의정서를 작성한다 여기, 단계 1안에 종합되는DNA-RNA잡종은 전장double-strandedDNAs으로 개조된다. 제 2 물가DNA의 종합을 위해 뇌관은DnamRNA잡종의RNA모이어티로 흠을 도입하는RNaseH에의해 만들는다. e콜라이DNA폴리메라이제i은 템플렛으로 첫번째 물가DNA을 사용하여 새롭게 만들은3'수산기 더r민이을, 확장한다. - [DNA 도서관 프로토콜의 읽은 건축] |
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큰 삽입 플라스미드 템플렛을 위해
주기 순서 반응은 - http://bacpac.chori.org/cyclesere.htm의정서를
작성한다 종류: DNA은 의정서를 작성한다: 프로토콜을 연속DNA 큰 삽입 플라스미드 템플렛을 위해 주기 순서 반응을 위해 프로토콜. 포함한다: CycleSequenceConditions; BAC과PAC선그림을 위해 유용한 뇌관. - [큰 삽입 플라스미드 템플렛 프로토콜을 위해 읽은 주기 순서 반응] |
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TaqDNA폴리메라이제 프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3803을
사용하여DNA의 dideoxy중재된
연속 종류: DNA은 의정서를 작성한다: 프로토콜을 연속DNA: Dideoxy은 프로토콜을 연속을 중재했다 TaqthermostableDNA폴리메라이제에의해 촉매 작용을 미치기 반응을 연속 올리기 온도에 실행되기 때문에, 이차 구조안에 부유한 뇌관 템플렛의 어닐링 에의해 일으키는 문제는 중대하게 완화된다. - [Taq DNA폴리메라이제 프로토콜을 사용하여DNA의 읽은dideoxy중재된 연속] |
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dideoxy중재하는PCR과 최후
레테르를 붙인 뇌관을 사용하여 반응을 연속
- http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3791의정서를
작성하십시요 종류: DNA은 의정서를 작성한다: 프로토콜을 연속DNA: Dideoxy은 프로토콜을 연속을 중재했다 이 프로토콜안에dideoxy연속을 위해 단순하 배가 좌초된DNA템플렛을 생성하기 위하여 불균형 PCR은 이용해 - [읽는 dideoxy중재하는PCR과 최후 레테르를 붙인 뇌관 프로토콜을 사용하여 반응을 연속] |
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차별 프로토콜 - http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3844을
보이십시요pCR 종류: PCR은 의정서를 작성한다 준 세포 직물 유형의mRNAs에서 파생되는 많은DNAs을 증폭하, 보이기 위하여 방법은PCR을 이용한다. 방법은 합성 올이g온읒러XX이d엇의 2개의 다른 유형에 의지한다: 정박된antisense뇌관 및 임의 감 뇌관. 전형적인 정박한 뇌관은 대강에 무료하다. mRNA의poly(A)꼬리의13의 뉴클레오티드 및 베낀 순서의 인접하는 2개의 뉴클레오티드. - [읽은 차별은 프로토콜을 보인다pCR] |
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다중pCR기초를 둔 방법
-http://www.genome.ou.edu/MultiplexPCRbasedSeq.html을
사용하여 연속을
지시하십시요 종류: DNA은 의정서를 작성한다: 프로토콜을 연속DNA 증폭한 세균성과 큰 삽입에서 직접적인 연속은 개량한 다중pCR기초를 둔 방법경유 인간 또는 쥐genomicDNA을 복제했다. 포함한다: MP-PCR을 위해 뇌관을 준비함; 확대; PCR제품 대청소; 연속. - [다중 pCR기초를 둔 방법을 사용하여 읽은 직접적인 연속] |
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방법
-http://www.genome.ou.edu/protocol_book/protocol_partIV.html#IV.C을 연속DNA 종류: DNA은 의정서를 작성한다: 프로토콜을 연속DNA DNA연속을 위해 방법. 포함한다: Bst 촉매 작용을 미친 방사선DNA연속; 방사선 연속 젤 준비, 선적, 및 전기 이동법; 형광성 레테르를 붙인 염료 뇌관을 사용하여 연속 주기가taq폴리메라이제에 의하여 촉매 작용을 미쳤다; 형광성 레테르를 붙인 염료 터미네이터 반응을 사용하여 연속 주기가taq폴리메라이제에 의하여 촉매 작용을 미쳤다; 염색하 레테르를 붙인 터미네이터에Sequenase[TM]촉매 작용을 미친 연속; etc.. - [방법을 연속 읽은DNA] |
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PCR에의한DNA의 효소 확대:
표준 절차 및 최적화는 - https://commerce.invitrogen.com/index.cfm?fuseaction=iProtocol.unitSectionTree&treeNodeId=3DD21299A00419DEBAFDBC78E47CBE79의정서를
작성한다 DNA을 효소로 빠르게 관심사의 순서 그리고 뇌관 세트의 성공적인 확대를 위해 조건을 결정하, 특이성, 감도, 및 수확량을 위해 낙관하기 위하여 증폭하기를 위해 방법 절차를 포함하여 폴리메라이제 연쇄 반응 (PCR)에 의하여. PCR의 첫걸음은 간단하게 템플렛DNA, 2개의 적당한 올이g온읒러XX이d어 뇌관,Taq또는 다른thermostableDNA폴리메라이제,deoxyribonucleoside3인산염 (dNTPs), 및 버퍼 섞는 수반한다. - [PCR 에의한DNA의 읽은 효소 확대: 표준 절차 및 최적화 프로토콜] |
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세포안에
형광성In.situ녹음방송 및 직물은
- https://catalog.invitrogen.com/index.cfm?fuseaction=iProtocol.unitSectionTree&treeNodeID=9E6639A7FEDD7A49BBC3758516F99557&objectid=6677C9E8B913BFB72쥶9F654025F3C39A의정서를
작성한다 종류: 세포 유전학은 의정서를 작성한다: 형광성In.situ교잡 물고기는 의정서를 작성한다 방법은 직물 단면도안에 세포질mRNA사본을 사정하고 유일한 짧은을 사용하여 세포 배양은 순서 특히 지시되는 뇌관을protein(s)향하여 반대로 느낀다. unlabeled합성DNA올이g온읒러XX이d어 뇌관은 감mRNA사본에 장시간 무료하다 반전transcriptase을 사용하여 그리고 레테르를 붙이는 형광성 레테르를 붙인dUTP뉴클레오티드 기초의 합동으로. 이 절차는 다른 세포질에....관련시킬 수 있는 낮은 풍부mRNA메시지의 급속한 탐지를 제공한다 - [세포 와 직물 프로토콜안에 읽은 형광성In.situ녹음방송] |
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2 잡종 배열을 사용하여 단백질
단백질 상호 작용의 게놈 넓은 분석:
ORFs-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/abstract/2006/23/pdb.prot4561 의 확대 종류: 효모는 의정서를 작성한다: 효모 단백질은 의정서를 작성한다: 효모 단백질 단백질 상호 작용은 의정서를 작성한다 이 프로토콜은 배열을 건설하기안에 첫걸음을 기술한다: 예언된ORFs의 확대 배열안에 포함된것을 이는. recombinational클로닝을 촉진하는 선그림 명확한 측면에 서는 순서를 포함하는 유전자 명확한 뇌관은 각ORF을 증폭하기 위하여 사용된다. ORF을 측면에 서는 일치하는 선그림 순서의 길이를 확장하기 위하여 이차 확대는 이용될 수 있는다. - [ 2 잡종 배열을 사용하여 단백질 단백질 상호 작용의 읽은 게놈 넓은 분석: ORFs의 확대] |
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반대PCR프로토콜ii -http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3487 종류: PCR은 의정서를 작성한다: 반대PCR은 의정서를 작성한다 뇌관이 유효한 까 어느것이를 위해 있있던DNA순서의 1개의 말을 측면에 서고 불명한DNA을 증폭하, 복제하기 위하여 반대PCR은 이용된다. 기술은 있있던 순서 및 그것의 측면에 서는 지구를 포함하는DNA의 준비의 금지 효소에 의하여 소화를 관련시킨다. 개인적인 금지 파편 (총계 포유류genomicDNA의 경우에 많은 수천)은PCR안에 템플렛으로 분자내 결찰에의해 원형, 그리고 회람을 돌린DNA으로 그때 사용된다 개조된다. - [읽은 반대PCR프로토콜ii] |
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식물GenomicDNA에서Retroelement-http://www.le.ac.uk/biology/phh4/retros.htm 의 격리 종류: 식물 생물학은 의정서를 작성한다: 식물DNARNA격리는 의정서를 작성한다 Retroelements과 그들의 유래물은 식물 게놈의 편재하는 풍부한 분대 이다. retroelements의 집시 - 그룹 상위 계층은Pseudoviridae(Ty1-copia),Metaviridae(Ty3) 및Retroposineae선 (무 리터)을 포함한다. 성분을 베끼는 모든 반전은 보편적인 분류안에 포함될 수 있는다. 포함한다: Pseudoviridae(Ty1-copia) 퇴화하는 뇌관; Metaviridae(ty3집시) 성분 퇴화하는 뇌관; 선요소 퇴화하는 뇌관; PCR프로그램. - [식물 GenomicDNA에서Retroelement의 읽은 격리] |
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DNAMOPAC프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/2/pdb.prot3484의
혼합 O리g온읒러XX이d어 뇌관을 달n
확대 종류: PCR은 의정서를 작성한다: DNA종합은 의정서를 작성한다 MOPAC안에, 펩티드의 아미노 맨끝과carboxy맨끝 순서는 펩티드의aminoandcarboxy맨끝 순서를 부호 매기는 올이g온읒러XX이d엇의 2개의 과다한 가족을 디자인하는 이용된다. 단백질을 내색하나 설치된genomicDNA도서관에서DNA의 세그먼트를 증폭하기 위하여 알고있는 직물에서RT-PCR이 준비하는DNA의 세그먼트를 증폭하기 위하여 뇌관은 사용된다. - [DNA MOPAC프로토콜의 읽은 혼합 O리g온읒러XX이d어 뇌관을 달n 확대] |
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다중 즉시PCR프로토콜 -http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4113 종류: PCR은 의정서를 작성한다: 실시간PCR은 의정서를 작성한다 다중 즉시PCR안에, 1개의 관안에 템플렛DNA에서 분리되는 유전자를 증폭하기 위하여 다른 레이블에 뇌관의 다른 세트는 사용된다. 이 프로토콜은invitrogen에서 럭스 (연장에 빛) 뇌관을 사용한다. 관심사의 유전자, 및 조 (6-carboxy-4',5'5'-dichloro-2'2'레테르를 붙이기 위하여FAM(6carboxy플루오레세인)은 다른 반응사이에 정상화하기 위하여 의7'd임XX오xy 플루오레세인)을 내부 제어로 내부관리 유전자를 레테르를 붙이는 사용된다 이용된다. - [읽은 다중 즉시PCR프로토콜] |
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PCR-http://sequence-www.stanford.edu/group/yeast_deletion_project/Primer_specs.html을
위해 Oligonucleotide세부사항 종류: 효모는 의정서를 작성한다: 효모 핵산은 의정서를 작성한다: 효모PCR은 의정서를 작성한다 PCR을 위해 요구되는 올이g온읒러XX이d어 세부사항을 위해 정보. 포함한다: 뇌관 선택; UPTAG뇌관; DNTAG뇌관; UP_45과DOWN_45뇌관; UP_90과DOWN_90뇌관. - [PCR 을 위해 읽은Oligonucleotide세부사항] |
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PCR뇌관 디자인과pcr반응 최적화. -http://www.mcb.uct.ac.za/pcroptim.htm PCR뇌관 디자인과pcr반응 최적화. EdRybicki. PCR을, 온도 및 시간 영향을 미치는, 요인 단련 온도 및 뇌관 디자인, 뇌관 길이, 퇴화하는 뇌관, 신장, 온도 및 시간 의 반응 버퍼,Cycl변성시킨 - [읽은 PCR뇌관 디자인 및pcr반응 최적화.] |
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pCR중재된 유전자 붕괴: 1
단계 방법 프로토콜 -http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4169 종류: PCR은 의정서를 작성한다 유전자 보충 실험안에 효모를 변형시키기 위하여pCR중재한 유전자 붕괴에의해 준비되는DNA은 이용할 수 있는다. 이 프로토콜은 관심사의 유전자에 일치하는 저 소재시에PCR제품의 삽입을 표적으로 하는 대략50의 뉴클레오티드에 꼬리를 달는 2개의 뇌관을 사용한다. 각 뇌관은 플라스미드 템플렛에서 각종 선택할 수 있는 감적을 증폭하기 위하여 디자인되는 보편적인 순서에 끝낸다. - [읽은 pCR중재된 유전자 붕괴: 1 단계 방법 프로토콜] |
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Pristionchuspacificus유전 프로토콜 -http://www.wormbook.org/chapters/www_ppageneticprotocols/ppageneticprotocols.pdf Pristionchuspacificus을 위해 유전 프로토콜. 포함한다: 얼것은worms; EMSXX아g언엇잇; PsoralenXX아g언엇잇; P.pacificus유전자 녹아웃을 생성하는 삭제 도서관의 건축; 관심사의 유전자를 위해 뇌관을 디자인한; 주입에 의하여RNAi그리고morpholino. - [읽은 Pristionchuspacificus유전 프로토콜] |
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siRNA뇌관을 달nRNA종합 프로토콜
-http://www.cshprotocols.org/cgi/content/extract/2006/1/pdb.prot4326 을 위해 프로토콜 RNA종합을 뇌관을 달 위하여 짧은 방해RNAs(siRNAs)은 RNA 의존하는RNA폴리메라이제 (RdRP)에의해 이용될 수 있는다. SiRNAs은 명확한 세포질mRNAs을 위해 타동사RNAi을 유도하기의 가능한dsRNA제품을 형성하는 뇌관으로RdRP에의해 사용될 수 있는다. - [siRNA뇌관을 달n RNA종합 프로토콜을 위해 읽은 프로토콜] |
GenomicDNA프로토콜의Populational분석genomicDNA의populational분석에 프로토콜. |
Microarrays프로토콜의GenomicDNA레테르를 붙임DNAmicroarrays은 유리 슬라이드 기질의 위에 로봇식 장비에의해 "더럽히는" 관심사의 유전자에 무료한DNA분자의 주문한 배열 이다. 세포안에 유전자의 표정은microarrays에 관심사의 세포의mRNA에서DNA을 준비하고기microarray에 교잡을 측정해서 감시될 수 있는다. 이 프로토콜은 배열에 더럽히는DNA에 교잡을 위해 조사로 사용을 위해genomicDNA의 레테르를 붙이기 기술한다. |
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