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서쪽 오점

분자 생물학 오디오오디오: 상세한 서쪽 오점 설명을 경청하십시오! 의례: 국제적인 인간적인 게놈 연구소.

서쪽 오점 정의: 서쪽에게 더럽히는 것은 특정 항체에 묶는 그들의 기능에 근거를 둔 단백질을 확인하고 찾아내기 위하여 이용된 기술 이다.

   서쪽 오점 분석은 많은 단백질의 혼합물에서 관심사의 단백질을 검출할 수 있다.  서쪽에게 더럽히는 것은 (kDa에 있는 크기 마커에 비교에 또는 사다리) 단백질의 크기에 대한 정보를 제공할 수 있고, 또한 단백질 표정에 정보를 제공한다 (치료되지 않는 견본과 같은 통제에 비교에 또는 다른 세포 유형 또는 조직). 

개요: 서쪽 오점은에 정보를 제공한다:

  • 단백질의 크기
  • 단백질 표정 양
  • 서쪽 오점 분석은 세포 또는 조직에서, 또한 생체외에서 종합했다는 것을 재조합형 단백질을 분석할 다는 것을 어떤 단백질 견본든지 분석할 수 있다. 서쪽 오점은 특성이 이 단백질을 위해 그것 인 방법 당신이 관심사의 단백질을 위해 시험하기 위하여 사용하는 항체의 질 에, 의지하고 있고. 항체는 지금 쉽게 상업적인 근원에서 획득 가능하, 관심사의 단백질을 위해 1개를 구매할 수 있다. 단백질이 비발한 단백질인 경우에, 항체를 너자신 생성하거나 회사를 당신을 위해 그것을 하는 얻어야 한다. 이런 경우에 소량의 세포 추출에서 순화되거나 재조합형으로 한 단백질을 적어도 필요로 할 것이다 (생체외 재조합형 단백질 표정 시스템에서 ie).   단백질에 특정 항체는 서쪽 오점에 단백질의 수천 대신에 관심사의 단백질에 특히 묶을기 수 있기 때문에 서쪽에게 더럽히기 생명 이다!

    서쪽 오점을 위한 단백질을 얻기에서 포함되는 단계의 숫자 1. 세부사항.

    서쪽 오점 견본 준비

     서쪽 오점 수행에 있는 단계를 선발하는 숫자 2. 숫자.

    서쪽 오점

    [상단]

    서쪽에게 더럽히는 것은 어떻게 작동하는가?

    아래 도표 1을 보십시오. 우선 먼저. 당신이 분석하고 싶은 세포 견본과 같은 단백질 견본을 얻으십시오. 단백질 함량을 풀어 놓기 위하여 세포를 Lyse. 크기를 기준으로 하여 단백질을 분리하는 젤에 이들을 달리십시오. 다음 전기를 사용하여 막에 이 젤 단백질을 옮기십시오. 이 막은 1 차적인 항체를 사용하여 관심사의 단백질을 위해 시험하기 위하여 그 때 사용될 수 있다.

    서쪽 오점을 필요로 하는 무엇이라고:

  • 단백질 견본
  • 관심사의 단백질을 검출하는 좋은 항체
  • 서쪽 오점은 1 차적인 항체를 막과 이전에 젤에 단백질의 수천에서 이 단백질을 검출하기 위하여 의지한다! (세포는 30,000의 다른 단백질을 포함할 수 있어 - 이 동일한 단백질은 바꾸이고 조차 300,000의 다른 단백질 이상! 준). 항체를 사용하여 1 차적인 항체 (이차 항체)를 당신이 단백질 항체 항체 샌드위치를 쌓아 올리는 인식한다!  이차 항체에는 가벼운 풀어 놓는 물질로 luminol 기질을 변환하는 말 무 과산화 효소 효소가 있다! 이 빛은 필름에 반점으로 검출된다. 이 반점에서 얼마 단백질이 다른 반점에 관련된 거기 있는, 또는 젤에 또한 달리는 크기 마커지에 관련된 단백질의 크기 결정할 수 있다.

    도표 2는 서쪽 오점 보기 젤을 보여준다. 차선 1은 단백질의 다른 알려진 크기를 보여주는 단백질 크기 마커 사다리, 이것 상업적으로 구매될 수 있다 이고 모든 반점의 크기는 팸플릿에서 주어진다. 차선 3은 암 견본이고 차선 5는 일반적인 견본이다. 볼 수 있던 대로 차선 3에 있는 단백질에는 흥미로운 차선 5에 있는 암 견본 보다는 더 높은 표정이 있다. 더구나, 차선 3과 5에 있는 단백질 반점은 같은 차선 1.에서 크기 사다리에 있는 제 2 반점 같은 크기이다. 우리는 그 때 우리가 사다리로 수신한 우리의 브로셔에서 알려진 단백질 크기를 봐서 좋다. 우리는 그 때 단백질의 크기가 80 kDa다는 것을 결정한다. 관심사의 우리의 단백질은 또한 80 kDa이다. 따라서 우리는 서쪽 오점이 작동했다는 것을, 그리고 단백질이 암 견본으로 높게 표현된ㄴ다는 것을 알고 있다!

    단백질을 검출하기 위하여:

  • 1 차적인 항체 근원에 대하여 항체를 사십시오
  • 결과를 얻기 위하여 ECL를 - 화학루미네슨스 장비와 필름 이용하십시오
  • [상단]

    1. 도표 2.를 도표로 만드십시오.

    westernblot

    보기 젤

    거기 그 외 모든 것이 서쪽 오점에 관하여 다는 것을 지금 배우십시오!

    [상단]

    서쪽 오점을 위해 잘 되는 순서 대로 목차:

    서쪽에게 더럽히기에 있는 단계:

    - 서쪽 오점을 위해 준비

    - 서쪽 오점을 위해 사용할 항체

    - 서쪽 오점을 위한 세포를 Lysing

    - SDS-PAGE 젤 정보

    - 서쪽 오점을 위한 SDS-PAGE 젤 준비

    - 젤 전기 이동법 - 젤을 달리기

    - 서쪽에게 더럽히기를 위한 막에 단백질의 Tranfer

    - 서쪽 오점

    서쪽 오점 분석에서 사용되는 기간과 정의

    최신 서쪽 오점 토픽!

    [상단]

    서쪽 오점 분석에 있는 단계:

    - Prepartation를 간색하십시오

    - 버퍼를 Lysing

    - 항체

    - 세포를 Lysing

    - 준비를 교질화하십시오

    - 달리는 젤

    - 젤의 이동

    - 통제

    - 서쪽 오점

    - 해독

    - 분석과 해석

    [상단]

    견본을 서쪽 오점을 위해 준비하기 위하여:

    비 부착한 세포 (T 세포 선 또는 주변 혈구와 같은) 또는 부착한 세포가 (섬유아세포 세포 또는 COS 세포와 같은) 다는 것을 매체에서 외부 단백질을 제거할 필요가 있다. 비 부착한 세포를 위해 온화하게 원심 분리에 그(것)들을 산탄 그 후에 PBS를 가진 펠릿을 세척할 수 있다. 부착한 세포, 간단한 세척 플라스크 또는 서쪽 오점 이전에 PBS를 가진 접시를 위해.

    서쪽 오점 분석은 단백질을, 검토하고 그래서 우리는 또한 단백질을 세포에서 방출이곤 그리고 단백질이 프로테아제로 위로 잘리는 것을 막는 원한다. 우리는 서쪽 오점에 이들을 필요로 한다:

    - 것을 찬 유지하기 위하여! 서쪽에게 더럽히기를 위한 세포 세포의 용해 도중 얼음에 4C

    - 세포의 막을 단백질을 풀어 놓기 위하여 끊도록 세제를 이용하십시오

    - 버퍼

    - 우리가 인단백질을 위한 서쪽 오점을 하는 경우에 억제물 (프로테아제 둘 다 억제물과 인산 가수분해 효소 억제물)

    제정성 - 서쪽 오점을 위한 세포를 Lysing

    SDS와 RIPA는 서쪽에게 더럽히기를 사용하여 최신 분석을 위한 단백질을 solubilize 이용되는 세제이다. 이것은 세포 또는 찾아낸 안쪽 세포막 안쪽에 만큼 단백질이라고 이다 요구된다, 그래서 우리는 그(것)들을 위한 immunoblot에 능력 있기 위하여 이 단백질을 풀어 놓을 필요가 있다.

    [상단]

    나는 어느 항체를 서쪽에게 더럽히기를 위해 이용해야 하는가?

    서쪽 오점을 위해 사용하기 위하여 항체를 선정해야 한다. 보통 마우스 단일 클론항체 또는 토끼 polyclonal 항체는 이용된다.

    어떤 추가한 그룹도 없이 항체를 이용할 수 있다, 또는 비타민B 복합체에 활용되는 항체를 이용하십시오. 이 항체는 요구하지 않는다

    서쪽 오점을 위한 단일 클론항체 대 Polyclonal

    단일 클론항체는 일반적으로 에게 치러야하는 서쪽에게 더럽히기를 위해 더 낫다:

    - 더 나은 잡음 대 신호 비율 (서쪽 오점에 있는 더 낮은 배경)

    - 그들의 더 높은 특이성 (더 적은 오염 단백질 또는 Ig를 얻는다)

    - 전반적인 세탁기술자는 서쪽 더럽히는 필름 (검출되는 보다 적게 일반적인 악대)에 유래한다

    Polyclonal 항체는 Immunoprecipitation를 위해 더 적합한다:

    - 그(것)들은 추가 epitopes를 인식한다

    - 더 높은 갈망이 있으십시오

    [상단]

    서쪽 오점을 위한 세포를 Lysing:

    당신의 앞에 끝은 서쪽에게 더럽히기를 위해 lyse:

    단백질 질량 (ie phosphorylated 이지 않는)를 위한 서쪽 오점에 단백질 가는 경우에:

    - 다른 단백질을 위해 더럽히기 위하여 나머지를 지키는 더 큰 양에서 lyse 할 수 있다 ()

    서쪽 오점에 인단백질 가는 경우에 (또는 phosphorylated 단백질) 뒤에 오는 것 하는 것이 중요하다:

    - 인산 가수분해 효소가 단백질에서 인산염을 제거할 것이기 때문에 사용 인산 가수분해 효소 억제물 확인하십시오 (vanadate와 같은! )

    - 당신이 lysed 세포의 대부분을 적재하기 수 있기 때문에 또한 가능한 가장 작은 양에 있는 세포를 lyse (ie는 100 ul 선적 버퍼, 이것에서 행해진다 lyse. 이것은 인단백질을 위해 서쪽에게 더럽힐 때 확실히 약하더라도 중요하더라도 신호가.)

    단백질 단백질 상호 작용을 보는 경우에:

    -와 이렇게 단백질이 변성되는 단백질 단백질 상호 작용을 해리한 대로 SDS를 사용하지 말라 (특히 비등 후에)

    - 서쪽 더럽히는 단백질 단백질 상호 작용, ie 고유한 상호 작용을 위해 - 그 같은 RIPA 보다 적게 엄격한 세제를 이용해야 한다.

    Lysing:

    - 격판덮개 또는 접시에 직접 행해질 수 있다

    - 세포를 산탄

    - 얼음과 감기에 유지하십시오 - 얼음 양동이를 사용하십시오

    - 얼마 세포의 용해 버퍼 사용하는 것은지 을 위한 어림짐작: 세포의 용해 버퍼의 10^5 세포/uL

    - eppendorf 관에서 모으고 레테르를 붙이십시오 (얼음에 이들을 지키십시오)

    서쪽 오점 분석의 앞에 총계 단백질을 측정하십시오:

    - 이것은 서쪽 오점 분석에 있는 처리 조건을 비교하고 싶은 경우에 정량 분석을 허용한다

    - 상업적인 장비는 총계 단백질 측정을 위해 Bradford 분석실험과 같은 유효하다 (생물 라드에서)

    - SDS의 0.1% 또는 더 중대한 단백질 측정과 충돌할 수 있다

    단백질 견본을 변성시키십시오:

    - 세포 lysate의 약수에 단백질 선적 견본 버퍼를 추가하십시오 - 염료를 포함한다 (너무 젤, 2% SDS에 이동을 보십시오)

    - beta와 같은 아황산 감소시키는 에이전트를 - mercaptoethanol 추가하십시오

    - 목욕 또는 난방 구획 (중앙과 같은 저온 -에 있는 헌데 90 도는 단백질 집단을 줄인다).

    - 터지는 것을 막도록 각 관의 모자에 있는 구멍을 찌르십시오

    서쪽에게 더럽히기를 위한 SDS-PAGE 젤 정보

    SDS-PAGE 젤은 전류의 면전에서 단백질을 분리하기 위하여 크기에 의해 이용되는 젤 매트릭스이다. 낮은 백분율 젤은 더 높은 백분율 젤이 더 작은 단백질을 잘 분리하더라도 반면 더 큰 단백질을 분리한다. 문제는 모든 단백질에는 그(것)들로 관련되는 비용이 부과된 있다 이다, 전류에서 이것은 문제를 일으키고다. 이것은 단백질 견본에 SDS의 추가에 의해 해결된다. SDS는 단백질에 각 몇몇 아미노산을 묶고 단백질에는 있는 책임 다름을 중화한다. 이것은 단백질이 크기와 책임으로 아닙니다 분리되는 것을 허용한다.

    [상단]

    서쪽 오점을 위한 SDS-PAGE 젤 준비

    - 얼마에 따라서 단백질을 서쪽에게 더럽히기를 위해 적재하고 싶을지, 작은 빗 또는 더 큰 빗을 사용해야 한다.

    - 아크릴아미드의 백분율은 중요하다. 일반적으로 10% 아크릴아미드는 이용된다.

    - 해결 젤은 8.8의 PH를 가진 바닥에 이용된다

    - 겹쳐 쌓이는 젤 (4-5%) PH 6.8는 적재 후에 단백질을 함께 안으로 포장하기 위하여 이용된다

    - 젤의 중합은 poly-acrylamide 젤의 중합 반응을 (대형과 응고) 가속화하는 TEMED와 촉매 APS에 의해 증가된다.

    - 각 견본을 천천히 차선에서 새는 견본을 방지하기 위하여 주의깊게 적재하거든.

    - 각 차선을 적재하고 각각에 있는 견본 버퍼를 이용하십시오 (다름을 안으로 방지하기 위하여).

    [상단]

    전기 이동법을 교질화하십시오

    1. 비등 후에 10 SEC를 위한 견본을 원심 작용을 받게 하십시오.
    2. 각 차선으로 견본을 적재하십시오
    3. MW 참고를 적재하십시오
    4. 젤을 100V (일정한 전압)에 달리고십시오 또는 40 mA (일정한 현재)에 나아지십시오. 단백질 마커 또는 사다리를 보거나 젤을 중단하기 위하여 언제를 위한 정면을 염색하십시오. 일정한 현재는 시간을 있는 경우에 더 낫고 더 예리한 결과를 준다.

    - 유리 사이 그리고 젤의 밑에 거품을 위한 시계 - 작동하고 있다는 것을 이것은 의미한다

    - 단백질 이동을 위한 시계 (내려갔음에 틀림없다) - 만일 아닙니다 지도를 전환하고 견본을 전부 분실할 수 있으면!

    - 겹쳐 쌓이는 젤 (~ 50 볼트)를 통해서, 이것 준다 더 예리한 악대를 처음에 천천히 달리십시오.

    - 밤새껏 달리지 말라

    - 젤을 과열해 (이것은 젤이 단단함을 분실하는 원인이 되어, resoloving 영세민 및 희미한 몹시 형성한 악대에 지도한)

    [상단]

    서쪽에게 더럽히기를 위한 막에 단백질의 Tranfer

    막 유형을 선정하십시오:

    다음중 하나를 사용할 수 있다:

    - 서쪽 오점을 위한 PVDF 막

    - 서쪽 오점을 위한 니트로셀룰로오스 막

    - 지금 사용된 나일론 막 (드물게 - 찢을 수 있지 않는다)

    서쪽 막으로 옮기기를 위한 팁:

    - 장갑을 항상 착용하십시오! 겸자를 사용하십시오

    - 막에 만지거나 겸자를 극소화하십시오

     

    생물 라드 이전발주:

    (-)
    검정에 갯솜
    여과지
    젤 니트로셀룰로오스
    여과지
    갯솜
    (+)

    이동:

    - 4C에서 차가운 유지하십시오

    - 35의 볼트에 밤새껏 옮기십시오

    - 더 높은 V에 1 시간에서 빨리 옮길 수 있다

    [상단]

    서쪽 오점

    막의 막는 것은 신호를 확대하는 것을 허용한다: 소음 비율

    - 장갑을 착용하십시오

    - 만취한 5%를 가진 구획 (무지방 분유 - 분말) 또는 phosphorylated 단백질을 위한 1 - 5% BSA (둔감한 혈청 알부민).

    - 버퍼는 TBST이다

    막기 후에 세척

    - 단계를 막기 후에 세척은 1 차적인 항체 외피 도중 중요하지 않기, 때문에 사람들 수시로 구획.

    - 씻기는 일반적으로 TBST 버퍼로 행해진다. TBST의 큰 양으로 빨리 행해질 수 있다.

    1 차적인 항체를 가진 외피

    - 마우스, 토끼 또는 다른 종

    - 일반적으로 1: TBST를 가진 1000년 희석

    - 높은 백그라운드 또는 많은 일반적인 악대가 문제인 경우에, 외피는 5% BSA 또는 우유로 끝날 수 있다.

    1 차적인 항체 후에 세척

    - 이렇게 중요한

    - TBST의 큰 양으로 빨리 세척할 수 있다

    이차 항체의 외피

    - 일반적으로 묽게 된 1: 10, TBST에 000

    - 반대로 마우스, 반대로 토끼, 또는 다른 항체는 탐지를 위한 HRP 효소로 활용시켰다

    이차 항체 후에 세척

    - 중요한

    - TBST를 가진 5 분 동안 세척 5 X.

    - 실제적으로 돌진해야 하는 경우에, TBST의 더 큰 양을 가진 적어도 3 시간을 세척하기 위하여.

    결과를 위해 분석

    - 일반적으로 ECL (강화된 화학루미네슨스)는 사용된다

    - 필름은 드러내고 개발된다. 10 초 동안 노출은 총계 단백질을 위해 충분히 일반적으로 이다. 인단백질은 2개 - 20의 작은 노출을 요구할 수 있다.

    - 필름은 일반적으로 XOMAT 또는 유사한 "빠른" 필름이다

    [상단]

    분쟁 해결 서쪽 오점을 보십시오

    서쪽에게 더럽히기에서 사용되는 기간:

    WB - 서쪽 오점

    IB - immunoblot (서쪽에게 더럽히기를 위한 다른 기간)

    SDS - 나트륨 Dodecyl 황산염 (많은 서쪽 더럽히는 해결책에서 이용되는 세제)

    페이지 - Polyacrilamide 젤 전기 이동법

    Ab - 항체 (관심사의 단백질을 검출하기 위하여 항체는 이용된다)

    HRP - 말 무 과산화 효소

    Luminol - 가벼운 대형에게 일으키는 원인이 되기 위하여 HRP가 쪼개는 기질

    ECL - 강화된 화학루미네슨스 (가벼운 대형을 HRP + Luminol 강화하는 서쪽 오점 해결책)

    kD/kDa - kilodalton (대부분의 단백질은 30 평균한다 - 80 kDa 사이에서)

    렘 - 토끼 반대로 마우스 Ig

    Ig - 면역 글로불린 (항체 isotype)

    NP-40 - Nonidet P-40

    PMSF - phenylmethylsulfonyl 불화물

    BSA - 둔감한 혈청 알부민

    NFDM - 무지방 분유

    [상단]

    서쪽 오점 토픽

    벽돌 또는 공백 오점 제 시간 포스터는, 그러나 나의 문제를 적합하게 제기하기 위하여 최선을 다할 것이다. 나는 상당량의 계속 서쪽 경험이 있고, 그러나 극복할 수 없습니다…
    감마 H2AX 안녕 전부의 탐지! 나는 그(것)들에 DNA 손상을 유도하고 IR를 사용하여 핵에서 감마 H2AX 단백질 (15kDa)를 위해 검출하는 것을 시도하는 신경교종 세포와 AM로 작동하고 있다…
    나가 단백질에 의하여 고립시켰다 안정적으로 특정 유전자를 표현하는 포유류 세포 배양에서 총, 핵과 세포질 단백질을 머물렀다. qPCR 분석은 거기 보여주었다 그것을…
    GFP 항체 어이, 나는 GFP를 서쪽을 위해 1 차적인 antiobody 살 필요가 있는 것을 대략 이고, 누군가가 좋은 것에 관하여 사기 위하여 알고 있는지 생각해 보고 있었다. 감사합니다
    선적 통제 계산 나는 나의 WB를 위해 선적 통제로 악틴을 이용하고 있다. 나는 쥐 두뇌를 달리고 있다. 나는 우리와… 관련있지 않는다는 것을 나가 자부한다 악틴에 있는 경미한 변경 본다

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    [상단]


     

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