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Applicazioni di proteina Microarrays

Proteina ed anticorpo Microarrays

Applicazioni Del Circuito integrato Della Proteina

Applicazioni dei circuiti integrati della proteina
1) Proteomics
            Le tecnologie del circuito integrato della proteina forniranno un potente, alto-rendimento e lo strumento versatile per genome-regola l'analisi della funzione del gene (si veda figura 4).  L'attività dell'enzima, le interazioni–della proteina della proteina e–dell'nucleico-acido della proteina e le interazioni della droga della piccolo-molecola possono tutti essere analizzate direttamente al livello della proteina (77.78).  Gli allineamenti possono essere costruiti per richiamare l'identificazione della proteina, la quantificazione e gli studi di affinità.  Un allineamento di delineamento può quantificare i livelli delle proteine specifiche su una scala globale tenendo conto un confronto del normale e la malattia dichiara.  Un allineamento di affinità può analizzare le interazioni dei peptidi, proteine, oligonucleotides, gli zuccheri, lipidi, o piccoli molecole e prodotti chimici con le proteine immobilizzate quali i ricevitori, gli enzimi, o gli anticorpi (8). 
            Attualmente, il punto tasso-di limitazione è la produzione di tantissime proteine. La capacità di automatizzare la produzione e le proteine della proteina fuse alle modifiche di alto-affinità notevolmente accellererà lo sviluppo del proteina-circuito integrato.  I circuiti integrati ad alta densità che contengono i grandi insiemi delle proteine o persino di interi proteomes permetteranno l'analisi di alto-rendimento delle attività biochimiche, delle interazioni–della proteina della proteina e delle modifiche alberino-post-translational, quali fosforilazione, la defosforilazione, la metilazione della proteina ed il ubiquitination.

            L'ultimo obiettivo del proteomics è alle attività biochimiche di studio di ogni proteina messa da un organismo o da un proteome.  Gli studi del limite intrapresi hanno preparato il primo circuito integrato del proteome clonando ~94% (> 5800 di 6200) dei telai aperti della lettura del lievito in un vettore di espressione del lievito che ha espresso le proteine come il N-terminale il GST-Suo x6 raddoppia le fusioni etichettate.  Un metodo di purificazione della proteina del lievito di alto-rendimento è stato messo a punto per purificare individualmente le proteine. 80% delle proteine del lievito erano lunghezza completa e della quantità sufficiente da essere rilevabile dalla maggior parte dei tipi di analisi. Le proteine allora sono state purificate usando le modifiche di GST ed allora sono state fissate alle lastre di vetro Ni-NTA-rivestite usando le modifiche HisX6.  Oltre che identificare le interazioni conosciute, 33 proteine obbligatorie del romanzo sono state rilevate.  150 proteine lipido-legantesi del romanzo egualmente sono state identificate.  Questo studio ha dimostrato che un intero proteome può essere immobilizzato su una superficie di vetro direttamente per selezionare per le interazioni con le proteine e le piccole molecole (26).
            L'accoppiamento dei circuiti integrati della proteina e di massa-spettrometria avrà applicazioni larghe nell'identificare i giocatori nelle interazioni–della proteina della proteina ed anche nella scoperta della droga (80).  Le proteine ed i ligands della piccolo-molecola limitano alle proteine immobilizzate sul circuito integrato possono essere identificati usando il tempo tabella-aiutato del laser desorption/ionisation della spettroscopia totale di volo (MADLI-TOF).  I formati di Microwell sono adatti specialmente a questo fine. Quindi, le molecole e le proteine che specificamente si legano a molte proteine differenti possono essere identificate e queste informazioni possono essere usate per dedurre le reti e le vie molecolari.
            Una zona che richiederà i miglioramenti tecnologici è l'analisi delle proteine della membrana.  Una grande quantità di proteine è probabile essere membrana-limita, poiché altretanto poichè un terzo di tutte le proteine del lievito è proteine della membrana o proteine secernute (81). Dato che molte di queste proteine sono attive quando in membrane, quindi può essere necessario da purificarle o ricostituire con i lipidi collegati. Tuttavia, questo non può essere così difficile. Un gruppo poteva immobilizzare biotinylated le membrane che contengono il rhodopsin G-proteina-accoppiato del ricevitore su una superficie di vetro oro-rivestita e stabilisce un'analisi funzionale per quella proteina (82).  Le procedure simili possono permettere di analizzare le proteine della membrana in un formato del circuito integrato.
2) sistema diagnostico
Un'altra zona che trarrà beneficio dalle zone della proteina è sistema diagnostico. L'analisi altamente parallela sugli allineamenti permetterà la determinazione degli indicatori di malattia (per esempio indicatori del tumore) in estratti con soltanto un minimo del materiale di biopsia (campione), creante le nuove possibilità per il controllo il trattamento di malattia (cancro) e della terapia (83).

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Riferimenti per proteina e l'anticorpo Microarrays

Di nuovo a:

Introduzione e priorità bassa ai circuiti integrati della proteina ed ai circuiti integrati dell'anticorpo.

Tipi di circuiti integrati della proteina e dell'anticorpo