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RNAはゼリー状になる

版権2007年-分子端末

 

RNAのゲルの電気泳動の歴史

分かれ、質的に隔離されるサンプルからRNAの品質を査定するのに長年に渡ってRNAのゲルが使用されていた。 チェックアウトはどんなRNAであるか確実でなければ:

音声は分子生物学の音声 詳しいRNAの説明を聞く! そして私達のRNA百科事典の記事を見なさい。

RNAのゲルの電気泳動-基礎的な情報

RNAのサンプルの隔離の後で、隔離されたRNAの準備の品質は通常変化のagaroseのゲルの電気泳動によって査定される。 結果が主に質的であるが、RNAの収穫についての情報をまた手に入れることができる。

RNAがそれ自身に折り、分子内に基礎に組み合わせることによって広範な、安定した二次構造を形作りがちであるのでゲルを変化させて使用される。 RNAのこの二次構造はそれがサイズに従って主に移行することを防ぐ。

あなたが問題はゲルにまたはあなたが分析しているRNAとの問題だったかどうか定めることができる珍しい結果を得ることゲルのRNA肯定的な制御を含んでいるケースでことを、確かめなさい。 またそのままであるためにRNAの分子量のマーカー、知られているRNAのサンプルを使用できるまたは両方とも、このために使用することができる。

RNAのゲルは汚れるethidium臭化物とethidium臭化物がRNAの分子の二次構造の間で挿入し、RNAが紫外線の下で見られるようにすると同時に視覚化される。

RNAはゲルの電気泳動(通常agaroseのゲルの電気泳動)で分かれている。 RNAのゲルを実行した後プローブとの膜、交配、および最終的に検出へのそれに続く転送の北のしみを行なうことができる。 または単に(そして大いにより速い)、ethidium臭化物を使用してRNAのための汚れかSYBR (または同じような染料-それとして無毒、より安全があるよりよい)。

 

RNAのアプリケーションはゼリー状になる

北のしみが完了してがRNAのゲルおよびリアルタイムPCRより大いに退屈であるので、RNAのゲル程に多く使用されない。

RNAのゲルの電気泳動および変化は分子生物学の研究で使用される:

  • RNAを検出しなさい
  • RNAの品質のための試金は隔離した
  • RNAの量または収穫の汎用決定を可能にしなさい
  • RNAの劣化のための試金

RNAの不利な点はゼリー状になる

RNAのゲルの電気泳動の使用の不利な点は下記のものを含んでいる:

  • RNAのゲルは非常に量的ではない。 RNAの収穫を正確に定めるか、または標準となることができない。 北のしみが付くか、または点のしみのような放射性方法ははるかに正確である。
  • 多くの場合ethidium臭化物がRNAを検出するのに使用されている。 Ethidium臭化物はmutagenicおよび有毒であるのでbiohazardである。
  • しかしRNAのゲルは紫外線分光測光か他の方法RNAの収穫の速い決定を速くない可能にする。

RNAの利点はゼリー状になる

RNAのゲルの利点は下記のものを含んでいる:

  • それは広く受け入れられた方法である
  • RNAのゲルは行い非常に速く、易い
  • 1-2時間以内のRNAの品質のために試金できる
  • SYBRか別の無毒な汚れ(すなわちEthidium臭化物を使用しない)を使用すれば、RNAのゲルはかなり安全である。

RNAのゲルのプロトコル

RNAの保全を確認するためには「北のしみ」の分析をするべきである。 これを達成するためには変化のゲルを実行しなければならない。

RNAの使用のミディゲルへの小型ゲルのため: 50のmL100mLを作りなさい

メガゲルのために400のmLを作りなさい。

 

100mLゲルのために(最も一般に動作する) 1%のagaroseの解決をするためにagaroseの1gを追加する必要がある。

 

RNAのための連続したバッファ調理法はゼリー状になる

準備するため: 500mls 750のmls 1.5リットル

1X Eバッファ(50X) -次
10のmL 15のmL 30のmL
0.66Mのホルムアルデヒド(Vol.の1/19年) 26.3 mL 39.5 mL 79のmL

試薬を変化させるRNA

試薬を変化させるRNAの400ulを準備するため:

次を追加しなさい:

  • 80%は300ulをForamide脱イオンした
  • 3.7%のホルムアルデヒド40 ul
  • 1X 50X Eバッファ8 ul
  • dH2O = 400ul 52ul

1リットルあたり50のX Eバッファ

追加しなさい:

  • 0.9 M Na2 HPO4二塩基の127.8 g
  • 0.1M NaH2PO4一塩基13.8のg

プロトコル: RNAのゲルの準備のステップ

  1. 解決にagaroseを置きなさい。
  2. ティッシュ差し込まれたフラスコの準備された解決を熱しなさい
  3. 60°Cに涼しい許可しなさい
  4. 0.66Mに匹敵するためにホルムアルデヒドを2.7 ml 4.0 5.3 21.2追加しなさい
  5. フラスコにそれを使用すれば(Ethidium臭化物を追加しなさい)
  6. ゲルを注ぎなさい(フードでもし可能なら)。
  7. 涼しい10 min.の75°CでRNAの2 ugを、そして速く熱しなさい。 (これはRNAがsingle-stranded変化し、とどまるようにする)。
  8. 追加しなさい: 試薬を変化させるRNAの2.5 Vol.
  9. サンプルにローディングの染料の1/10のVol.を追加しなさい。
  10. agaroseのゲルの井戸にサンプルをロードしなさい。
  11. 30minutes-2時間ゲルを(通常100Vボルト)実行しなさい。 (染料のマーカーを使用して動作する点検のRNA)


RNAのためのヒントはゼリー状になる

品質を査定するためにRNAのagaroseのゲルを常に実行しなさい。 紫外線分光測光の結果だけ頼るただ。

*すべてのステップのための使用のDEPCによって扱われる水そして焼かれたガラス製品。 突進にあればバッファが自由にRnaseであるMiliporeによって浄化される水を使用しなければ。 Rnaseはどこでもある! 摩耗の手袋は、焼かれたガラス製品、か無穿孔プラスチックだけ使用する。 DePCの御馳走水、バッファ(Trisを除いて)。 非常に注意しなさい。

 

トラブルシューティングのRNAはゼリー状になる

現在RNAを実行するための好まれる方法を有したら、それを使用し続けなさい。

RNAのプロトコルフォーラムのRNAのゲルについての論議し、ポストの問題または質問。

RNAのゲルの参照