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純充満が付いている分子は電界で移動する。 電気泳動と名づけられるこの現象はDNAおよびRNAのような蛋白質そして他の高分子を分ける強力な方法を提供する。 電界の蛋白質(または分子)の移行の速度は蛋白質の電界強さ、純充満および摩擦係数によって決まる。
反対側に満たされた電極の方に満たされた分子を運転する電気力は移動分子と媒体の摩擦から起こる不道徳な抗力によって反対される。 摩擦係数は移行の分子の大容量および形および媒体の粘着性両方によって決まる。
電気泳動の分離は自由な解決のゲルで2つの理由でよりもむしろほぼ(またはペーパーのような一致した指示で)常に遂行される。 最初ゲルは小さい気温傾度によって作り出される結合流れ有効な分離のための条件を抑制する。 第2ゲルは分離を高める分子ふるいとして役立つ。 気孔より大きい分子が大いにほとんど不動である一方、ゲルを通してゲル容易に比較される小さい移動の気孔と分子。 中間サイズの分子はさまざまな程度の機能のゲルを通って移動する。 ポリアクリルアミドゲルは化学的に不活性、acrylamideの重合によって容易に形作られるのでelelectrophoresisのための選択のサポート媒体である。 さらに、気孔のサイズはacrylamideおよびmethylenebisacrylamide (cross-linkingの試薬)のさまざまな集中の選択によって重合の時に制御することができる。