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Bioinformatic のツールは2 次元(第2) または3 次元(3-D) の蛋白質の構造を予測できる。これはそれが酵素の&ケットを予測するよい起点であるおよび蛋白質蛋白質の相互作用の領域かもしれないどんなに蛋白質の実際の構造の実質の表示でない。予言の後で、蛋白質の構造の確認はX 線の結晶学の技術を使用して作ることができる。
(第2 予言 については私達の蛋白質が予言のBioinformatic のツールのデータベースを構成するのを見なさい;
そして 蛋白質の構造の予言Bioinformatic は3-D 予言のためのデータベースに用具を使う。; そして3 次元のデータベースから 蛋白質の構造データを検索する為の私達のデータベース。
実験データが予言蛋白質の構造で助けるのに使用することができる。次は蛋白質の構造解析で助けることができる実験である:
- 二硫化物結束のローカリゼーション(スペースのシステインの位置で堅い制限を提供しなさい)
- 興味の蛋白質の二次構造の構成への糸口を与えることができる分光学データ
- サイトは(アラニンを翼部様々なアミノ酸の代わりにし、次に蛋白質の機能を点検する) 酵素または蛋白質蛋白質の相互作用の結合のサイトまたは領域の実行中のサイトで重要である残余に与える重要な洞察力をできる突然変異誘発の実験を指示した。
- &スト&訳のmodifictions の実験データを得なさい(例えばリン酸化及びglycosylation のサイトは外部にアクセス可能でなければなり、こうして表面の残余であるかもしれない) 残余を提案できる
- 蛋白質分解開裂のサイト。
蛋白質の構造の予言を行なうことが重要なときこのデータに留意することは、これとして証明されたexperimentally.0 の構造データである
構造の予言が実験結果と一致するどうか質問。これは予測された蛋白質の構造の妥当性をテストできる。