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Clonazione del DNA

Soggetti Della Tribuna Della Clonazione del DNA

Inserti di clonazione nei plasmidi

Protocollo Della Clonazione del DNA

Per clonarlo abbia bisogno di quanto segue:

Vector il DNA o la vostra costruzione del plasmide

Il DNA di vettore può essere:
DNA del plasmide o di vettore (che deve essere

Per clonarlo abbia bisogno almeno di parecchi microgrammi (3-5 o più) del vostro DNA di vettore.

Inserisca il DNA (DNA che desiderate inserire nel plasmide o nel vettore)

Il DNA dell'inserto può essere:
Inserto del oligonucleotide (oligos con i metà-luoghi del taglio di limitazione temprati e fosforilati con PNK)
Inserto Generato Enzima Di Limitazione
Inserto di PCR (PCR con i luoghi del taglio degli enzimi di limitazione (il luogo intero è necessario!) nell'estremità’ 5 dell'iniettore)

Se l'inserto che desiderate clonare è meno di 60 il B.P., potete ordinare i oligonucleotides e temprarli insieme.

Se il vostro formato del DNA dell'inserto è piccolo (più meno B.P. di 1000), non avete bisogno teoricamente di tan DNA quanto il vostro vettore. Se il vostro formato del DNA dell'inserto è molto piccolo (10-200 B.P.), avete bisogno teoricamente di pochissimo di questo DNA.

In generale dovreste avere almeno 1 microgrammo di iniziare il DNA dell'inserto.

Preparando il DNA di vettore per la clonazione: Mini-preparazione, Midi-preparazione, Maxi-preparazione

Abbiamo trovato che il modo più facile preparare il DNA sta usando mini-preparazione un kit (Qiagen). Usiamo parecchie colonne per la stessa costruzione del DNA di vettore. 

Per ogni colonna aggiungiamo circa 4 ml di batteri sviluppati libbra (aggiungiamo 2 ml di brodo dei batteri della libbra ad un tubo del eppendorf da 2 ml e filiamo due volte = 2 x 2 ml = 4 ml)

Punta: Sviluppi sempre circa 5 ml di libbra in tubi del falco da 15 ml, mantengono il 1 ml come i batteri del glicerolo immagazzinano frozen – nel congelatore di 80 C.

Come rendere ad un glicerolo le azione batteriche per – il congelatore di 80 C che manterrà per gli anni (voi non dovrà mai striare le piastre o fare ancora le cellule competenti! – li salva tempo)

Aggiunga semplicemente il glicerolo di 50% al vostro sviluppo batterico libbra. Ciò non deve essere IE esatto se siete lasciati con circa 1 ml di libbra batterica aggiungete circa 500 uL di glicerolo 100% e congelate – nei 80 C.

Dopo l'eluizione dell'ogni colonna con circa 50 uL dell'eb (l'amplificatore di eluizione, Qiagen, amplificatore di Tris – non contiene l'EDTA), riuniamo gli eluiti tali che abbiamo intorno 200 uL - 400 uL (o 4 – 8 colonne per la costruzione o il vettore). Ciò è dà abbastanza DNA cominciante di vettore per clonazione.

Nota: abbiamo trovato che l'EDTA in TE inibisce la digestione successiva di limitazione del DNA eluito da mini-preparazione e da altri kit di purificazione del plasmide.

Preparando il DNA dell'inserto per la clonazione

Inserisca il DNA deve essere

 

Digestione e taglio degli enzimi di limitazione il vostro vettore del plasmide per la clonazione del DNA

Il vettore del plasmide è tagliato solitamente.

 

Ligation dell'inserto e del vettore

Per legare l'inserto per vector, usi 200 NG del vettore come guida (la gente usa così piccolo quanto 50 il manuale – di NG N.E.B).

 

Inserisca NG      =       NG di vettore               
Inserisca il formato            di vettore di formato

 

Di conseguenza per legare un inserto di 500 B.P. in un vettore che di 5000 B.P. avreste bisogno di

Inserisca NG      =       200 NG  X   500                         
                             5000

Inserisca NG      =      20 NG dell'inserto state necessarie per un 1: 1 ligation

Per un inserto 3:  1 ligation che di vettore avreste bisogno di: 60 NG

Specifichi: Formato di vettore: B.P.
Specifichi: Formato dell'inserto: B.P.
Rapporto: (moli di il DNA dell'inserto per mole il DNA di vettore)
Per la NG del DNA di vettore, aggiunge NG del DNA dell'inserto.

Ligation

Vettore del DNA    di uL X 200 NG
Inserto di uL     di Y (NG calcolata)
2 amplificatore di uL 10 X
1 ligasi NEB del DNA di uL T4
 a 20 uL     H20

un totale di 20   uL

Prenda 5 uL del ligation ed aggiunga a 100 uL delle cellule Invitrogen dell'alfa del DH 5
(approvazione di risparmio di temi di Subcloning, una sparata più meglio il più bene, risparmio di temi per – i ligations duri ma costoso massimi).

Riscaldi La Scossa
Aggiunga 250 uL del SOC alle cellule competenti

 

Placchi l'INTERA quantità sulla piastra.

Sviluppi il overnite a 37 C

 

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