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Previsione Della Struttura Della Proteina

Gli strumenti di Bioinformatic possono predire la struttura della proteina in 2-dimensions (2-D) o nelle tre-dimensioni (3-D). Ciò non può essere una rappresentazione reale della struttura reale di una proteina, comunque è un buon punto di partenza per predire le tasche enzimatiche e dei settori di interazione della proteina-proteina. Dopo la previsione, la conferma della struttura della proteina può essere fatta usando le tecniche di cristallografia dei raggi X.

I programmi di Bioinformatic hanno usato predire la struttura secondaria:

(veda per favore la nostra proteina strutturare la base di dati degli strumenti di Bioinformatic di previsione per la 2-D previsione;

e la previsione Bioinformatic della struttura della proteina lavora la base di dati per la previsione 3-D.; e la nostra base di dati per il richiamo dei dati della struttura della proteina dalle basi di dati 3-Dimensional.

I dati sperimentali possono essere usati per aiutare in struttura della proteina di previsione. Il seguenti sono esperimenti che possono aiutare nell'analisi della struttura della proteina:

- localizzazione dei legami bisolfurico (fornisca i fermi stretti sulla posizione delle cisteine nello spazio)

- dati di spettroscopia che possono dare gli indizii alla composizione secondaria della struttura della vostra proteina di interesse

- gli esperimenti di mutagenesi diretti luogo, (sostituenti alanina un ala per vari amminoacidi ed allora controllanti funzione della proteina) che può danno la comprensione importante ai residui che sono importanti nel luogo attivo di un enzima o dei luoghi obbligatori d'interazione o dei settori della proteina-proteina.

- ottenga i dati sperimentali dei modifictions alberino-post-translational (i luoghi di glycosylation e per esempio di fosforilazione possono suggerire i residui che devono essere esternamente accessibili e così possono essere residui di superficie)

- luoghi proteolitici di fenditura.

Tenendo questi dati presente quando condurre la previsione della struttura della proteina è importante, come questo è dati strutturali che sono stati experimentally.0 provati

Domanda se le previsioni della struttura accosentono con i risultati sperimentali. Ciò può verificare la validità delle strutture previste della proteina.