Bioinformaticのツールは2次元(第2)または3次元の蛋白質の構造をできる(3D)予測。 これはそれが酵素のポケットを予測するよい起点であるおよび蛋白質蛋白質の相互作用の領域かもしれないどんなに蛋白質の実際の構造の実質の表示ではない。 予言の後で、蛋白質の構造の確認はX線の結晶学の技術を使用して作ることができる。
(第2予言については私達の蛋白質が予言のBioinformaticのツールのデータベースを構成するのを見なさい;
そして蛋白質の構造の予言Bioinformaticは3D予言のためのデータベースに用具を使う。; そして3Dデータベースから蛋白質の構造データを検索するための私達のデータベース。
予言蛋白質の構造で助けるのに実験データが使用することができる。 次は蛋白質の構造解析で助けることができる実験である:
-二硫化物結束のローカリゼーション(スペースのシステインの位置で堅い制限を提供しなさい)
-興味の蛋白質の二次構造の構成への糸口を与えることができる分光学データ
-サイトは酵素または蛋白質蛋白質の相互作用の結合のサイトまたは領域の実行中のサイトで重要である残余に重要な洞察力を与えることができる突然変異誘発の実験を指示した、(アラニンを翼部さまざまなアミノ酸の代わりにし、次に蛋白質の機能を点検する)。
-ポスト翻訳のmodifictionsの実験データを得なさい(例えばリン酸化およびglycosylationのサイトは外部にアクセス可能でなければなり、こうして表面の残余であるかもしれない残余を提案できる)
-蛋白質分解開裂のサイト。
蛋白質の構造の予言を行なうことが重要なときこのデータに留意することは、これとして証明されたexperimentally.0の構造データである
構造の予言が実験結果と一致するかどうか質問。 これは予測された蛋白質の構造の妥当性をテストできる。
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