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DNA のクローニング

DNA のクローニングフォーラムのトピック

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プラスミッドへのクローンとして作る挿入

DNA のクローニングプロトコル

クローンとして作ることを次が必要としなさい:

DNA かプラスミッドの構造物を方向を変えなさい

ベクトルDNA は次のとおりである場合もある:
(ある必要があるベクトルまたはプラスミッドのDNA

クローンとして作ることをベクトルDNA の少なくとも複数のマイクログラムが(3-5 または多く) 必要としなさい。

DNA ( あなたがプラスミッドかベクトルに挿入したいと思う) をDNA 挿入しなさい

挿入DNA は次のとおりである場合もある:
オリゴヌクレオチドの挿入(制限のoligos はPNK とアニールされ、phosphorylated 半分サイトを切った)
制限の酵素は挿入を生成した
PCR の挿入(制限の酵素とのPCR はサイトを切った(全サイトは必要! である) プライマーの’ 5 端)

あなたがクローンとして作りたいと思う挿入がより少しよりなら60 bp のオリゴヌクレオチドを発注し、一緒にアニールすることができる。

挿入DNA のサイズが小さければ(より少しにより1000 年のbp) 、ベクトル論理上同様に多くのDNA を必要としない。挿入DNA のサイズが極小(10-200 bp) なら、このDNA の少しだけ論理上必要とする。

一般に挿入DNA の開始の少なくとも1 マイクログラムを有するべきである。

クローニングのためにベクトルDNA を準備すること: 小型prep 、ミディprep 、マキシprep

私達はDNA を準備する最も容易な方法が小型prep キット使用していることが分った(Qiagen) を。私達は同じベクトルDNA の構造物のために複数のコラムを使用する。 

各コラムのために私達は約4 ML の&ンドによって育てられる細菌(私達は2 ML のeppendorf の管に2 ML の&ンドの細菌の流体&養基を追加し、= 2 つX 2 つをML = 4 ML 二度回す) を追加する

先端: グリセロールの細菌が80 C のフリーザーの凍結するに貯蔵するように常に約5 ML の15 ML の隼の管の&ンドを、保つ – 1 ML を育てなさい。

グリセロールに(幾年もの間保つ – 80 C のフリーザーのための細菌の在庫をする方法決して版を縞にするか、または有能なセルを再度作る必要がない! – 時間保存する)

細菌の成長&ンドに50% のグリセロールを単に追加しなさい。これは約1 ML の細菌の&ンドを追加し、100% 年のグリセロールの約500 のUL を80 C でフリーズすれば残されれば厳密なie – であるならない。

EB の約50 のUL の各コラムを溶離した後(溶出バッファ、Qiagen のTris バッファは – EDTA を含んでいない) 、私達は私達におよそ200 のUL から400 のUL あること溶出液をそのような物分かち合う(または構造物 – または1 ベクトルにつき4 つの8 つのコラムが) 。これは与えるクローニングのための十分な開始のベクトルDNA をある。

: 私達はTE のEDTA が小型prep 及び他のプラスミッドの浄化キットから溶離されたDNA のそれに続く制限の消化力を禁じることが分った。

クローニングのために挿入DNA を準備すること

挿入DNA はあるなる

 

制限の酵素の消化力及び切断DNA のクローニングのためのプラスミッドのベクトル

プラスミッドのベクトルは通常切られる。

 

挿入及びベクトルのLigation

挿入を方向を変えるためにLigate ようにガイドとしてベクトルの200 NG を使用しなさい(人々は50 NG N.E.B マニュアル同様に – 少しを使用する) 。

 

NG =      ベクトル       NG 挿入しなさい               
サイズのベクトル            サイズを挿入しなさい

 

従ってあなたが必要とする5000 のbp のベクトルに500 のbp の挿入をligate ため

挿入NG      =       200 NG  X   500                         
                             5000

挿入は      1      のためにNG = 挿入の20 NG 必要とした: 1 つのligation

挿入3 のため:  あなたが必要とする1 つのベクトルligation: 60 NG

指定しなさい: ベクトルサイズ: bp
指定しなさい: 挿入サイズ: bp
比率: (ベクトルDNA の1 モル毎の挿入DNA のモル)
のため ベクトルDNA のNG は、追加する 挿入DNA のNG 。

Ligation

X UL の    DNA のベクトル200 NG
Y のUL の     挿入(計算されたNG)
2 UL 10 X バッファ
1 つのUL T4 のDNA のリガーゼNEB
 20 のUL H20     に

20 のUL は   合計する

Ligation の5 つのUL を取り、DH 5 のアルファのセルInvitrogen の100 つのUL に追加しなさい
(Subcloning の効率の承諾、1 撃たれたよりよい、最大効率最もよく – 堅いligations のためにしかし高い) 。

衝撃を熱しなさい
有能なセルにSOC の250 のUL を追加しなさい

 

版の全体の量をめっきしなさい。

37 C でovernite を育てなさい

 

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