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遺伝子の予言のツール、予測の遺伝子ソフトウェアおよびオンライン生物情報学。
| 議題- http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/agenda/ 議題は遺伝子の予言をするためにevolutionarily関連の有機体からのgenomicシーケンスを比較する網のツールである。 それは入力としてgenomicシーケンスのペアを取り、シーケンスを一直線に並べ、そしてスプライスのシグナル、開始に基づいて予言をおよびする- [より多くの議題読まれて] |
| AUGUSTUS - http://augustus.gobics.de/submission AUGUSTUSは正確な方法を用いるintronの長さの分布を模倣するためのeukaryotic遺伝子の予言のツールである。 それはより大きいシーケンスと特に有効である。 それは網インターフェイスを通して、局部的に動作する動作しか、またはダウンロードしことができる。 - [より多くのAUGUSTUS読まれて] |
| 送風- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ 基本的なローカルアラインメントの検索のツール; 問い合わせと同じようなシーケンスを検索しなさい。 - [より多くの送風読まれて] |
| GeneComber - http://bioinformatics.ubc.ca/genecomber/index.php GeneComberはUBCの生物情報学の中心で発達するabのinitioの遺伝子の予言のツールである。 それはこれら二つの遺伝子の発見者が予言に同意すれば2つの外部に開発された遺伝子のファインダーからの結果を統合し、私達より多くのcである場合もある前提を作動させる- [より多くのGeneComber読まれて] |
| GeneMark - http://opal.biology.gatech.edu/GeneMark/ プログラムのGeneMarkの系列はMarkovモデルを用い、prokaryotes、ウイルスのゲノムおよびeukaryotesからのシーケンスの遺伝子の予言のためにとりわけ調整される。 - [より多くのGeneMark読まれて] |
| GenomeScan - http://genes.mit.edu/genomescan.html 遺伝子を予測するとき蛋白質の類似情報を組み込む; GENSCANに一部には基づく。 - [より多くのGenomeScan読まれて] |
| GENSCAN - http://genes.mit.edu/GENSCAN.html genomic DNAの完全な遺伝子の構造の識別。 - [より多くのGENSCAN読まれる] |
| 微光- http://www.tigr.org/softlab/glimmer/glimmer.html 遺伝子のロケータおよび挿入されたMarkov Modeler; ツールを見つけるこのprokaryote遺伝子はTIGRで使用される一次微生物遺伝子のファインダーである; 非営利的な使用のための登録と(を含む原始コード)放しなさい。 - [多くを読まれて微光] |
| 杯- http://compbio.ornl.gov/Grail-1.3/ 杯は促進者、exonの候補者、簡単な繰り返しおよび複雑で反復的な要素のようなシーケンス機能を認識するツールの組である。 それはまたexonの候補者に基づいて遺伝子を模倣する。 - [より多くの杯読まれて] |
| HMMgene - http://genome.cbs.dtu.dk/services/HMMgene/ 脊椎動物およびC.のelegansの遺伝子の予言。 - [より多くのHMMgene読まれる] |
| IBMの生物情報学およびパターン発見のグループ- http://cbcsrv.watson.ibm.com/Tspd.html テキストのと同様、DNAおよび蛋白質の順にパターン発見のためのツールの広い範囲を所有している広範なサーバー。 多重シーケンスアラインメント、遺伝子の発見、蛋白質の注釈および他のアプリケーションのためのツールはまたこのサーバーにある。 細部- [より多くのIBMの生物情報学およびパターン発見の読まれてグループ] |
| ORFのファインダー- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html シーケンスのすべてに開いたリーディング・フレームを見つける。 - [より多くのORFのファインダー読まれて] |
| TIGRのソフトウエアツール- http://www.tigr.org/software/ Genomicの研究(TIGR)のための協会からの自由のために使用できる開ソースソフトウエアパッケージのリスト。 - [より多くのTIGRのソフトウエアツール読まれる] |
| Twinscan - http://genes.cs.wustl.edu/ Twinscanはeukaryotic genomicシーケンスの予測の遺伝子構造のためのシステムである。 予測されたコーディング領域およびスプライスから予言を、Twinscanのコンバインはターゲットse間のconserservationの測定と情報するためには土地を選定する- [より多くのTwinscan読まれて] |
| ウーの送風- http://blast.wustl.edu/ ワシントン州大学基本的なローカルアラインメントの検索のツール- [ウーのより多くの送風読まれる] |
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