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PCRのプライマーデザイン

PCRのためのプライマー

プライマー選択のための指針:

  • PCRのプライマーは長さが15-30のoligoヌクレオチドとして設計されている。 より長いプライマーは通常より高い特定性を可能にするか、またはクローニングのためのプライマー端に制限の酵素のサイトの付加を可能にする。
  • プライマーオリゴヌクレオチドのGCの内容は40-60%の範囲にあるべきである。 GおよびCのヌクレオチドはG'sのクラスタとして均一に配られるべきであるまたはCの原因の無指定の起爆剤は発生するかもしれ、高いGCの内容はPCRの効率を損なう。
  • プライマーは反応混合物の他のプライマーに自己補足または補足べきではない。 互いに補足するプライマーはプライマーおよび試薬の使用のためにテンプレートと競う。 これらはプライマー二量体およびヘアピン形成時プライマー自己補数呼出される。
  • プライマーの溶ける温度Tmに5°C.よりもっと相違があるべきではない。

オンラインでPCRのプライマーデザインソフトウェア

推薦されたプライマーデザインソフトウェア:

WebPrimerは手動でセットすることができる多くの条件からのプライマーの最もよいペアを選ぶ。

Primer3 Primer3のプライマーデザインソフトウェアはDNAシーケンスからのプライマーを選ぶ。 手動でセットすることができる多くの条件からの一突きのプライマー。

 

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