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bioinformatics di analisi di mutational della proteina

Bioinformatics, Protocolli, Proteina Proteomics del RNA del DNA

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Analisi Bioinformatics Di Mutational Della Proteina.

Gli strumenti di Bioinformatic possono predire la struttura della proteina in 2-dimensions (2-D) o nelle tre-dimensioni (3-D). Ciò non può essere una rappresentazione reale della struttura reale di una proteina, comunque è un buon punto di partenza per predire le tasche enzimatiche e dei settori di interazione della proteina-proteina. Dopo la previsione, la conferma della struttura della proteina può essere fatta usando le tecniche di cristallografia dei raggi X.

Programmi di Bioinformatic usati alle mutazioni della proteina:

Analisi correlata di mutazioni della proteina delle mutazioni correlate

MutaProt: Confronto degli archivi di PDB che differiscono da dalle mutazioni del punto

 

Basi di dati per le mutazioni della proteina - usi questo la base di dati per cercare le mutazioni conosciute della proteina:

PMD: Base di dati Del Mutante Della Proteina

PMR: Risorse Del Mutante Della Proteina

HGVS: Società Umana Di Variazione Del Genome

Singoli polimorfismi del nucleotide per ricerca biomedica: Consorzio di SNP

Singola Ricerca Di Nome Del Testo Di Entrez Pubmed Di Polimorfismi Del Nucleotide

 

Gli strumenti di Bioinformatic possono predire l'effetto delle mutazioni sulla funzione secondaria della proteina e della struttura. Potete confrontare i risultati del selvaggio-tipo proteina alla proteina del mutante ed esaminare gli effetti possibili previsti della mutazione.

Ancora, i dati sperimentali sono necessari confermare tutta la previsione bioinformatic dei mutanti della proteina. Ciò può essere fatta esaminando i residui chiave nella funzione della proteina o i settori di interazione della proteina usando la sostituzione del ala (alanina) ed analizzare i dati sperimentali che risultano.

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