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Limitazioni Di Microarray Dell'Anticorpo

Proteina ed anticorpo Microarrays

Problemi e soluzioni possibili per l'anticorpo Microarrays

Disponibilità degli anticorpi
            Un'altra sfida agli allineamenti dell'anticorpo deve ottenere gli anticorpi contro ≥ le 100.000 proteine che contengono il proteome umano.  Ci è attualmente una frazione molto piccola degli anticorpi disponibili del proteome.  In più, la specificità di molti di questi anticorpi è documentata male e gli anticorpi supplementari possono essere richiesti a
consenta la rilevazione delle modifiche alberino-post-translational.  La rilevazione delle proteine dalle interazioni–dell'antigene dell'anticorpo egualmente è caratterizzata da una vasta gamma di specificità e di affinità.  Inoltre, è difficile da ottenere un grande insieme dell'anticorpo altamente specifico
molecole. Di conseguenza, la maggior parte dei allineamenti dell'anticorpo sono limitati nel loro uso e contengono alcuni agenti ben definiti di bloccaggio diretti ad un codice categoria particolare degli indicatori della proteina (9.17) 
- non comportarsi glycosylation simile

Altri problemi che affrontano anticorpo Microarrays e le soluzioni possibili
Le strategie classiche della generazione dell'anticorpo tramite immunizzazione animale sembrano essere poco pratiche. Le librerie recombinant della visualizzazione dell'anticorpo sono più promising (59-61). Recentemente, molti metodi recombinant di generazione degli anticorpi sono stati studiati.
Questi includono dei fagi anticorpo-visualizzano, visualizzazione del ribosoma, SELEX (sviluppo sistematico dei ligands da arricchimento esponenziale), visualizzazione di mRNA e visualizzazione affibody, che sono state sviluppate per avanzare la produzione degli anticorpi e/o dei mimi dell'anticorpo (16.54.56.62).  Questi metodi tutti coinvolgono la costruzione di grandi repertori delle regioni possibili con attività obbligatoria potenziale, che allora sono selezionate dai tondi multipli delle purificazioni di affinità. Il candidato clona può più ulteriormente essere selezionato usando la selezione di maturazione che migliora le affinità obbligatorie.  Tuttavia, un sistema ideale di selezione, che è basso costo veloce, robusto, sensibile, automatizzato e minimizzato, deve ancora completamente essere diventato (16.54).  Questi più piccoli frammenti dell'anticorpo hanno fatto diminuire solitamente la reattività crociata e le proprietà simili sul collegamento (7.8.9.27).
L'inoltre perché gli anticorpi recombinant hanno un'affinità potenzialmente alta, alta specificità ed il loro più piccolo peso molecolare, che è solitamente kDa circa 30 mentre gli anticorpi non-non-recombinant sono kDa circa 150, collegamento denso ed orientato alle superfici di sostegno è facilitato (63.64).
            Gli anticorpi non sono le uniche molecole che possano legare le proteine.  Aptamers è oligonucleotids corti che possono legare ed unire con legami atomici incrociati le proteine covalenti dell'obiettivo.  Ciò facilita
più alti stati della lavata di rigore che promuove la rilevazione del grippaggio specifico.  Ancora, queste molecole facilmente sono selezionate, allineate e sono sintetizzate.  L'obiettivo purificato della proteina è un requisito del loro uso tuttavia ed i aptamers possono esibire il grippaggio polarizzato mentre RNAs tende ad essere caricato altamente negativamente (9). Un gruppo (Somalogic) recentemente ha usato il aptamer anti-umano immobilizzato di immunodeficiency virus-gp120 per rilevare le concentrazioni subnanomolar della proteina dell'obiettivo in siero umano di 5% (65). 

Dopo: Metodi ed analisi di rilevazione di Microarray della proteina

Riferimenti per proteina e l'anticorpo Microarrays

Di nuovo a:

Introduzione e priorità bassa ai circuiti integrati della proteina ed ai circuiti integrati dell'anticorpo.

Tipi di circuiti integrati della proteina e dell'anticorpo