Espressione del gene ed analisi di Microarray

Il biNGO è uno strumento Java-basato per determinare quali categorie di Ontology del gene (VADA) sono statisticamente overrepresented in un insieme dei geni o in un subgraph di una rete biologica. - [colto più biNGO]

Un programma per la calcolazione analisi di arricchimento della serie di ingranaggi e della visualizzazione integrata dei dati del luogo obbligatorio di fattore di espressione, di annotazione e della trascrizione usando il gene Ontology. - [colto più SERRI]

La base di dati per l'annotazione, la visualizzazione e la scoperta integrata (DAVID) è uno strumento Web-basato che fornisce soluzioni integrate per l'annotazione e l'analisi di genome-regola i gruppi di dati derivati dalle tecnologie di alto-rendimento quali microarray ed il proteo - [colto più DAVID]

Utile per la ricapitolazione "del tema" biologico predominante di data lista del gene. Da una lista dei geni da microarray o da altro genome-regoli gli esperimenti, FACILITÀ può calcolare velocemente le statistiche della sopra-rappresentazione per ogni termine possibile di Ontology del gene con i Re - [colto più FACILITÀ]

il ermineJ è uno strumento per l'analisi degli insiemi del gene (utente definito o quelli definiti vicino VA termini) nei dati di espressione. Il software è destinato per essere usato dai biologhi con poca o nessuna priorità bassa di informatica. Una comando-riga interfaccia è disponibile per gli utenti che - [colto più ermineJ]

Un'applicazione XML-basata del Java è descritta che fornisce una descrizione funzione-orientata dei risultati di analisi della serie di ingranaggi dei dati microarray di gene-espressione basati sui termini e sulle associazioni di Ontology del gene. L'applicazione genera un HTML page con il listi - [colto più dati microarray di gene-espressione di Ontologizing:]