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Maxam Gilbertの配列

 

DNAがどのように配列されるか

Maxam-Gilbert方法を使用して配列するDNA

配列するMaxam-Gilbertは生体外のDNAを総合し、チェーンターミネータとの統合の反作用を停止するかわりに配列する実物大の、端によって分類されるDNAからDNAのこの方法とこの方法開始し、基礎特定の試薬とのそれを裂く。 従ってこの方法がグアニンベースをどのように使用するか、しかし同じ主義すべての4つのベースに適用する; 最初に私達は私達が配列したいと思うDNAのフラグメントを終り分類する。

これは-終了する分類を5 ' -または3 'のどれである場合もある。 次に、私達は1種類のベースを修正する。 ここに私達はグアニンをメチル化するのにジメチル硫酸塩(DMS)を使用する。 (実際に、この試薬はまたadeninesをメチル化するが、ない方法でそれはDNAの繊維の開裂の原因となる。) チェーン終了方法でように、私達はあらゆるグアニンに影響を与えたいと思わないまたは私達は私達がDNAのシーケンスを定めることを可能にしない小さいフラグメントだけ作り出す。 従って、私達はDNAの繊維ごとの1メチル化されたグアニンだけの平均の原因となる穏やかな条件の下でメチル化をする。 次に、私達は2つの事をする試薬(ピペリジン)を使用する: それによりメチル化されたベースの損失を引き起こす、そして無くなったベース(apurinicサイト)のサイトでDNAのバックボーンを壊す。 この場合、シーケンスの真中のGはメチル化され、従って繊維の破損はそこに発生し、分類された三量体を作り出す。

別のDNAの分子では、最初のGはメチル化でき分類された隣酸塩をもたらす(ベースおよび砂糖は化学開裂で失われる)。 最後に、electrophorese私達は鎖終了方法のように放射線写真法によって製品それらを、ちょうど検出し。 当然、私達は他の3つのベースで裂く3つの他の反作用を実行する必要がある。 これをする複数の方法がある。 例えば、私達は酸が付いているアデニンそしてグアニン両方にグリコシドの結束を弱めてもいい; それからピペリジンにより両方ようにおよびGsの後でdepurinationおよび繊維の破損を引き起こす。 electrophorese私達が比較するとようにこれGの反作用だけの側のA + Gの反作用、私達得てもいければ。 同様に、ヒドラジンはthymineおよびチトジンの両方リングを開き、ピペリジンはそしてこれらのベースを除去し、生じるapyrumidineのサイトでDNAの繊維を壊すことができる。 1M NaClの前で、ヒドラジンはチトジンだけのために特定である、従って私達はC+Tの反作用の隣でこの反作用を実行し、比較するとTSを得てもいい。

版権の分子端末2006年

 

 

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