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Limitazioni di Microarray dell'anticorpo

Microarrays dell'anticorpo e della proteina

Problemi e soluzioni possibili per i Microarrays dell'anticorpo

Disponibilità degli anticorpi
            Un'altra sfida alle schiere dell'anticorpo è di ottenere gli anticorpi contro le proteine del ≥ 100.000 che contengono il proteome umano.  Ci è corrente una frazione molto piccola degli anticorpi disponibili del proteome.  In più, la specificità di molti di questi anticorpi è documentata male e gli anticorpi supplementari possono essere richiesti a
consenta la rilevazione delle modifiche alberino-di traduzione.  La rilevazione delle proteine dalle interazioni dell'anticorpo-antigene egualmente è caratterizzata da un vasto intervallo della specificità e dell'affinità.  Inoltre, è difficile da ottenere un grande insieme dell'anticorpo altamente specifico
molecole. Di conseguenza, la maggior parte delle schiere dell'anticorpo sono limitate nel loro uso e contengono alcuni agenti ben definiti di bloccaggio diretti ad un codice categoria particolare degli indicatori della proteina (9.17) 
- non comportarsi simile glycosylation

Altri problemi che affrontano i Microarrays dell'anticorpo e le soluzioni possibili
Le strategie classiche della generazione dell'anticorpo tramite immunizzazione animale sembrano essere poco pratiche. Le librerie Recombinant della visualizzazione dell'anticorpo sono più promessa (59-61). Recentemente, molti metodi recombinant di generazione degli anticorpi sono stati studiati.
Questi includono dei fagi anticorpo-video, visualizzazione del ribosoma, SELEX (sviluppo sistematico dei ligands da arricchimento esponenziale), visualizzazione del mRNA e visualizzazione affibody, che sono state sviluppate per avanzare la produzione degli anticorpi e/o dei mimi dell'anticorpo (16.54.56.62).  Questi metodi tutti coinvolgono la costruzione di grandi repertori delle regioni possibili con attività obbligatoria potenziale, che allora sono selezionate dai tondi multipli delle purificazioni di affinità. I cloni del candidato possono più ulteriormente essere selezionati usando la selezione di maturazione che migliora le affinità obbligatorie.  Tuttavia, un sistema ideale di selezione, che è basso costo veloce, robusto, sensibile, automatizzato e minimizzato, è ancora di essere a sviluppo completo (16.54).  Questi più piccoli frammenti dell'anticorpo hanno fatto diminuire solitamente la reattività crociata e le simili proprietà sul collegamento (7.8.9.27).
L'inoltre perché gli anticorpi recombinant hanno un'affinità potenzialmente alta, alta specificità ed il loro più piccolo peso molecolare, che è solitamente kDa circa 30 mentre gli anticorpi non-recombinant sono kDa circa 150, collegamento denso ed orientato alle superfici di sostegno è facilitato (63.64).
            Gli anticorpi non sono le uniche molecole che possano legare le proteine.  Aptamers è brevi oligonucleotids che possono legare ed unire con legami atomici incrociati le proteine covalenti dell'obiettivo.  Ciò facilita
più alti stati della lavata di rigore che promuove la rilevazione del grippaggio specifico.  Ancora, queste molecole facilmente sono selezionate, allineate e sono sintetizzate.  L'obiettivo purificato della proteina è un requisito del loro uso tuttavia e i aptamers possono esibire il grippaggio polarizzato poichè RNAs tende altamente negativamente ad essere - caricato (9). Un aptamer anti-umano immobilizzato recentemente utilizzato di immunodeficenza virus-gp120 del gruppo (Somalogic) per rilevare le concentrazioni subnanomolar di proteina dell'obiettivo in siero umano di 5% (65). 

Dopo: Metodi ed analisi di rilevazione di Microarray della proteina

Riferimenti per i Microarrays dell'anticorpo e della proteina

Di nuovo a:

Introduzione e priorità bassa ai chip della proteina ed ai chip dell'anticorpo.

Tipi di chip della proteina e dell'anticorpo

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