|
|
シーケンス機能検出
リンクは下記によってソートする: 衝突 & アルファベット| 絶頂- http://acmes.rnet.missouri.edu/ 絶頂(シーケンスのための高度の満足な一致エンジン)は多重種を渡る短い繰り返しを(3つそして10の000のベース間で)捜すのに使用することができるサーバーである。 ユーザーはキーワード探索によって検索の結果を限定できる。 - [より多くの絶頂読まれて] |
| AlignACE - http://arep.med.harvard.edu/mrnadata/mrnasoft.html 核酸の節約された要素を一直線に並べる; 要素を一組のDNAシーケンスで節約されて見つける使用のパターン認識; 使用許諾契約の非営利的な使用のために放しなさい。 - [より多くのAlignACE読まれて] |
| BEARR - http://giscompute.gis.a-star.edu.sg/~vega/BEARR1.0/ 抽出を区分すればシス形規定する領域(BEARR)の分析は入力およびリターンとして遺伝子識別名(RefSeqおよびUnigeneのIDのような)、一致パターンおよび(任意選択で)位置の重量のマトリックスのリストをbotsのパターンのためのマッチのリスト取る- [より多くのBEARR読まれる] |
| BioMart - http://www.ebi.ac.uk/biomart/ BioMartは大規模なデータ問い合わせを促進する対話型のデータ統合システムである。 それは社内にインストールされ、使用することができるまたはある既存のデータソースの1つと既に適用されてしまった(ie。 UniProt、Ensembl)。 - [より多くのBioMart読まれて] |
| BioProspector - http://robotics.stanford.edu/~xsliu/BioProspector/ Gibbsのサンプリング作戦を使用して規定するシーケンスモチーフのために同じ遺伝子発現クラスタの遺伝子の上流でスキャンするサーバー。 Markov背景モデルは非モチーフベースのために使用され、予測されたモチーフの位置の特定性を改善する。 - [より多くのBioProspector読まれて] |
| Consite - http://www.phylofoot.org/consite/ 系統発生のfootprintingおよび実験確認された結合のプロフィールを使用してgenomicシーケンスのトランスクリプション要因結合サイトを検出しなさい。 - [より多くのConsite読まれて] |
| クリーム- http://creme.dcode.org/ クリーム(人間のゲノムのためのシス形規定するモジュールの探検家)は可能性としてはco表現されるか、またはco調整されるある特定の一組の遺伝子のためのシス形規定するモジュールを識別し、視覚化するためのツールである。 それは入力として受入番号のリストを、再取り[より多くのクリーム読まれて] |
| eBioinformatics - http://www.ebioinformatics.org/ このサイトはMacOSXのコンピュータで一緒に包まれる容易なインストールのための複数の生物情報学のソフトウエアツールを提供する。 ソフトウェアはNCBIのツールを含んでいたり、ClustalW、Staden、TコーヒーおよびPrimer3浮彫りになる。 - [より多くのeBioinformatics読まれて] |
| - http://cbrmain.cbr.nrc.ca/EMBOSS/を浮彫りにしなさい シーケンス分析のためのツールの多様な組; GCGに類似した多くのプログラム; 各ツールのための状況依存のヘルプ。 - [多くは読まれる浮彫りにしなさい] |
| Eponine - http://www.sanger.ac.uk/Users/td2/eponine/ Eponineはよい特定性および優秀な定位置正確さの哺乳類のgenomicシーケンスのトランスクリプション開始のサイト(TSS)を、検出するための確率的な方法である。 - [より多くのEponine読まれて] |
| ファン- http://bioinf.man.ac.uk/cgi-bin/neil/ntfront.pl ファン(ヌクレオチドシーケンスの指紋の分析)はプリントデータベース、uncharacterisedシーケンスを知られていたグループに割り当て、それ故に一時的な機能を推論するのに使用される蛋白質の指紋のコレクションに対してヌクレオチドシーケンスを検索する。 - [より多くのファン読まれて] |
| FirstEF - http://rulai.cshl.org/tools/FirstEF/ 最初Exonのファインダー(FirstEF)は5 'ターミナルexonおよび促進者の予言プログラムである。 それは決定ツリーとして構成される異なった識別関数から成っている。 - [より多くのFirstEF読まれて] |
| 収穫機- http://harvester.embl.de/ 収穫機は人間蛋白質に公共のbioinformaticデータベースおよびサーバーに高速アクセスを提供する。 結果は次のデータベースまたはサーバーからのキャッシュ、架橋結合された出力を含んでいる単一のHTMLページとして戻る: Uniprot/SWISSprotのensEMBL、- [より多くの収穫機読まれる] |
| IslandPath - http://www.pathogenomics.sfu.ca/islandpath/ IslandPath prokaryoticゲノムのseqeuncesのgenomic島の検出を、tRNAの遺伝子のG+C、位置、移動性の遺伝子の注釈、等Genomicの島は潜在的なhorizontaのgenomic領域とジヌクレオチドバイアスのような機能を使用してここに定義される助ける- [より多くのIslandPath読まれて] |
| JASPAR - http://jaspar.cgb.ki.se/cgi-bin/jaspar_db.pl JASPARはトランスクリプション要因結合のプロフィールの非冗長な、curatedコレクションである。 各プロフィールは出版された、実験的に定義されたeukaryoticトランスクリプション要因結合サイトから生成される。 - [より多くのJASPAR読まれて] |
| LowComplexity - http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/programs/low_complexity/ LowComplexityはDNAまたは蛋白質シーケンスの低い複雑さ領域を捜すツールである。 LowComplexityを使用して長いシーケンス(染色体、ゲノム)または一組の一直線に並べられたシーケンスを検索できる。 このリソースはまた他のアルゴリズムfにリンクを含んでいる- [より多くのLowComplexity読まれて] |
| MartView - http://www.ensembl.org/Multi/martview Ensembl EnsMartのゲノムのブラウザ(MartView)はEnsemblからのデータを統合するデータ収集およびデータマイニングのためのツールである。 網インターフェイスを通してMartViewはsに変換することができるカスタムデータ・セットを作成するために一連のフィルターを加えることを可能にする- [より多くのMartView読まれて] |
| MaskerAid - http://blast.wustl.edu/maskeraid/ MaskerAidはについて30折る感度を維持している間RepeatMaskerの速度の増加をもたらすことができるRepeatMaskerへ機能拡張である。 - [より多くのMaskerAid読まれて] |
| MatInspector - http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html#matinspector TRANSFACのマトリックスを使用してあなた自身のシーケンスの潜在的なトランスクリプション要因結合サイトの検索; 非営利的な使用のために放しなさい。 - [より多くのMatInspector読まれて] |
| McPromoter - http://genes.mit.edu/McPromoter.html eukaryotic DNAのトランスクリプション開始のサイトを予測するマルコフ連鎖の促進者の予言サーバー(McPromoter)使用の統計量。 - [より多くのMcPromoter読まれる] |
| MDscan - http://robotics.stanford.edu/~xsliu/MDscan/ サーバーは水平な基礎ペアで蛋白質DNA相互作用のサイトを正確に示すように設計した。 使用はこれらの相互作用のサイトを表すモチーフを捜すためにアップデートするデータ、ワード等置および位置特定の重量のマトリックスをチップ配列する。 - [より多くのMDscan読まれて] |
| MEME - http://meme.sdsc.edu/meme/website/meme.html 一組のその中の類似のためのDNAまたは蛋白質シーケンスを分析し、検出する各パターンのための記述(モチーフ)を作り出す。 - [より多くのMEME読まれて] |
| メタMEME - http://metameme.sdsc.edu/ MEMEの出力からのモチーフの隠されたMarkovモデルを作成し、マッチをこのモチーフにシーケンスデータベースを捜す。 - [より多くのメタMEME読まれて] |
  | |
友人にこのページを送りなさい