異方性水素結合のきめの粗いアルファカーボン蛋白質モデル。 研究の抽象的な細部
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EHの吠え声、NL FawziのTヘッドGordon、
英国Huiの吠え声、ニコラスのルクスFawziのテレサヘッドGordon、
私達はアルファ螺旋形およびベータシートを安定させるために組み合わせる特定の水素結合をもたらすポリペプチドの鎖のオリエンテーションの依存の中間フィールド推定値を組み込むためにシーケンスによって基づくアルファカーボンモデルを開発する。 私達は熱力学の手段の捕獲の新しい蛋白質モデルの成功を説明し、私達の前のきめの粗いモデルと比較される蛋白質LおよびG.の折るメカニズムは蛋白質シーケンスのdesignabilityで運動率のための正しい傾向および蛋白質LおよびG.のためのメカニズムの予測と同様、新しいモデルより大きい折るcooperativityおよび改善を、示す。 私達はモデルが他の蛋白質折りたたみおよび蛋白質蛋白質coアセンブリプロセスに広く適当、ネイティブ州の位層幾何学の記述を越える実験入力を必要としないことを信じる。 第三位層幾何学情報なしで、それはまたポリペプチドの鎖の原子記述におろすために繋ぐことができるより徹底的なconformational探索戦略のための中間解像度蛋白質モデルとして役立つことができる。
著者: テレサヘッドgordon
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PUBMED ID PMID:
MEDLINEの日付:
出版物のタイプ: 研究サポート、非米国Gov
ジャーナル: 蛋白質
ボリューム: 70
ページ番号: 626-38
ジャーナル省略: 蛋白質
ISSN: 1097-0134年
日: 15
月: 2月
年: 2008年
参照の番号:
言語: 英語
NlmUniqueID: 8700181
キーワード:
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登録番号:
加入: 生物工学のUCSF/UCBの接合箇所の卒業生のグループ、バークレー、カリフォルニア94720、米国。
国: 米国
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MEDLINETA: 蛋白質
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